离子激流全外显子组测序的读出模拟器

Question

我有一个对齐的BAM文件，我想要模拟它来生成读取。我使用的平台是离子AmpliSeq整个外显子组测序。我想知道有没有离子激流平台的阅读模拟器。

Answer 1

请看这份出版物:高通量测序中使用的映射算法的比较:应用于离子激流数据，Caboche等人。BMC基因组学，2014，15:264。

他们的工具是CuReSim，还没用过，但我会试一试。也许它能帮助你..。