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我有一个对齐的BAM文件，我想要模拟它来生成读取。我使用的平台是离子AmpliSeq整个外显子组测序。我想知道有没有离子激流平台的阅读模拟器。
浏览 0修改于2018-05-24得票数 0
问题当用给定的数据调用Observable.of时，HttpClient应该将数据返回给已经订阅它的方法。演示有一个服务(mock.service.ts)使用HttpClient发出模拟HTTP请求，该请求到达mock.interceptor.ts并希望使用Observable.of回答模拟数据(意思是不允许请求通
浏览 3修改于2017-12-04得票数 0
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这是一个问题:用一个包含G元素的列表来表示G大小的基因组，其中每个元素都包含有关该位置的相关信息，例如，该位置的核苷酸被测序了多少次。若要模拟一次测序过程，请执行以下步骤：·将列表中的所有元素设置为0(标记每个核苷酸已被测序0次)。·随机选择L大小R读的起始位置，并对每次读更新所包含的核苷酸序列的次数进行测定。
浏览 2提问于2017-10-11得票数 0
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我需要建立一个数据库来保存从DNA测序实验中获得的数据。2)有几个数据点为空如有任何建议(S)，将不胜感激。
数据类型: DNA测序数据。将整个染色体分解成1kb的窗口，计算测序的平均深度等。
浏览 0修改于2020-05-10得票数 1
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如下所示：通过合并元素的索引，将可观测序列的每个元素投影到新的可观测序列序列中，然后将可观测序列的可观测序列转换为仅从最新的可观测序列产生值的可观测序列
浏览 5提问于2016-08-05得票数 25
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但是在take的rxjs文档中，它说：
第一个值是如何得到当前状态(即最后一个值)的？而且，在使用Subject的单元测试中，我很难模拟这种行为。
浏览 0提问于2017-01-31得票数 1
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我研究的是生物学，特别是DNA，通常是基因组测序所产生的数据大小有问题。我知道在不同的计算机上，整数的大小是不同的，但它仍然比四种选择具有更多的信息存储可能性。
浏览 3提问于2014-06-25得票数 4
Sequence where Iterator.Element : ObservableType where E : MyType {
在上述伪代码(不起作用)中，意图是：
此扩展应适用于可观测序列，其中可观测序列是MyType类型的可观测序列，例如，可观测序列
浏览 3提问于2017-01-17得票数 5
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我有一个DNA测序信息的dataframe aSNPst.df，有些点在测序过程中没有被读取。| GC | | TT | GG |我认为这些空白列意味着我的代码无法识别分隔符sep=""
如何从数据帧中删除列
浏览 4提问于2021-02-07得票数 1
我读到，它调整了HMM的参数(转移和发射概率)，以最大化我的观测序列被给定的模型所看到的概率。在这两种情况下都是一样的吗？还是算法必须同时知道所有的观测结果？
浏览 1修改于2013-06-15得票数 8
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全血管的单细胞测序进行数据分析时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker（包括免疫细胞，内皮细胞，成纤维细胞等等），为什么？
浏览 382提问于2022-01-09
观测序列的长度不是固定的。我尝试了一些HMM包，如Matlab的HMM工具箱和Kevin的库。它们似乎都要求用户指定转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小。我知道，对于隐马尔可夫模型(HMM)，转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小取决于隐态数和观测序列的长度。如果观测序列的长度不是固定的呢？或者我可以通过填充零来使观测序列保持相同的长度吗？
浏览 0修改于2018-07-20得票数 1
给定n个观测序列和这些序列的n+1观测序列，HMM能用来预测一个新的n观测序列的(n+1)th观测吗？如果是的话，怎么做？
从文档中我无法很好地理解这一点。我找到了一个可能的，但它没有指定如何在Scikit中使用HMM --学习预测序列中的下一个值。
浏览 5修改于2017-05-23得票数 1
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我为一个测序中心管理一个数据库。还有其他开发人员从数据库中获取数据，并运行自动化和半自动流程。1)将GBS_index数据存储在原始的multiplex_index表中，并通过其“类型”字段对其进行标识。我赞成第二个并行表选项，因为我认为它不太可能破坏现有代码(脚本在数据库中查询multiplex_indexes列表，在本例中需要排除GBL_indexes )。好吧，快速
浏览 0修改于2013-09-20得票数 1
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对于双哈希实现的探测序列，下列哪一项不是正确的？两个键可以有相同的探针序列C.探测序列的元素是哈希表的可能键我相信A，B和D是正确的，所以我认为C是正确的答案。
浏览 1修改于2016-11-23得票数 2
我正在使用软件包forecast进行季节性时间序列模拟，我有两个问题：
1)我不太明白“未来”这个选项的含义和用途。默认情况下，它被设置为TRUE，我认为如果我想预测序列的未来值，它应该是真的，但是我不明白用future=FALSE模拟有什么用。
浏览 3提问于2013-01-07得票数 2
创建新对象时，我需要生成一个唯一的编号来将其附加到对象的元数据中。对象元数据只需要使用框架库从代码中设置，因为对象在内部链接到数据库中的多个表，直接更新列是不建议的，也是有风险的。从10个不同的测序器中产生10个序列需要(每个测序器1个)- ~40 ms。案例2:从10个不同的测序器中生成1000个序列需要(每个测序器100个数字)- ~4200 ms。
浏览 2提问于2022-09-21得票数 0
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我似乎记得在C++11中，他们对测序行为做了一些更改，现在i++和++i有不同的测序需求。
f(++i, ++i)是否仍未定义行为？f(i++, i++)和f(++i, ++i)有什么区别？
浏览 0修改于2015-03-28得票数 2
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我正在尝试查看已发布的数据集，以便为我自己的项目检查基因表达。我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中分析R上的单细胞RNA测序数据的材料。这是我试图访问的数据谢谢!
浏览 12提问于2020-04-14得票数 0
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