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我在第9行得到错误"list assignment index out of range“，我必须获取具有最大gc含量的键，并将gc内容值与键一起打印出来。
浏览 6提问于2015-02-24得票数 0
我想要的垃圾桶基于GC内容的每一个阅读。结果输出将是8个多fasta文件：GC含量21-30%GC含量41-50%GC含量61-70%80% GC含量如果没有，有人可以建议如何根据GC</
浏览 1修改于2010-12-15得票数 3
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AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGA\n', ''),}我编写了以下代码(函数在类下)，但它提供了错误消息。如果有人
浏览 0修改于2014-02-12得票数 0
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为了计算每个序列的GC含量，我执行了以下操作但我得到了以下错误：你能建议一个修正或更好的方法来计算熊猫数据框架中的GC含量吗？
浏览 3修改于2015-04-27得票数 1
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我想从50k+基因中获得一个包含该基因、该基因的GC含量和基因长度的表。
我听说我可以从UCSC基因组浏览器上得到这个，但我不知道如何...非常感谢您的帮助！
浏览 1提问于2014-06-24得票数 0
含量、平均序列长度等。我很感谢任何人谁可以改进我的代码，特别是如何获得每个ID的gc内容。(self,some_id): return gc
def sequence_statistics**&quo
浏览 2修改于2014-02-12得票数 0
我偶然看到一篇BMC基因组学论文：原核生物基因组内GC含量同源性分析 gc[s] = gc.get(s, 0.0) + gc_content(s)
def difference_gc差分函数(滑动窗口gc内容- gc内容全序列)，其中ec_gc = e.co
浏览 0修改于2021-11-08得票数 4
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下面是我的Rosalind问题的代码，用于计算GC含量，而不使用Biopython。有没有人能给我一些改进的建议？例如，我不能将seq_list中的最后一个序列包含在For循环中，因此必须再追加一次。另外，有没有更好的方法来配对seq_name和GC内容，这样我就可以轻松地打印出GC含量最高的序列名？非常感谢s=open('5_GC_content.txt','r').r
浏览 0提问于2015-01-08得票数 0
尝试计算具有固定gc含量( 10%，20%，30%，…)的随机RNA序列的平均转录长度。，90%) rna = 'AUG' while rna[-3:] not in stop_codon: rna += random.choice(('
浏览 2提问于2017-11-06得票数 0
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我正在尝试计算Rosalind问题的DNA序列的GC含量(以%为单位)。我有以下代码，但它返回0，或者只返回G或C的个数(没有百分比)。total = len(x)g = x.count("G")
gc_content = gc_total/totalprint gc_cont
浏览 6修改于2013-06-04得票数 2
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我知道这可能真的很简单，但我只需要在这段代码中添加一些东西来计算DNA序列中GC含量的百分比。添加这个的最简单方法是什么？#individual base composition (the percent of each kind of base), and GC
浏览 0提问于2015-04-10得票数 1
我在Rosalind上遇到了一个问题，它涉及输出具有最高GC含量百分比和百分比的字符串的ID，我遇到了一个问题。我能够输出样本数据ID +百分比，但我不知道如何找到最高值。file = open(input, "r")at = 0 if line.startswith(">&quo
浏览 1提问于2019-09-10得票数 1
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我正在尝试编写一个函数，它查看一个较长字符串的段，计算GC内容，然后移动到下一个段，以此类推。 '''calc
浏览 3提问于2015-06-29得票数 0
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嘿，我正在尝试获取GC-字符串的GC-含量是由字符串中C或G符号的百分比给出的。例如，"AGCTATAG“的GC-含量是.375或37.5%。这就是我想出来的。
浏览 1提问于2015-10-16得票数 0
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我设计了一个代码来计算“CG”出现在字符串中的百分比；GC_content(DNA)。现在我可以使用这段代码，这样它就可以打印GC含量最高的字符串的值；
print (max((GC_content(DNA1)),(GC_content(DNA2)),(GC_content(DNA3))现在，我如何打印这个最大GC_content的变量名？
浏览 3修改于2013-09-30得票数 1
1回答
我编写了一个perl程序来查找给定的DNA string.But中GC含量的百分比，该程序正在执行错误情况(条件语句的其他部分)。') { } else { }$total = $a + $g + $t + $c;$percentagegc = ($gc/$total) * 100;
print "percentage gc<
浏览 1修改于2014-03-06得票数 0
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计算每个序列的GC含量。GC含量是指G或C(占总碱基对的百分比)的碱基百分比。将每个序列的结果打印为“序列的GC内容为XX.XX%”，其中XX.XX是实际的GC内容。使用“格式化字符串”执行此操作。
浏览 1提问于2016-10-12得票数 0
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谢谢你的帮助，保罗
附注：实际上，我想将它应用到不同的函数中，而不是长度(GC.content从包ape中计算DNA-序列的GC含量)，但是对于这个函数，我和上面的例子有相同的问题。
浏览 5提问于2016-09-08得票数 0
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我正在尝试编写一个程序，它将计算一系列序列(以fasta格式输入)中的每个序列的GC含量，然后返回具有最高百分比的序列的名称及其GC百分比。#Define functionsdef Percent(sequence):C_count= sequence.count ('C')GC_Sum =
浏览 0提问于2016-02-01得票数 3
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我有这个程序来生成随机N序列，并找到GC内容。seq.count("G") GCcontent = totalG + totalC这是输出：TCGGTGGCATCGTCAAWhen I print the GC content
浏览 1提问于2021-10-10得票数 1
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