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我使用函数retrieve_pdb_file从Bio.PDB获取蛋白质的临界结构，默认格式已从PDB更改为PDBx/mmCif。我想从cif文件的标题中提取蛋白质序列。在Bio.PDB中应该有一个名为MMCIF2Dict的简单函数来完成这个任务，但是这个模块是不可调用的。我还手动下载了cif文件，并将其放入脚本文件夹中，但仍然存在相同的错误。我的传记片是最新的。from Bio.PDB import *
mmcif = MMCIF2Dict(cifFile)
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浏览 10提问于2017-10-26得票数 0
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我对我们CobraPY模型中的步骤有一个反应，本质上是这样的：C+D --> E问题是D是一种蛋白质，不可能对其创建进行建模。对于蛋白质或其他代谢物的简单引入，然后将其从系统中移除，有没有针对基团和流量平衡分析的变通方法？我假设它会产生无限的质量或者某种形式的循环。
浏览 2提问于2018-07-26得票数 1
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我对计算复杂性，特别是蛋白质折叠问题非常感兴趣。我有个问题。哈希函数是指给定一个稍微不同的输入，生成一个非常不同的输出，并且实际上是不可能逆转的函数。蛋白质折叠有平行性吗？我的意思是，稍有不同的氨基酸序列给出了不同的三维结构，蛋白质折叠问题是Np，但仍未解决。是以这种方式实现的哈希函数吗？例如，在模拟分子动力学模拟的环境中，以一种氨基酸序列映射明文。
浏览 0提问于2022-06-25得票数 3
我试过使用sum()函数，但返回错误'int‘对象不可迭代，我感到非常困惑。这是在python 3上。protein_sum = print(avg_protein) 我希望用户输入'n‘个患者和他们各自的蛋白质需求，并返回所需蛋白质的平均值。例如：如果有三个患者，用户输入10，20和15作为蛋白质数量，我预计程序将返回15作为平均值。
浏览 12修改于2019-04-28得票数 1
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我想我是在用matplotlib编写不可能的代码，所以如果有不同的python库更适合我，请告诉我！令人困惑？
浏览 6修改于2017-05-19得票数 4
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考虑到营养需求(碳水化合物、脂肪、蛋白质等)，问题涉及到不同数量的食物项目。食品项目需要从少数项目中选择(<7项)。例如，假设你有食物项目A，B，C。食品项目A有a_p克蛋白质1克A，B项b_p克蛋白质1克B等等。假设所需的碳水化合物总量为Crb，所需蛋白质总量为Prt，脂肪需要量为Ft。b_c + C_g*c_c = Crb A_g*a_f + B_g*b_f + C_g*c_f = Ft
其中A_g、B_g和C_g是每种食物的克，而a_p...b_c...c_f表示每种食物的1克中的蛋白质这里
浏览 4修改于2015-01-13得票数 2
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</div> </div>
}
问题是，我要用图像和标题来循环相册项目，白蛋白数据包含相册的标题，而白蛋白缩略图保存了专辑的第一个图像，但我不能在albumthumbnail.map下面绘制地图。但这似乎不可能。
浏览 0提问于2018-12-13得票数 1
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YAL004W SGDID:S 000002136，Chr i来自140760-141407，基因组释放64-2-1，可疑的ORF，“可疑的开放阅读框架；根据现有的实验和比较序列数据，不太可能编码一个功能蛋白；完全重叠已证实的基因SSA1 1/yal005c”
S000000004，Chr i，141431-139503，基因组释放64-2-1，反向补体，经验证，“参与蛋白质折叠和NLS-定向核转运的ATPase；HSP70家族成员；与Ydj1p形成伴侣复合体；定位于细胞核、细胞质和细胞壁；98%与模拟Ssa2p一致，但这两种蛋白
浏览 0修改于2016-02-11得票数 0
我想把Opal集成到我的下一个项目中，并且决定从sinatra-资产包中移到链轮上，但是我找不到任何关于如何将蛋白石集成到链轮上的东西，而不仅仅是分别设置链轮和蛋白石。请记住，我不把它作为一个文件运行，这是由于我们的环境，所以它是不可行的，相反，我捆绑我的应用程序作为一个创业板，并运行它通过可执行。
浏览 4修改于2015-08-11得票数 2
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visibility = View.INVISIBLE将那些ImageViews变为可见的或不可见的。过去，我一直在处理ListAdapter回调数组，但对我来说，这一直是一种杂乱无章的做法，所以我正在寻找一种更优雅的方法。约翰
浏览 1提问于2019-08-15得票数 0
我的问题涉及生物信息学，特别是蛋白质序列，然而，实际上并不需要生物学知识。我试图在Perl中找到一种有效的方法来解决这个问题：因此，在长度为1时，将有20种可能性。蛋白质序列可以是成百上千个氨基酸。我只需要得到所有可能的序列来做这件事。
编辑:我意识到不可能计算每一个长度，我不需要这样做，但我想要计算一个合理的长度，不会花费任何接近宇宙的长度。
浏览 0修改于2012-07-14得票数 0
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代码的本质如下-在输入中，我们有两个参数(产品和重量)，在输出中我们必须得到等价的值：“蛋白质”、“脂肪”、“碳水化合物”和“卡路里”与产品的重量相关。除了函数，我们计算值的总和(“蛋白质”，“脂肪”，“碳水化合物”和“卡路里”)。当我想要得到一个列表时，当我输出“蛋白质”、“脂肪”、“碳水化合物”和“卡路里”值时，我得到了NoneType。我试图声明列表中的“输出”，并添加值“蛋白质”、“脂肪”、“碳水化合物”和“卡路里”，但我在输出中也得到了NoneType。totalCarbohydrates, "Calo
浏览 1修改于2022-02-04得票数 -1
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我有一个enum，它存储一个蛋白质可以编码的可能属性的列表。蛋白质是由一系列氨基酸(即"W“、"A”等)现在，我有一个字典，它将一个属性(enum成员)与一个字符链接起来。同样，我对蛋白质类型也有相同的设置。string, Property> { {"B", Type.NEURAL},
从另一个类别，我正在创造蛋白质的基础上几种蛋白质可
浏览 5修改于2017-05-23得票数 1
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我正在使用Biopython读取文件：seq=SeqIO.parse(handle, "fasta")有没有办法从这些序列中获得蛋白质名
浏览 0提问于2013-02-14得票数 0
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我的目标是从基因组坐标(origin.bed)创建一个定制的蛋白质序列参考文件(origin.bed)。ENST00000530211.1_uORF_0 - ENSG00000110321.11
期望的两步输出:基因组核苷酸序列文件(nucleotide.fa；0)和蛋白质序列文件重要的一点是，具有相同TranscriptID的条目应该在蛋白质序列翻译之前连接起来。基于GeneID的级联是不可能的，因为相同的GeneID (chr11的最后两个条目)的转录is可能不同，这将导致错误的序列。然而，正
浏览 5修改于2022-08-16得票数 0
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此外，存储K的倒数并仅将其第一行与b相乘是不可能的，因为K的条件很糟糕。在这种情况下，使用\运算符将使用低密度脂蛋白求解器，当显式使用反向运算符时，精度会降低。
浏览 38修改于2018-05-31得票数 3
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以下是我收到的信息：错误代码: ERR_CONNECTION_REFUSED瘦web服务器(v1.6.3代码为蛋白粉)监听localhost:80，CTRL+C停止
如果有任何不同，我也不能直接访问ip地址。
浏览 1提问于2015-03-10得票数 4
我想发布这样的表格数据，哪里,
所以，总之，我有一堆文本，一个音频和一个图像可以上传到服务器使用web服务从android。
浏览 2修改于2018-05-29得票数 0
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sMGNLPRPTLSPSLSGIRPTMNRETTTRVDSSTPAARLGMRVPSTSRAALVGVAALVVILGGWYGIKRWRAHVASEGQYIFAAIQKGDIEDLVTATGSLQPRDYVDVGAQVSGQLDKILVEVGSDVKEGDLLAEIDADVAAARVDASRAQLRSQQAQLVQQQANLTKAERDLTRQQNLMKEDATTAEQVQNAETTLDTTKAQINALKAQMEQLRASMRVDESNLNYTKILAPMSGTVVSISAKQGQTLNTNQQAPTILRIADLSTMTVQTQVSEADVSKLRSGMQAYFTTLGSAGKRWYG
浏览 11提问于2022-05-04得票数 0
我正在计算几个循环中的蛋白质容量(空间质量作用模型)(我知道，填充numpy数组可能相当慢，有更快的方法，但目前它是有效的)：我可以使用if语句。但是有没有更好的方法(代码不那么混乱)呢？
浏览 1修改于2014-12-29得票数 0
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