嵌套热图

Question

我不确定嵌套热图是否是正确的词，但我想为一种疾病做一个相对风险(RR)的热度，因为你有一些特定的基因。然而，如果你有一个特定的基因，两个特定的基因等等，那么应该清楚疾病的RR是什么。像这样的图片

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你知道有什么工具可以做这样的事情吗？最好是在R

编辑:数据如下：

GeneA   1.05  
GeneA_B 3.08  
GeneA_C 5.6  
GeneA_B_C 8.07

但如果这会让工作变得更容易的话，可以做得不同。

Answer 1

您的问题可能在productplots包中有答案。第一次尝试没有你的颜色和结构，但它有元素。

创建示例数据框

structure(list(Gene = structure(c(1L, 2L, 4L, 3L), .Label = c("GeneA", 
"GeneA_B", "GeneA_B_C", "GeneA_C"), class = "factor"), Probability = c(1.05, 3.08, 5.6, 8.07)), .Names = c("Gene", "Probability"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -4L))

创建一种树形图表

library("productplots")

prodplot(data = df, ~ Gene + Probability, stacked()) + theme_tufte() +
  ggtitle("Relative Risks (RR) of Various Gene Combinations")][1] 

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