如何一次返回grep结果

Question

我有一个csv文件，列出了两个物种(例如A和B种)之间的基因。我试图用grep在B中找到一个特定的A基因的同系物。

例如，我想要A基因AT1G01070's在B中通过

grep "AT1G01070" table.csv | cut -d"," -f 2,3,4 

我一次得到了下面三个B基因

"Csa17g001550.1,Csa14g002110.1,Csa03g002170.1"

然而，我需要一次一个基因，以满足以下命令/程序。我怎么能做到呢？

Answer 1

很高兴看到脚本的这一部分，至少能够理解如何将信息提供给下一步。

如果下一步能够处理标准输入并一次读取一行，下面的操作可能会工作：

grep "AT1G01070" table.csv | cut -d"," -f 2,3,4 | tr ',' '\n' | next_step

或者类似的事情：

grep "AT1G01070" table.csv | cut -d"," -f 2,3,4 | tr ',' '\n' | while read a
do
   next_step $a
done