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我有一个csv文件，列出了两个物种(例如A和B种)之间的基因。我试图用grep在B中找到一个特定的A基因的同系物。例如，我想要A基因AT1G01070's在B中通过我一次得到了下面三个B基因然而，我需要一次一个基因，以满足以下
浏览 0修改于2022-01-22得票数 0
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目前，该程序使用多态性允许多种类型的基因组。= static_cast<SpecificGenome>(*p.members[0].get())->do_something(4);我正在考虑改变它，这样它就会使用模板而不是多态，因为每个基因组都编码一个物状体，它可以有任何类型的行为，与其他的物状体类型没有任何共同之处，有些基因组使用直接的编码方案，不需要被解码成一个小体。因此，每个基因组都必须由用户向他相应的子类投射，才能揭露它的行为，这看起来非常丑陋。问题是<e
浏览 0修改于2019-05-06得票数 0
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我有两个数据：我通常使用子集函数来找出列表中有哪些基因。我还知道如何创建一个只有匹配的基因等的新表，但是我真的不知道如何在同一个文件中“标记它们”，因此我
浏览 0修改于2022-10-18得票数 1
我正在分析细菌基因，我有一个电子表格，其中A列是基因名，B列是我们所说的基因COG类别，根据基因功能(如碳水化合物代谢、细胞运动等)。它被指定为一个字母代码(A，B，C.一直到字母S)。然而，我有一个问题，因为其中一些基因属于多个群体，因此细胞中有多个字母。有没有一种方法可以让我用Excel来计算有多少个字母，每个字母在单元格中被单独计数，其中包含多个字母？
浏览 9修改于2021-04-20得票数 1
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我尝试将Flask脚本混合到一个JavaScript <script>标记中，该标记迭代出一个JavaScript数组，但得到了一个错误，即脚本标记不喜欢JavaScript标记(Uncaught SyntaxError下面我已经包含了我的html模板与创建无序列表的Flask脚本，我还包括了我在<script>标记中使用Flask脚本的失败尝试。那么如何成功地访问JavaScript中的数组(JSON)呢？1”：1，“遗传2”：1，“基因3”：7，“遗传4”：7
浏览 3修改于2014-04-11得票数 2
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我正在尝试使用BioMart来计算人类蛋白质编码基因的小鼠同源物的平行序列的数量。但例如，在“PLIN4”基因中，它计算的是35,000个类似物，而不是4个。我们认为这是因为一些基因有一对多的类似物，这会导致重复。当我运行单个基因时，它会给我返回正确的副词数量。我也想过，也许一次运行一个基因，然后通过建立某种循环来计算它，这样它就会自动计算列表中的所有基因。
浏览 8提问于2018-01-27得票数 2
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我在运行一份基因和标记列表的关联。我有一个基因genes = ['gene1', 'gene2', ...]列表和一个字典，其中关键字是基因名称，值是我想要与该基因关联的标记列表，即markers = {'gene1': ['marker1.1我有一个规则，可以输出给定基因和标记的文件gene/assoc/marker。 有没有可能同时对genes列表和marke
浏览 13修改于2019-12-16得票数 3
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第一列包含标记，第二列包含基因型。每种基因型都有4个标记。因此，在第一列中，我有4次基因型1的名称和相应的4个标记，然后是基因型2和完全相同的4个标记，依此类推。但我希望标记在一列中，基因型在单独的列中，这样我就可以比较不同基因型的标记。我不知道我怎么能做到。G1有4个标记，G2有相同的4个标记，等等：M1
浏览 0修改于2012-03-25得票数 2
我知道CoreNLP的RegexNER允许我使用映射文件覆盖标记。例如，我有一个单词EGFR，CoreNLP认为它是一个组织。如果映射文件中有下面一行，它仍然将其标记为一个组织。EGFR基因
然后CoreNLP将其标记为基因。要做到这一点，我必须知道CoreNLP标记EGFR作为一个组织，我不能总是知道我的映射文件中的每一个字。现在我的问题是，有没有一种方法可以让RegexNER覆盖EGFR的标签，而不管最初
浏览 1提问于2017-03-30得票数 1
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我正在用MySQL开发基因组数据库，我必须获取每个基因的平均转录本数量(每个表中的条目)(在它自己的列上标记，因此每个相同基因的转录本都有相同的数量)。chr启动端外显子gene_namemysql> SELECT Avg(COUNT(*) FROM refGeneshg GROUP BY name2);
如何计算每个标记出现多少次以及
浏览 3修改于2016-11-05得票数 1
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我在别人的出版物上看到的样本：p = Σ (m,i)(N-m,n-i)/(N,n)
对于i，从k到min(m,n)
浏览 1修改于2013-08-20得票数 3
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一些代谢物已经存在于模型中，另一些必须被创造出来。我还必须增加GPRs的反应，使用尚未在模型中存在的基因。我怎样才能传递一个反应物，添加代谢物和探地雷达？
浏览 3修改于2020-02-08得票数 3
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我的项目是关于预测乳腺癌的生物标志物。Table(gpl96)[1:10,1:4]
我想用这个数据来表示GDS中的基因样本，并比较p值，以了解它是否为正态分布。
浏览 3修改于2013-03-16得票数 0
我有一个基因数据库，这些基因位于不同的染色体和位置。我也有一个标记的列表，也有一个特定的位置。我想要做的是找到每个标记的位置周围的基因。例如，我想提取一个标记的+/- 50K的基因。此外，我想在输出中包含我发现的每一个基因的标记信息。这就是我所拥有的：gene chrom position1_2 1 114181_4 1
浏览 0提问于2015-12-30得票数 0
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我的案文中有以下几行：
耳聋(线粒体)修饰基因2
问题似乎是转义括号字符，因为当我从文本和映射文件中删除括号时，它是匹配的。
浏览 5修改于2020-06-20得票数 1
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我有一个包含基因表达水平信息的数据。如何制作条形图，其中X轴是基因名称，Y轴是表达水平？如果不将A基因和B基因合并到同一列并在单独的列中键入基因A和B，我就无法找到在ggplot2中标记A基因和B基因的方法。在上面的代码类中是<e
浏览 3修改于2022-01-19得票数 0
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我正在尝试在ggplot2中标记特定散点图中的各个兴趣点。我的数据以具有多列的csv文件的形式存在。我正在尝试通过ggplot绘制A列与B列，我成功了，可以用相应的基因名称标记所有的点。但是，我如何突出显示(即颜色、大小改变)感兴趣的单个基因？(又名:如何让我手头上的10个基因列表的数据点脱颖而出？或者，我如何在不注释所有其他点的情况下注释散点图上感兴趣的基因？)
我尝试过使用subset函数，但我在R中的新手角色让我有点束手无策。
浏览 2修改于2017-05-31得票数 5
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背景目前的执行情况
当数据库(postgresql)仍然很小时，使用外键将基因型连接到标记，然后通过联接表将个体连接到基因型没有问题。这样，就可以很容易地查找一个人的所有基因型，或者查找所有具有特定
浏览 0修改于2011-08-25得票数 1
实验建立：男女受试者(=性别，M/F)来自2组，(=基因型，WT/KO)。我需要知道我需要分析多少个主题和多少个样本/主题。Dendrite_Mean_Diameter) ~ 问题:我被要求“保存按性别调整的残余物，问题：，我已经用以下方法标准化了我的残余物：
stres = residuals(logdendritemeandiameter.lm, type = "pearson"
浏览 5修改于2020-08-15得票数 0
我想为患者的基因存在/缺失数据制作一个聚类图/热图，其中基因将被分类(例如趋化性、内毒素等)并进行适当的标记。我在seaborn文档中没有找到任何这样的选项。我知道如何生成热图，但我不知道如何将ytick标记为类别。以下是我想要实现的目标的示例(与我的工作无关)：在这里，yticklabel一月、二月和三月被赋予组标签冬季，其他yticklabel也被类似地标记。
浏览 14修改于2020-02-08得票数 12
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