回答情况：
提问时间：
问题标签：
我正在Dendropy中做一些系统发生学:我正在尝试，按照本教程，使用一个过滤器(一个lambda函数)遍历一棵树的所有叶子。", line 1, in <module> File "build\bdist.win32\egg\dendropyFile "build\bdist.win32\egg\dendropy\dataobject\tree.py", line 2441, in <
浏览 0提问于2013-06-20得票数 0
我目前正在尝试使用python Dendropy库，并在我的代码中包含一些PAUP命令。 [16 17 15 18 0 5]我尝试使用：A=numpy.matrix(A)将numpy数组转换为numpy矩阵
tree =
浏览 3提问于2012-11-14得票数 0
我希望通过向DendroPy中已经存在的树动态添加节点来创建树。所以我是这样进行的，现在，这创建了一个小树，其中两个子树具有Taxon>>> n = dendropy.Node(taxon='5',label='5') 但是，即使在我在
浏览 7修改于2014-11-12得票数 0
回答已采纳
17 16] [ 8 6 9 0 18 16] [17 16 13 16 5 0]]
tree = paup.estimate_tree
浏览 2修改于2012-11-14得票数 0
回答已采纳
我正在使用Python (Bio.Phylo和DendroPy)来研究系统发育。我尝试过来自add_child和new_child的DendroPy方法，但都没有成功。
我该如何解决这个问题呢？
浏览 2修改于2015-10-10得票数 2
我以前已经将这些树写成newick格式，然后使用另一个脚本，连同Dendropy包，来读取这些树并对它们进行一些分析。这两个脚本都运行良好。这两个方法都称为Tree，所以我通过导入树状方法来解决这个问题，比如：ete3方法如下：treePass = t.write(format = 1)
浏览 3修改于2016-09-11得票数 2
回答已采纳
我对DendroPy非常陌生。我想要做的事情似乎很简单，但我不知道如何正确地做，我没有在互联网上找到任何东西。 "(((sp1: 0.35, sp2: 0.15):0.75
浏览 6修改于2022-09-19得票数 1
到目前为止，我的代码如下所示：tree = dendropy.Tree.get(path="gonno_microreact_tree.nwk
浏览 5提问于2017-03-28得票数 0
回答已采纳
我用树状方法创建了一个互生距离矩阵：tree = treesim.birth_death_tree(birth_rate=1.0
浏览 2提问于2018-11-28得票数 0
回答已采纳
UnsatisfiableError: The following specifications were found to be in conflict: - python
浏览 20修改于2017-01-14得票数 5
回答已采纳
为此，我需要访问一个python库(dendropy)和一个java库(owlapi 5.1)。我转到Jython并成功地实现了所需的功能(使用Eclipse和PyDev)。
浏览 0提问于2018-11-12得票数 0
generate_candidate_discrete_matrix(num_cols, num_samples, sample_tree, bits, usable_cols):
assert isinstance(sample_tree, dendropy.Tree
浏览 2修改于2012-08-10得票数 2
local/lib/python2.7/dist-packages/anyjson-0.3.1-py2.7.egg',
'/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/DendroPy
浏览 2修改于2012-01-23得票数 1
回答已采纳
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号