问谷歌基因组学bigQuery差异表数据描述
EN

Stack Overflow用户

提问于 2017-12-07 00:22:21

回答 1查看 30关注 0票数 0

我想要阅读基因组中特定区域的所有呼叫。与基因型无关(等于参考基因组或交替、编码或非编码区)。假设所有的基因组都被测序了。我应该看下面哪个表？

我正在使用谷歌BigQuery基因组学数据，需要解释以下文件扩展名之间的差异：*.genome_calls *.variants *.multisample_variants *.single_sample_genome_calls

非常感谢，艾拉

发布于 2017-12-21 01:58:52

genome_calls -所有基因组呼叫-不仅仅是变体。可能有质量较低的呼叫

multisample_variants - variants by samples -其中每个变体将在一个变体行中包含包含此突变的所有样本

single_sample_genome_calls -样本矩阵的变体。存在于多个样本中的变体将在每个样本中有一行

票数 0

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/47678942

复制

相似问题

问谷歌基因组学bigQuery差异表数据描述EN