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printCodonCounts(4,8); }用于测试的示例文件： CGTTCAAGTTCAA从0开始的阅读框产生了3个唯一的密码子最常见的密码子是具有计数2的TCA。包括在1至5之间的密码子数如下：TCA 2从1开始的阅读框会产生两个独特的密码子CAA 2从2开始的阅读
浏览 3修改于2016-01-14得票数 1
我正在试着写一个关于开放阅读框架的函数，只使用一个只有终止密码子的字典。程序一次接受三个字母，如果这三个字母是停止密码子之一，则程序停止并计算字母数(停止密码子不计算，之后也不计算)。
浏览 32提问于2021-11-09得票数 0
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我正在试着写一个函数，使用列表理解关于开放阅读框架，使用一个只有停止密码子的字典。程序一次接受三个字母，如果这三个字母是停止密码子之一，则程序停止并计算字母数(停止密码子不计算，之后也不计算)。
浏览 20修改于2021-11-09得票数 0
我正在尝试设置一个脚本，它将根据我在NGS数据中找到的变体将密码子序列转换为另一个密码子序列。目前，我的脚本创建了一个由制表符分隔的输出文件，包含6列.每一栏代表以下内容：2:核苷酸碱基第四，密码子中基因组的位置顺序。0.0346505 A
是否可以在输出文件中设置第7列，根据第4列的数字将密码子的核苷酸序列更改为例如,密码子<
浏览 0修改于2018-01-02得票数 2
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请原谅，如果这应该是在密码子，但有时答案有非常数学，我宁愿有一个答案是轻一点的数学。我当时正在观看RSA 2013年的密码专家小组，在“关于33分钟”上，他们提到，在后量子世界中，ECC比RSA更易受攻击。有人能解释为什么在后量子世界中ECC更容易受到RSA的攻击吗？
浏览 0修改于2017-11-06得票数 16
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我在尝试计算给定DNA序列中的密码子频率。例如：codons = ['ATG', 'AAG', 'AAA']frequency = codons.count(XX)/有些密码子可能有多个密码子，也可能没有。AAA = codons.count('AAA')/
浏览 0修改于2011-04-26得票数 3
蛋白质的DNA序列决定了氨基酸的序列，每个连续的3个DNA碱基(该单位称为密码子)编码一个氨基酸。一个氨基酸可以由多个密码子编码，例如Valine有4种编码方式。并非所有密码子都是平等的--有些密码子的处理速度比其他密码子快。而且，并非所有密码子对都是相等的--有些密码子对比另一些密码子对慢。给定一个具有相应速度值的密码子对表，我们想要编写一个算法，使能够输出一个期望速度的序列，例如最快和最慢的序列，以及两者之间的梯度。输入是编码一个
浏览 2提问于2012-10-13得票数 1
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我已经创建了一个散列，其中每3个核苷酸字符或密码子(例如，uga)被分配到一个定义的氨基酸。例如： ggg => "G",);
我要做的是，在哈希字符串中读取起始密码子aug时，打印与散列中密码子对应的定义氨基酸(大写字母)，并在哈希中读取停止密码子当程序读取字符串中的停止密码子(aug)时，程序应该打印相应的氨基酸(开始为(aug)和停止)。注意:在读取开始密码子(aug)和读取停止密码子</
浏览 6修改于2014-11-20得票数 1
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我正在尝试写一个程序，它循环通过一串RNA碱基，找到起始密码子('AUG')，将下面的密码子分组为三个(即‘UAA’，'ACC')，从字典中查找相应的氨基酸，创建一个包含结果氨基酸的字符串，然后继续，直到它到达一个终止密码子RNA以三个为一组，从起始密码子开始，以终止密码子结束。
问题是，当我想让程序检查它是否命中了三个停止密码子中的一个时，如果我在同一个if语句中列出了所有三个停止密码子中的一个，它就不能工作。当检查字典时，它会
浏览 0修改于2019-07-25得票数 1
我写了一个小循环，一次浏览一个密码子站点。从这里我生成了一个字典，它告诉我每个密码子的位置都有哪些密码子，代码看起来像这样： for i in range(0, len(sequencesCombined[0]), 3):
codons = {任何随机站点的输出示例可能如下所示： 'ATG':5 这告诉我在5个序列中有5个ATG密码子。或者，它可能看起来像这样： 'CCT':2, 'CAA':3 因此，这是一种非同义密码子替换，因为两个序列表达编
浏览 18提问于2020-04-25得票数 0
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我需要创建一个匹配的regex来寻找基因序列，我被困在了一个特定的问题后面--首先，启动密码子ATG，跟随来自三个核苷酸的其他密码子，然后以三个可能的密码子TAA、TAG和TGA结束。如果停止(结束)密码子位于开始(ATG)密码子之后怎么办？当开始密码子和停止密码子之间有中间密码子时，我的当前正则表达式工作，但如果没有，则该正则表达式匹配开始密码子之后的所有序列。
浏览 3修改于2019-04-11得票数 0
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我需要将RNA密码子与Ruby进行匹配，而每当出现终止密码子时，匹配就必须停止。这几乎可以做到这一点：
"GUUAAUGAGUAAGUAAGUAG" =~/AUG(.*?)然后，就没有更多的终止密码子三元组了。我该怎么做呢？
浏览 1修改于2014-01-05得票数 2
我正在读奥尼尔和瑞恩的报纸，他们说：
所以我只想确定，两个连续的密码子是位1-8，然后是9-16，对吗？
浏览 2修改于2017-06-29得票数 0
这个问题与生物学有关，所以对于那些知道什么是氨基酸和密码子的人来说，这是很好的！对于那些没有这样做的人，我已经尽了我最大的努力去表达它，这样你就可以理解我在说什么。所以我有一个密码子列表，也可以称为三字母字符串，由以下四个字母组成: A，G，C，T，即AAT，GAT，GCT等。每个密码子对应一个特定的氨基酸，但是有多个密码子可以对应相同的氨基酸。对于我名单上的每一个密码子，我想最终找出它对应的氨基酸。因此，我必须先将这个密码子与我发布链接的密码子列表(64个可能的密<e
浏览 5修改于2013-11-06得票数 4
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我知道re模块，但我不太明白当涉及到列表时它的正确用法--以下是我的任务：然后，I需要找到存储在列表中的三个可能的停止密码子中的一个。stop_codons = ['TAG', 'TAA', 'TGA']然而，我觉得一定有更好的方法，而不是为每个终止密码子写一行，在预先定义的列表中循环将
浏览 4提问于2021-04-27得票数 1
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字典包含碱基对，密码子列表包含密码子序列。我试图在codonsB中为codonsA中的每个密码子序列寻找互补密码子序列，并返回匹配对，如下所示：codonsATTG', 'AAC'), ('CAT', 'GTA&#x
浏览 2修改于2016-04-16得票数 1
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从我编写的代码中，我将获得以下样式的输出：["TGC", "ATG", "ATA", "TGG", "AGG", "AGG", "CCG", TAA", "TAG", "TGA"]
我现在要做的是将起始密码子定义为"ATG“，并获取其索引，并将终止密码子定义为["TAA", "TAG", "TGA"]，
浏览 17修改于2021-05-18得票数 0
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我有一个这样的DNA序列列表:非常小的例子：如果你把每个序列中的字符数除以3，你就会得到偶数我还有这本字典，里面有密码子和氨基酸。'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_', '
浏览 0提问于2016-10-13得票数 1
DNA字符串由一个由四个字符组成的字母组成，A,C,G, and T给出了一个字符串，我想把它分成它的组成密码子密码子编码蛋白质，它们是多余的()
我在D中有一个DNA串，想把它分裂成一系列的密码子，然后翻译/映射密码子到氨基酸。
浏览 4修改于2015-05-04得票数 1
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