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我试图保存用以下代码切片的3D数组的2D切片：import numpy as np
from nibabel.testing import data_path我需要2D数组才能将我的图像插入到一个自动的肺血管分割模型中，但我只有3D图像，有没有办法从上述3D图像中获取所有的切片而不是手工切片(就像我试图做的那样？)
浏览 4提问于2022-01-13得票数 1
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我遇到了一个问题，我正在努力制作肺的纯二进制掩模，其中像素值在肺内是1，在肺外是1。我使用了kmeans和otsu以及其他一些方法来分割肺部。我会附上一些例子图片。这是一个3d numpy数组的链接。它是所有切片中的一个，所以您可能只想尝试一个切片。
如你所见，肺被分割得很好。(图片中间是白色的)。有没有办法让我识别中间的白色斑点(肺)，并使其外部的每个像素都变黑(0?)如果有人能给我指路，我将非常感激。0 is treated as background, which we do n
浏览 2修改于2021-02-27得票数 0
尝试使用numpy.rot90或skimage.transform.rotate旋转我的肺CT三维扫描图像，这些图像只包含感兴趣的肺区域，意味着它包含一些背景为黑色的白点，旋转如下所示：rot_img = np.flipud(reg_intereset_np_arr1)
我的问题是，每一种方法都反转点和背景色，使图像白色背景与黑点。
浏览 0修改于2018-11-14得票数 0
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我正在做一个3D容积 of CT肺部图像，为了检测结节，我需要为每一个疑似结节拟合一个椭球体模型，我如何为它做一个代码？结节是怀疑是肿瘤的物体，我的算法需要检查每一个物体，并把它近似成一个椭球，从椭球参数中我们计算出8个特征来构建一个分类器，通过训练和测试数据来检测它是否是结节，所以我需要对这个椭球体进行拟合。这里一片容积CT肺图像在这里，另一个体积相同的切片，但它包含一个结节(黄色圆圈，有一个结节)，所以我需要我的代码来检查每个形状，以确定它是否是一个结节。
浏览 0修改于2018-03-23得票数 4
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1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.5168.1900.124239320067253523699285035604/1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.5168.1900.952127023780097934747932279670
间距被读取为30而不是2.9，并且3D图像在两个肺切片之间有脑切片
浏览 0修改于2016-12-09得票数 0
在我的戴尔核心i7 -16 4gb内存-4GB 960兆GPU笔记本电脑上，我正在进行一个使用3d CNN对肺CT图像进行分类的项目。我在使用CPU版本的tensorflow。我的CNN模型有两个conv层，两个最大池层，一个FC层和输出层。使用这种架构，我可以使用大约(5000到6000)个样本来训练模型。在增加了更多的层后，我的模型现在有6层，3层最大池层，FC层和输出层.我的问题是，在用1000多个样本更改了体系结构之后，我的内存就被填满了，我得到了内存错误。我有两个问题：
为什么通过增加更多的层，
浏览 0修改于2018-10-01得票数 7
我想提取肺血管和支气管树，我更喜欢更好地代表这些器官几何形状的数据结构，而不仅仅是3D点的列表。
浏览 0修改于2017-02-09得票数 0
我正在制作一个人体模型，它有特定的器官需要突出显示，并在悬停时到达顶部并可点击。困难的部分，例如:肺与心脏重叠，我如何才能使心脏可点击而不把它放在肺的上面？
浏览 1提问于2014-12-26得票数 0
(候选面罩是CT图像中特定肺结节/假阳性候选物的3d掩模。)
我周围的每个人都在说，胡的时刻只是为2D图像定义的。对文学作品的快速搜索似乎支持了他们。那么，谁能猜到作者们可能在这里做什么呢？(或者胡的时刻实际上可以扩展到3D?)
浏览 0提问于2016-03-16得票数 3
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我用tensorflow编写了一个用于python的CNN模型，该模型用于对肺CT图像(癌症/非癌症)进行分类，经过训练和验证数据训练模型并获得合理的准确性，毕竟，我需要用测试数据来测试模型，但我不知道如何做到这一点如何保存模型并将其用于测试？
浏览 0提问于2018-08-14得票数 0
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我在x射线上运行了一个unet模型，用于肺区域分割，这个模型看起来很好，但是我的数据集不太好看，我正在获得一些缺少部分的结果，如下所示：我的问题是:是否有任何cv操作符，我可以预先准备，使它更平滑一点
浏览 0提问于2021-05-14得票数 1
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ASAP2 Asap2 CANONICAL 5 HeartASAP2 Asap2 reg 8LungASAP3 Asap3 scram 8 Heart
ASAP3 Asap3 CANONICAL如果一个基因同时存在于肺和心脏中，那么我将把它包含在我的子集中。例如，在第一行的基因中，BBS1只存在于肺
浏览 0修改于2015-12-07得票数 1
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其主要思想是使用非常深的神经网络，例如使用Inception模型。我正在考虑使用Inception模型，但似乎这不是一件容易的事情。Image 0 (128, 512, 512)Image 2 (110, 512, 512)128是患者的肺切片数这是一个3D数组。
但是我发现了一个为MNIST数据集生成Inception模型的代码，它的输入图像形状类似于仅用于60000张图像的28*28像素数据的(60000，2
浏览 4修改于2017-12-26得票数 0
我想要开发windows商店8应用程序渲染三维模型。我有3D模型，我只是捕捉图像和识别三维模型，并渲染它和执行行动，如360视图等。
有什么建议是最好的解决办法吗？
浏览 2修改于2013-08-02得票数 1
我想要创建一个MMO 3D游戏，我想找一个3D引擎，我的问题是关于javaFX 8，我可以用它来渲染很多3D立方体，模型和动画而没有失去性能，或者最好使用lwjgl。最后一个问题是: javaFX 8可以用作3D引擎吗？
浏览 5修改于2014-12-23得票数 4
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我使用three.js在我的web应用程序中包含3D模型(OBJ + MTL格式)。3D模型的大小非常大( 35-70MB )，所以我需要使用web工作者来加载它们，以避免冻结网页。我尝试了基于worker的方法，使用了THREE.OBJLoader2.WWOBJLoader 2，但是只有一个纹理被应用到3D模型中。我试过使用不同的3D模型，结果是一样的。reader.addEventListener( 'load', functi
浏览 2修改于2017-08-14得票数 0
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我是R.的一位新手，我有一个数据集，其中有3组肺功能测量数据，每一次观察给出3个相应的日期。我想用R软件提取每一次观测的斜率(肺功能下降)，并将其插入每一次观测的新列。Date12 FEV1_Date13 DATE11 DATE12 DATE1324204 4.05 3.95 3.99
浏览 6修改于2016-08-08得票数 0
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我有预处理的肺图像和提取48x48x48毫米立方体阵列代表像素在感兴趣区域(dtype=uint8)。我已经将这8504个立方体存储在*.npy文件中。当我将多维数据集的列表作为训练数据传递给模型时，会遇到以下错误：# input layer of model
c3d_model.add(Convolution3D(64, 8
浏览 1提问于2017-03-27得票数 0
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0.0141 1.1685 0在Matlab2013中，可以轻松地使用imwarp：new_img= imwarp(old_img, Rfixed, tform, 'OutputView', Rfixed); if(~isempty(ii))
浏览 1修改于2017-05-23得票数 3
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