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# for shiny apps#library(spData) # loads the world datasetinteractive mapsCANCER_raw <- st_read("F:/appR-upload/cancer_sample_data.csv") TotalRate =
浏览 2提问于2019-02-12得票数 1
xml-stylesheet type="text/xsl" href="/cisapi_static/dataset2.xsl" ?</authors> <url>ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/sra/sra-instant&#
浏览 4修改于2012-11-19得票数 0
@"E:\SARDATA\SampleData\TerraSar-X\SO_000009564_0002_1\SO_000009564_0002_1\TSX1_SAR__SSC______HS_S_SRA_20090223T204240_20090223T204241\TSX1_SAR__SSC______HS_S_SRA_20090223T204240_20090223T204241.xml";Gdal.AllRegister();
Dataset dataset = Gdal.Ope
浏览 6修改于2013-03-21得票数 1
2回答
我在dataset中有一组值，这些值都是由2000-3222和10/1-10组成的。示例数据：69 "Khimji Nagar SRA Co-op.Housing(Proposed)" "7 (Pt.)" ""
71 "Shivshakti <
浏览 2修改于2022-07-01得票数 0
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问题：SRA1202321.sraSRA1209312.sraSRA1202321.sraSRA1209312.srarandom.sra
我希望将所有文件从.txt移到一个不同的目录，并留下我不想要的文
浏览 1修改于2022-05-18得票数 2
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如果它们有不同的组，那么我需要显示A项的结果和A以外的结果 FROM StudentRegsra(SELECT sra1.studentid,sra1.StudentName,sra1.Term,sra1.Group
FROM StudentRegsra</em
浏览 2提问于2014-03-25得票数 0
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我的目标是让函数SRA_Accession以字符串e.g "Value1,Value2,Value3"的形式返回它的值，到目前为止，代码是SRA=1293518while (SRA < 1293618): print "SRA"+str(SRA) break
浏览 13提问于2017-02-24得票数 2
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$cat config.file
ref=L41223.2
SRA=SRA7361534
path_SRA='/Volumes/5TB/sra/'
path_ref='/Volumes/5TB/results/spec
浏览 0修改于2018-06-26得票数 3
1.SRA-D12-TY2-2017WW22.4.1293.SRA-D12-TY2-2017WW16.5.926.SRA-D12-TY2-2017WW29.5.1888.SRA-D12-TY2,new_data)
浏览 0修改于2018-03-14得票数 2
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我有一些文件如下：SRR797101.sraSRR797103.sraSRR797105.sraSRR797190.sra
现在，我只想用一个命令删除SRR797101.sra和SRR797150.sra之间的文件。所有文件都在一个目录中，因为有许多文件名，所以我将SRR797106.
浏览 0修改于2019-04-06得票数 -1
", f"{BASE}/fastq/SRR000001.sra_2.fastq"] "echo Finished"
input: ancient("config/config.yaml") shell:
浏览 1修改于2020-09-04得票数 1
我已经定义了这个小黄瓜文件sra-to-isatab-batch-conversion.feature# performa batch conversion of a set of SRA datasets, retrieved from the European Nucleotide Archive
# to ISA-tabScenario: Batch conversion form a list of SRA accession nu
浏览 1修改于2016-02-10得票数 1
我知道这个问题已经被问过很多次了，但是我对使用命令行非常陌生，我不能理解它，我有多个文件的名字都是这样的SRR10984540_dbGaP-26719.sra我想将它们重命名如下SRR10984540.sra非常感谢你的帮助
浏览 0提问于2021-03-05得票数 0
["SRR12845350"] input: output: params: script:
"scripts/prefetch.py" prefetch.py是： fromimport
浏览 29提问于2020-11-05得票数 0
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main_url <- "http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByStudy/sra/SRP/SRP038/SRP038101/"
urls <- paste(main_url,c("SRR1171523/SRR1171523.sra","SRR1171524/
浏览 2修改于2015-03-13得票数 0
sra[32'h00000002]=32'h34100020; sra[32'h00000004]=32'h00108105; sra[32'h00000006]=32'h00108147;
sra[32'h000
浏览 0修改于2014-06-09得票数 0
我有以下文件： RBFOX2-human_SRA:SRR4421654_1_ENCFF187PBG.fastq.gzU2AF2-human_SRA:SRR3469570_1_ENCFF158ZML.fastq.gz我想把它们重新命名为：
浏览 2提问于2017-10-11得票数 1
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我从NCBI下载了一系列属于一个样本的.sra。我尝试将一个sra更改为fastq，但这是错误的。我使用$fastq-dump SRR5XXXXX.sra更改了另一个进程，它工作得很好。
因此，我想知道如何将多个.sra制作成一个.fastq文档？谢谢你的好意。
浏览 1提问于2017-10-26得票数 0
AEPNAATNYATEAMDSLKTQAIDLISQTWPVVTTVVVAGLVIRL...SKA COATB_BPIKE/30-81FAADDATSQAKAAFDSLTAQATEMSGYAWALVVLVVGATVGIKL...SRACOATB_BPIF1/22-73data = Align.read
浏览 5修改于2016-10-10得票数 1
1回答
我正在尝试访问NCBI SRA数据库，查询ID列表并将输出保存到矩阵中。bioconductor.org/biocLite.R")library(SRAdb)
sqlfile <- getSRAdbFile()
sra_tables
浏览 1修改于2016-11-10得票数 1
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