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回答
基因
敲除模型绑定
技术
我有一个用于插入、更新、删除和显示城市的敲击式视图模型 this.CityId = ko.observable(data.CityId);} var self = this; self.SelectedCity = ko.observable(); self.EditingCity =
浏览 3
提问于2013-06-03
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1
回答
如何确定使用突变运算符突变的
基因
数量?
我对突变
技术
很熟悉,并且在我的项目中实现了一些,但是我从来不知道在实现一个突变算子时应该有多少
基因
发生突变。让我们以边界突变为例,我们随机选择一个
基因
,并将其替换为该
基因
的下界或上限。然而,我不确定我是否应该仅仅突变1
基因
,还是多变异一些
基因
。因此,我认为有两种方法是可行的: 给每个决定该
基因
是否会发生突变的
基因
分配一个随机概率。为每一个
基因
掷骰子,并在概率范围内变异它。随机挑选一个
基因
并进行突变。然后停下来继续
浏览 1
提问于2016-10-25
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1
回答
Orange 3.13生物信息学附加组件
我需要PIPAx,火山图,集富集,选择
基因
,BioMart和
基因
信息。但其他一些小部件也不见了。 有人能告诉我,这是由于
技术
方面的限制,还是由于某些小部件的更新/删除?
浏览 1
提问于2018-06-06
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1
回答
选择唯一定位到SNP的
基因
我有一个vcf,想要选择100个
基因
,每个
基因
,选择一个SNP?从
技术
上讲,如果我们考虑一个
基因
,它就有许多rsid被映射到它上。在我的分析中,我需要选择100个
基因
,每个
基因
只为它选择一个SNP,而忽略其他的,并且有一个最后的vcf文件,只有100个
基因
唯一地映射到1 rsid。有什么包裹可以这样做吗?我想根据ANN值(即
基因
ID )过滤df,所以对于ENSG00000233866,我只想选择一个或几个rsid或rs值,而忽略其他值。对于其他
浏览 15
修改于2022-03-02
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1
回答
消除数据集中的特定行
这里的问题是一些
基因
有多个结果,我应该为每个
基因
选择一个条目,这个条目应该具有最大的p值。我
编辑
了我的数据,我只有“
基因
符号”和“p值”信息。 如何删除/消除包含根据我的规则应该消除的
基因
的行。
浏览 6
修改于2019-08-05
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1
回答
遗传算法CrossOver
在我运行这个
基因
并得到每个
基因
的结果之后,我对这些
基因
做一些加权乘法(这样排名越好的
基因
就能得到最多的倍数)。问题是,我不知道怎样才能使人口再次减少到X。在交叉
基因
时,什么是常见的做法?
编辑
: 对健身功能中的100个
基因
浏览 0
修改于2014-06-23
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2
回答
将决策问题转化为优化问题?(进化算法)
那么,有什么方法/
技术
可以将决策问题转化为优化问题呢?如果你知道一些文献参考,那就更好了。
浏览 0
修改于2011-09-26
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2
回答
列出常用MySQL中值最多的前10项对
我有一张miRNAs和DNA (
基因
)表。每个miRNA调控许多不同的
基因
。我们的目标是列出10个共同调控
基因
最多的前10位miRNAS。正如你所看到的那样,每个miRNA调控多个
基因
。有1498个miRNAs调控~30-40个
基因
。目标是创建一组由每个miRNA调控的
基因
,然后以某种方式查看每个集合与其他集合共享的值,计数共享值,按计数排序共享数据,并选择前10位。
编辑
:我需要找到前10对miRNA,它们有最多的共同调控
基因
。例如,miRNA #17
浏览 6
修改于2015-02-18
得票数 1
1
回答
Awk -彩色多线图案(如grep)?
给定以下文件 AAATTTGCAGAGATTACAGGGGGGG 阿塔特加加特 awk 'BEGIN{RS=">"; FS="\n";}/GATTACA/{print$0}' file.txt
基因
浏览 4
修改于2019-07-13
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1
回答
删除grep不匹配的行
我有一个文件包含感兴趣的
基因
名称(24423个
基因
),另一个文件包含所有
基因
的长度(41306个
基因
)。我只想要24424个
基因
的长度,但是当我使用grep使用grep -wf file1 file2甚至fgrep -Fwf file1 file2时,我会得到一些多余的
基因
,因为我列表中的一些
基因
可能只包含意义或反感觉链,而如果引用文件可能同时包含这两种
基因
,那么这将被反映出来。P.S.这个问题也在上 A1
浏览 0
修改于2018-02-21
得票数 1
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1
回答
将多Nexus文件转换为多个结点文件
我有一个包含447个
基因
的Nexus文件,但我需要447个单独的Nexus文件(每个
基因
一个)有人知道怎么做吗?
编辑
:我尝试使用bioPython,但是每个文件只支持一种对齐方式。
浏览 30
修改于2020-07-17
得票数 1
1
回答
Python:从B列中获取一个值最高的
基因
,从A列中与每个
基因
相关的一组
基因
中获得
13 302 0.84 401 1在某些情况下,就像
基因
2一样,也有相同值的
基因
。在这里,我还想得到彼此之间距离最短的
基因
。
编辑
:我打算输出的表如下所示: Ge
浏览 0
修改于2018-09-21
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1
回答
Spring-批处理:为数目未知的分区编写分区处理程序
public String getChromosome(); public Set<String> getGenes();(变异体在
基因
组中的位置可能与某些
基因
重叠我已经写了一些
编辑
:或者我应该看MultiResourceItemWriter?
浏览 0
修改于2017-10-11
得票数 0
1
回答
R中矩阵的一对多相关计算
试图计算一个特定
基因
(这里是它的
基因
1)与矩阵中所有其他
基因
(35999个候选
基因
)的相关性。然而,我想得到1到许多相关性,其中感兴趣的
基因
始终是第一个
基因
。在这里,它的
基因
1。这将节省处理时间。一种方法显然是从输出中提取我感兴趣的36000对。我想知道是否有其他方法可以找出我的
基因
与没有的所有其他
基因
的相关性我在寻找类似于格式的输出,Gene 1
浏览 4
修改于2017-06-07
得票数 1
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3
回答
python中基于
基因
表达矩阵的层次聚类
我如何在Python中进行分层聚类(在本例中是针对
基因
表达数据),以显示
基因
表达值矩阵和树状图?我的意思是像下面这样的例子: 如何在Python中使用numpy/scipy或其他工具执行此操作?另外,用欧几里德距离作为度量,用大约11,000个
基因
的矩阵来做这件事,在计算上可行吗?
编辑
:很多人建议使用聚类包,但我仍然不确定如何绘制上面在Python中链接的图像。
浏览 0
修改于2010-06-06
得票数 3
1
回答
R:使用grep类函数提取表中的cerain位。
让我重新
编辑
我的上一篇文章,以明确我需要什么。我确实有一个如下结构的输入数据: 我应该能够创建循环,但在
浏览 2
修改于2014-04-16
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1
回答
是否有一种使用Python从NCBI下载fasta格式的
基因
组的简单方法?
我正在尝试使用Python从NCBI (最好是fasta格式)下载
基因
组,但是到目前为止没有什么真正的工作。API对我来说是新的,我并不真正理解文档()。我的最终目标是下载一个属内每个物种的所有
基因
组,但是用Python下载一个
基因
组将是一个很好的开始。
编辑
:这是我的代码示例ngd.download().group(taxon_n
浏览 8
修改于2022-04-26
得票数 0
4
回答
我应该使用简单的类还是高维矩阵?
我想模拟一个群体,包括斑块,个体,染色体,
基因
。您可以制作“向量向量的向量”(或C型高维整数数组),并在内存中访问任何
基因
。POP[patch][ind][chrom][gene]; }}我们可以使用一系列简单的类来访问内存中的任何
基因
浏览 10
修改于2016-10-09
得票数 3
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1
回答
R:如何计算大矩阵中所有列中空行的分数?
我正在研究单核rna测序,我做了一个由所有特征的
基因
子集组成的矩阵,显示每个
基因
的数量。我想要计算在每个特性中表达的
基因
的比例,但是不能得到我的代码来返回正确的结果。没有表达的
基因
有一个“。值,所以我想计算每一列中有多少个,将其计算为
基因
总数的一小部分,并使用(1-分数)来找出每个特征所表达的
基因
的比例。ppn . 0.8982865 .
浏览 9
修改于2022-05-13
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1
回答
嵌套热图
我不确定嵌套热图是否是正确的词,但我想为一种疾病做一个相对风险(RR)的热度,因为你有一些特定的
基因
。然而,如果你有一个特定的
基因
,两个特定的
基因
等等,那么应该清楚疾病的RR是什么。最好是在RGeneA 1.05 GeneA_C 5.6 但如果这会让工作变得更容易的话,可以做得不同。
浏览 0
修改于2016-06-16
得票数 0
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