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验证测试--它可以是训练集的平均值吗?
简单地说,我的输入数据集(特征)包括不同样本(
细胞系
)的基因水平(RNA表达水平)。在这个数据集中,我复制了相同的生物样本,这意味着我已经测量了两次(或更多次)相同细胞株或
细胞系
的RNA表达水平。我包括了所有不同的测量(不同的
细胞系
,同一
细胞系
的不同测量等等)。作为不同样本的训练集,为了增加人工神经网络的灵活性,而不是只计算平均值而仅使用(对同一细胞株的不同测量)。
浏览 1
修改于2020-04-23
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1
回答
使用R的ompr或其他优化函数进行赋值
我有n处理和m细胞株,对于每个处理:
细胞系
对,我运行了一个实验,读数是
细胞系
对处理的敏感性。现在我需要运行一个验证性实验,我需要选择i处理,对于每个处理,我需要选择j敏感和j不敏感的
细胞系
(在我的例子中,i = 40和j = 4)。在这个验证性实验中,我在同一个平板上运行处理和
细胞系
,所以我的目标是最小化
细胞系
的总数。 我想知道这是否可以转换为R ompr可以解决的术语?
浏览 4
修改于2017-01-14
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回答
Excel循环从A列中找到匹配值并将它们移动到新的工作表
意图:有关数据集的示例,请参见所包含的图。
细胞系
(第1行)和药物与得分(第2行)的标题占据前2行。 从A列的第一种药物开始,Range (“A3”)在我的例子中,你会从C,E,G等列的匹配中看到,这取决于分析了多少
细胞系
。例如,如果
浏览 1
修改于2018-07-09
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回答
GEOquery库中的sql查询
我正在尝试从GEO db下载所有有关实验的条目,这些条目涉及“乳腺癌
细胞系
时间序列基因表达谱”。这似乎太少了,所以是错误的,因为我们肯定知道已经在乳腺癌
细胞系
上进行了大量的时间序列实验。我想,我在sql查询中可能在"title“中犯了一个错误。有谁可以帮我?
浏览 0
修改于2012-07-04
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2
回答
通过为R中每个条形图的不同段指定名称,使直方图更加清晰
假设我有一个有两列19行的数据框架(见下文);左列是
细胞系
的名称,右边的是基因ZEB1在相应
细胞系
中的表达。hist(Heiser$ZEB1[1:19], breaks=50, col="grey") 它给出了一个直方图,它的x轴是基因表达量,y轴是细胞在细胞中表达的频率,但是,我想在直方图上的特定位置加上
细胞系
的名称
浏览 3
提问于2014-09-30
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回答
如何将两个dataframe列融化为一列
Myob_Ind 07 1629 1.825 Myob_Ind 0 我的目标是添加额外的
细胞系
,比如来自中性粒细胞或脂肪细胞的
细胞系
,并使用箱形图绘制z得分,但我需要此表单中的数据来完成此操作。基因/
细胞系
的顺序并不重要,只要它们与各自的z分数相匹配即可。我在使用pd.melt和pd.concat时遇到了问题,这让我无法确定它们的正确使用。
浏览 19
提问于2021-02-15
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回答
使用summarize()访问其他group_by组
我有一个数据框,里面有列基因,它们所属的染色体区域,测量基因表达的
细胞系
,以及基因在该
细胞系
中的表达水平--它看起来基本上是这样的: gene region cell_line expressionClaire 3E Z Claire 1 我想要做的是,对于每个
细胞系
浏览 19
修改于2020-09-02
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1
回答
地牢
细胞系
统
我要做一些像样的图形造型,所以我在考虑正确的
细胞系
统算法。 但我不知道。BSP在它的基本形式是有用的,只有2D-流氓类地牢。
浏览 2
修改于2017-05-23
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1
回答
如何使用GROUP_CONCAT动态透视和生成连接列名
我有一个表格,列出了不同
细胞系
中被不同病毒感染的化合物的抗病毒活性,如下所示:1 abc123对于有限数量的组合,这当然可以是“硬编码”的,但我希望考虑到以后添加额外的
细胞系
、病毒株和浓度的可能性,因此可以动态生成旋转列名。 非常感谢任何关于如何在mySQL中高效地编写代码的建议!
浏览 18
提问于2018-08-14
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2
回答
奇偶
稳定
构建
如何从源
构建
稳定
版本的奇偶?build --releaseversion Parity/v1.9.0-unstable-51e6e0b4b-20171230/x86_64-linux-gnu/rustc1.22.1给我这个版本:也不
稳定
如何从源代码
构建<
浏览 0
提问于2017-12-31
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1
回答
无法制作用于差异基因分析的缩放热图
我用DESeq2软件包进行了差异基因分析,找到了30个下调最多的基因,并用fdr<0.05对
细胞系
进行了分析。我试图使用pheatmap包创建一个热图,但我无法生成我想要的热图。我想为每个
细胞系
的前30个基因(共8个)生成一个热图,代码如下: dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = GSM_subset,
浏览 32
提问于2021-05-19
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回答
在pandas中,如何在3个具有匹配行和列的独立数据帧之间建立相关矩阵?
每个数据帧具有基因名称的行索引和
细胞系
的列索引,表达水平填充每个细胞。这3个数据帧具有相同的对应基因名称和
细胞系
,我希望找到相应行的三元组之间的相关性(即
细胞系
如何影响3个数据帧之间每个特定基因的表达)。我如何找到新数据帧中的相关系数,然后使用热图进行可视化? 谢谢!
浏览 16
修改于2020-09-07
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回答
从nsmutablearray swift3操场获取字典条目
我试着用这个视频让它工作cell.textLabel?.text = "\(client.objectForKey("firstName")!)"
浏览 2
修改于2017-05-23
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回答
Jenkins -获得最后不
稳定
的
构建
状态
http://$host/job/$jobname/lastSuccessfulBuild/api/json这个告诉不
稳定
构建
的定义。-如果一个建设成功,而一个或多个出版商报告它不
稳定
,则它是不
稳定
的。例如,如果配置了JUnit发布服务器,并且测试失败,那么
构建
将被标记为不
稳定
。 如何通过api获得不
稳定
的
构建
细节?
浏览 3
提问于2016-12-08
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回答
复制间相关性的可视化
通过计算每个
细胞系
的生物复制对的Pearson相关系数来检验生物复制的质量。
浏览 1
修改于2013-10-02
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回答
Sonar
构建
稳定
性插件将不
稳定
的
构建
标记为失败
我正在使用Sonar的很酷的
构建
稳定
性插件。我正在将Jenkins
构建
结果导入到Sonar中。我正在跟踪的Jenkins
构建
只有不
稳定
和失败的结果,还没有成功(所有测试还没有通过)。这使得Sonar中的结果有点误导,因为它将所有
构建
显示为失败。 有没有可能在Sonar中以某种方式改变这一点?也就是说,不
稳定
的
构建
将显示为绿色,或者不
稳定
的
构建
将在Sonar中具有单独的颜色,例如黄色?
浏览 0
提问于2012-12-03
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1
回答
如何获得Debian包的
构建
过程?
我想要
构建
一个比目前作为
稳定
版本Debian包可用的软件更新的版本。Q:如何找到特定(
稳定
版本) Debian包的
构建
过程?
浏览 0
提问于2021-12-11
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2
回答
Git将本地分支推到远程分支
我有两个遥远的分支: 我需要推动提交到
稳定
的分支以获得
构建
产品,所以在测试通过之后,如何将本地分支--其父分支是
稳定
分支--合并到掌握?
浏览 3
修改于2014-05-18
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1
回答
将
构建
状态更改为jenkins中的succes
如果测试失败,testlink插件将生成状态更改为不
稳定
状态。-标记为不
稳定
的testlink -> -- -x单位,检查不
稳定
/成功的阈值-- 然而,将
构建
状态更改为
浏览 0
修改于2020-06-20
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回答
如何清理Jenkins的工作,使
构建
稳定
不受影响
有人如何清理Jenkins的工作,使
构建
稳定
等级被重置,而不受以前的
构建
的影响?我创建了一个
构建
作业,通过尝试和错误,我最终得到了正确编译/
构建
的任务。但是,我不希望所有以前的测试
构建
都会影响
构建
稳定
性等级。我试着删除所有的
构建
并重新启动Jenkins,但是它仍然说在过去的25个
构建
中有20个失败了。我查看了$JENKINS_HOME目录(~/.jenkins),没有发现任何关于
构建</e
浏览 2
提问于2013-10-31
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