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从三维数组中获取和保存二维切片的问题
我试图保存用以下代码切片的
3D
数组的2D切片:import numpy as np from nibabel.testing import data_path我需要2D数组才能将我的图像插入到一个自动的
肺
血管分割
模型
中,但我只有
3D
图像,有没有办法从上述
3D
图像中获取所有的切片而不是手工切片(就像我试图做的那样?)
浏览 4
提问于2022-01-13
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2
回答
3D
图像旋转的方式是错误的,使用numpy或skimage。
尝试使用numpy.rot90或skimage.transform.rotate旋转我的
肺
CT三维扫描图像,这些图像只包含感兴趣的
肺
区域,意味着它包含一些背景为黑色的白点,旋转如下所示:rot_img = np.flipud(reg_intereset_np_arr1) 我的问题是,每一种方法都反转点和背景色,使图像白色背景与黑点。
浏览 0
修改于2018-11-14
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2
回答
ITK/SimpleITK DICOM系列加载顺序错误/切片间距错误
1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.5168.1900.124239320067253523699285035604/1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.5168.1900.952127023780097934747932279670 间距被读取为30而不是2.9,并且
3D
图像在两个
肺
切片之间有脑切片
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修改于2016-12-09
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2
回答
CNN
模型
中使用多层时的内存错误
在我的戴尔核心i7 -16 4gb内存-4GB 960兆GPU笔记本电脑上,我正在进行一个使用
3d
CNN对
肺
CT图像进行分类的项目。我在使用CPU版本的tensorflow。我的CNN
模型
有两个conv层,两个最大池层,一个FC层和输出层。使用这种架构,我可以使用大约(5000到6000)个样本来训练
模型
。在增加了更多的层后,我的
模型
现在有6层,
3
层最大池层,FC层和输出层.我的问题是,在用1000多个样本更改了体系结构之后,我的内存就被填满了,我得到了内存错误。我有两个问题: 为什么
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修改于2018-10-01
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回答
在ITK中有一个表面构建函数,它返回一个VesselTubeSpatialObject吗?
我想提取
肺
血管和支气管树,我更喜欢更好地代表这些器官几何形状的数据结构,而不仅仅是
3D
点的列表。
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修改于2017-02-09
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1
回答
前7个不变的Hu矩能扩展到三维吗?
我当时正在读,在那里(第
3
页,从底部第18行),作者提到: “我们计算出.候选掩模内体素强度值上的前7个不变Hu矩。”(候选面罩是CT图像中特定
肺
结节/假阳性候选物的
3d
掩模。)(或者胡的时刻实际上可以扩展到
3D
?)
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提问于2016-03-16
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回答
Hounsfield单位可以转移吗?
我引用 % Convert into <
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修改于2019-06-19
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回答
仅获取肺部的二值图像
我遇到了一个问题,我正在努力制作
肺
的纯二进制掩模,其中像素值在
肺
内是1,在
肺
外是1。我使用了kmeans和otsu以及其他一些方法来分割肺部。我会附上一些例子图片。这是一个
3d
numpy数组的链接。它是所有切片中的一个,所以您可能只想尝试一个切片。 如你所见,
肺
被分割得很好。(图片中间是白色的)。有没有办法让我识别中间的白色斑点(
肺
),并使其外部的每个像素都变黑(0?)如果有人能给我指路,我将非常感激。
浏览 2
修改于2021-02-27
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2
回答
基于matlab的三维数据椭球拟合
我正在做一个
3D
容积 of CT肺部图像,为了检测结节,我需要为每一个疑似结节拟合一个椭球体
模型
,我如何为它做一个代码?这里一片容积CT
肺
图像在这里,另一个体积相同的切片,但它包含一个结节(黄色圆圈,有一个结节),所以我需要我的代码来检查每个形状,以确定它是否是一个结节。
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修改于2018-03-23
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回答
如何使重叠的图像可悬停和单击?
我正在制作一个人体
模型
,它有特定的器官需要突出显示,并在悬停时到达顶部并可点击。困难的部分,例如:
肺
与心脏重叠,我如何才能使心脏可点击而不把它放在
肺
的上面?
浏览 1
提问于2014-12-26
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回答
用于肺癌检测的初始
模型
其主要思想是使用非常深的神经网络,例如使用Inception
模型
。我正在考虑使用Inception
模型
,但似乎这不是一件容易的事情。Image 0 (128, 512, 512)Image 2 (110, 512, 512)128是患者的
肺
切片数这是一个
3D
数组。 但是我发现了一个为MNIST数据集生成Inception
模型
的代码,它的输入图像形状类似于仅用于60000张图像的28*28像素数据的(60000,2
浏览 4
修改于2017-12-26
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回答
如何保存深度学习模式,并在培训后进行测试?
我用tensorflow编写了一个用于python的CNN
模型
,该
模型
用于对
肺
CT图像(癌症/非癌症)进行分类,经过训练和验证数据训练
模型
并获得合理的准确性,毕竟,我需要用测试数据来测试
模型
,但我不知道如何做到这一点如何保存
模型
并将其用于测试?
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提问于2018-08-14
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回答
如何在Matlab中嵌入传输点?
0.0141 1.1685 0在Matlab2013中,可以轻松地使用imwarp:I = nii.img; Rfixed=imref
3
d(size(I),dii(2),dii(1),dii(
3
));new_img= imwarp(old_img, Rfixed, tform, 'OutputView', Rfixed
浏览 1
修改于2017-05-23
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1
回答
在Delphi Xe6中用动画键制作DAE三维
模型
我的
3D
模型
中有一个带有动画键的DAE
3D
模型
(collada)。我试图在以下步骤中导入Delphi Xe6: 如何使FireMonkey显示从我的DAE
3D
浏览 3
提问于2014-07-28
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1
回答
计算机视觉:改进兴趣区域分割
我在x射线上运行了一个unet
模型
,用于
肺
区域分割,这个
模型
看起来很好,但是我的数据集不太好看,我正在获得一些缺少部分的结果,如下所示:我的问题是:是否有任何cv操作符,我可以预先准备,使它更平滑一点
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提问于2021-05-14
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4
回答
根据一列中的多个值创建行子集
Asap
3
SCRAMBLED 5 HeartASAP
3
Asap
3
CANONICAL 5 HeartASAP
3
Asap
3
reg 5 Heart 现在我想用下面的方式来做它的子集。如果一个基因同时存在于
肺
和心脏中,那么我将把它包含在我的子集中。例如,在第一行的基因中,BBS1只存在于
肺
中,而不在心
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修改于2015-12-07
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回答
在Matlab中分割
肺
结节的最佳方法
我只想分割出恶性(癌性)
肺
结节。起初,我设法把
肺
和所有可能的结节都切掉了。 更新: 以大于
3
mm的结节为恶性(癌变)。如何从图像中计算以毫米为单位的尺寸?
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修改于2014-04-19
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1
回答
Python和opencv:如何将此图像的所有背景转换为一种颜色或透明
我在图像1上使用阈值掩码(图2)创建了以下图像(图
3
)。我试图使用opencv将图像
3
(
肺
)中央图像之外的所有像素转换为一种颜色(例如黑色)。我的问题是外部像素和图像
3
中
肺
内像素的相似性。这能用opencv吗?
浏览 2
提问于2017-11-25
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1
回答
从2个numpy数组构造2d列表时内存不足的错误
我正在处理来自luna16数据集的
肺
CT图像,数据集有一个三维
肺
图像和一个来自CSV文件的标签,我有一个从
3d
数组25x25x25 (
3d
图像)构造2d列表的代码,以及从CSV文件创建一个标签0,1或(ID_dist): matrixlist = [] x = int(r
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修改于2018-08-30
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1
回答
3D
pdf adobe api for javascript
我知道Adobe
3D
pdf支持JavaScript。因此,我在Three.js中为
3D
世界中的
3D
模型
编写了JavaScript代码。我必须要有什么才能拥有这个?我能用Adobe API创建场景吗?Adobe API是免费的吗?
浏览 24
提问于2018-02-07
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第 5 页
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第 7 页
第 8 页
第 9 页
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