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我正在研究2600+基因组，希望研究不同群体的基因组、基因和基因间的特征。如果分类组只有很少的代表，就没有问题。在分类组具有多个基因组的情况下，我应该在什么基础上删除相似的基因组，以便从每个分类组中只获得几个代表。我是否应该使用lenght或GC%或其他特征来删除基因组-例如，如果两个基因组的GC%变异小于1%，我将删除它。类似这样的事情。请建议接受的方式，并友好地解释原因以及。tuberculosis alone which have
GC% range of 65.48 to 65.
浏览 1提问于2013-09-27得票数 0
我一直在尝试使用"bedtools coverage“命令来评估我的基因组集合的覆盖率和任何倒置的存在等等。我肯定对某些事情有一个根本的误解:我使用BWA从我的illumina读取和参考基因组创建了一个BAM文件。我的印象是，这份BAM文件是我与上述基因组的比对。那么为什么我需要将基因组输入到床上工具的覆盖范围--我的BAM文件不应该已经包含了相关的基因组吗？对于如何处理这个问题，或者第二个合适的输入是什么，有什么建议吗？
浏览 0提问于2018-12-12得票数 0
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目前，该程序使用多态性允许多种类型的基因组。，它可以有任何类型的行为，与其他的物状体类型没有任何共同之处，有些基因组使用直接的编码方案，不需要被解码成一个小体。因此，每个基因组都必须由用户向他相应的子类投射，才能揭露它的行为，这看起来非常丑陋。问题是基因组的每个子类都是--基因组，需要有一些特定的功能才能工作，所以多态性是非常有意义的。我希望能够创建任何类型的基因组(NeuralNetwork，Interface，一个图像，.)，所以我使用一个接口和子类来实现这一点，这样种群中的向量就可
浏览 0修改于2019-05-06得票数 0
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我想要阅读基因组中特定区域的所有呼叫。与基因型无关(等于参考基因组或交替、编码或非编码区)。假设所有的基因组都被测序了。我应该看下面哪个表？我正在使用谷歌BigQuery基因组学数据，需要解释以下文件扩展名之间的差异：*.genome_calls *.variants *.multisample_variants *.single_sample_genome_calls
浏览 4提问于2017-12-07得票数 0
但感兴趣的类别如下：群体类-包含基因组对象的载体，并与基因组对象相关联。首先创建一个基因组对象，然后将对它的引用传递给人口类构造器，该构造函数根据传递的基因组创建自己的基因组向量。(希望这是合理的！)问题就在这里，据我所知，没有办法动态地设置传递给模板的类型。
浏览 4提问于2009-04-22得票数 1
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我想构建一个堆叠的条形图，x轴代表基因组(或仅仅是有机体)的数量，y轴代表基因组的确切数量中出现的基因簇的数量。因为我知道这些基因来自哪些有机体，我希望每个条形图都能显示每个基因组在构建这个条形图中的影响。,"E", "D", "N", "*"), genome3_genes = c("*","*", "L", "H", "O", "P,A")
浏览 17修改于2019-05-24得票数 0
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正在尝试使用谷歌基因组学，请按照此处的说明进行操作：
正在尝试设置OAuth客户端id (第4节:身份验证)，在GoogleCloud控制台中，步骤c告诉我：“在API和身份验证选项卡上，选择API并确保基因组学如何将基因组API“添加”到列表中？(我已经被批准参加谷歌基因组学预览)。
浏览 6修改于2014-10-11得票数 1
我只需要从NCBI (GenBank(full)格式)下载完整的基因组序列。我对“全基因组”而不是“全基因组”感兴趣。gatunek, property='complete genome' )#title='complete genome[title]')结果我只得到了基因组的小片段我知道如何通过NCBI网站手动操作，但这非常耗时，我在那里使用的查询：
escherichia[orgn] AND complete genom
浏览 4修改于2013-08-27得票数 3
为了手动修改我拥有的.gff文件，我需要在我的动物的FASTA格式的基因组中找到我的基因的起始位置(即序列中的#碱基是什么？)。我有这个基因的序列。我如何尽可能容易地做到这一点(这不是一种其基因组在互联网上很容易获得的动物)？ 我所拥有的: FASTA格式的基因组；包含该有机体基因组注释的GFF文件(需要彻底更新)；该基因的序列。 谢谢!
浏览 19提问于2019-01-15得票数 0
我试图从蟒蛇的基因组文件中读取一个染色体序列。基因组文件的格式如下所示，但每条染色体都有更多的序列：ATCGTGTGATGGTGCGTAGATGCTGATChr2Chr3
我使用下面的代码读取整个基因组序列。与其阅读整个基因组，然后搜索Chr2的模式，我还有其他方法可以做到这一点吗？
浏览 7提问于2022-01-30得票数 -3
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这些项目必须具有属性P644 (基因组开始)和P645 (基因组端)。到目前为止这是可行的。但是我想根据“基因组开始”和“基因组结束”的值来过滤这些项目。在我的例子中，我想接收所有的项目，其中‘基因组开始’高于'100‘，’基因组端‘低于'3000’。但这不起作用。我不是用正确的方法使用过滤器吗？
浏览 1修改于2022-03-05得票数 4
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我的问题与线程有关，我想同时执行我的基因组。<code>E 210</code>基因组1右，炸弹，左，上，右.基因组2左左右左炸弹..。这些动作或动作在玩家还活着之前都是有效的。我想应用这些移动在我的球员(AI)使用线程。每个基因组都有关于游戏、敌人、炸弹等的相同信息，但是它们的移动是不同的，例如：然而，每台电脑都由不同的人工智能(基因组)扮演，不同的动作会得到不同的结果。在第一个基因组</
浏览 0修改于2018-04-06得票数 2
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我想要做的是在基因组文件中将GenBank记录的所有非假定序列都用小写字母表示。end = feature.location.nofuzzy_end现在我有了基因组中序列的开始和结束位置但是我如何修改基因组文件呢？gb_record.seq[start:end].lower()或类似的东西不能做到这一点。当我分配gb_record.seq = gb_rec
浏览 0修改于2013-11-01得票数 0
我下载了Ubuntu基因组13.04的完整图像，并将其提取到我的笔记本电脑中。现在，当我用USB引导它时，它非常好用，但是每当我尝试使用WUPBI安装它时，它只是&只向我展示ubuntu...kubuntu ..options &而不是基因组一号&即使我选择了ubuntu选项，它也开始下载元数据任何知道为什么它是happening..why基因组没有安装。
浏览 0提问于2013-12-22得票数 0
我正在尝试使用Python从NCBI (最好是fasta格式)下载基因组，但是到目前为止没有什么真正的工作。API对我来说是新的，我并不真正理解文档()。我的最终目标是下载一个属内每个物种的所有基因组，但是用Python下载一个基因组将是一个很好的开始。ngd.download().group(taxon_name)
这是在古菌群中下载基因组数据
浏览 8修改于2022-04-26得票数 0
我有一个包含3个染色体字符串的文件，我想把它连接到一个基因组中。然后，我必须跨多个线程访问这个连接字符串(我使用pthread_t)。SOLVES VALGRIND ISSUE ONE BUT DOES NOT GIVE A CONCATENATED CHAR*所有这些都很有效，但是我得到了未初始化的值是通过引用"char*基因组= (char*) malloc(sizeof(char) *(genome_size+chr_total))“的堆分配来创
浏览 1修改于2021-10-01得票数 0
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