Dendropy中间流行模块python

Question

我目前正在尝试使用python库，并在代码中包含一些PAUP命令。

我正在使用python库中提到的教程，但是它给了我一个错误。

所以我要做的是从距离矩阵中估计出一棵树：

距离矩阵A (Numpy阵列)

[[ 0  2  7  8 16 17]
 [ 2  0  5  6 17 16]
 [ 7  5  0  9 15 13]
 [ 8  6  9  0 18 16]
 [16 17 15 18  0  5]
 [17 16 13 16  5  0]]

import dendropy
from dendropy.interpop import paup     

#A is a distance matrix like this    

tree = paup.estimate_tree(A, 'nj')

我得到的错误是：ImportError: No module named interpop

我已经在我的机器上安装了PAUP，本教程不讨论安装任何其他模块。

任何帮助都将不胜感激。

编辑使用NUMPY数组吗?？因为它似乎给numpy数组带来了一个错误。如何解决这个问题？

Answer 1

尝试使用from dendropy.interop import paup (减去interpop中的p )。我错误地输入了这个答案两次，所以如果这是错误的原因，那么它是可以理解的:)