AttributeError：'numpy.ndarray‘对象没有属性’拆分‘

Question

我试图回答以下问题：“一位同事在每一行上生成了一个带有一个DNA序列的文件。下载该文件并使用numpy.loadtxt()加载到Python中。您需要使用可选的参数dtype=str告诉loadtxt()数据是由字符串组成的。

计算每个序列的GC含量。GC含量是指G或C(占总碱基对的百分比)的碱基百分比。将每个序列的结果打印为“序列的GC内容为XX.XX%”，其中XX.XX是实际的GC内容。使用“格式化字符串”执行此操作。“

导入dna序列文件并将它们连接在一起后，我现在想将字符串拆分为5个序列(对应于5行)，然后开始计算。

注:这是文件来源：1.txt

这是我的密码：

import numpy
dna_data=numpy.loadtxt("dna_sequences",dtype=str)
",".join(dna_data)
seq1,seq2,seq3,seq4,seq5=dna_data.split(",",4)

我收到以下错误消息: AttributeError：'numpy.ndarray‘对象没有属性'split’

救命啊！

Answer 1

正如注释中所述：",".join(dna_data)不修改dna_data，它只返回一个字符串，您必须将该字符串存储在另一个变量中。就像这样：

s = ",".join(dna_data)
seq1,seq2,seq3,seq4,seq5=s.split(",",4)

更进一步:

(请注意，对于numpy，您似乎还不熟悉:在下面的文章中，我假设dna_data有一个形状(5,)，如果不是这样的话，您可以使用 slicing返回到那个形状)

尽管如此，使用该代码，您只需将数组转换为一个列表，然后放入5个不同的变量，因此，当您只需将数组->变量放在一个简单的行中时-->string-> list ->变量就是->。

我还会更进一步:不要做任何事情！如果您只需要使用dna_data[n]而不是任何seq*变量，那么拥有多个变量又有什么意义呢？前者更方便，并且可以无痛地做一些事情，例如用for-循环循环遍历所有序列。例：

for seq in dna_data: 
    print(seq)