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回答
Python:通过多列中的值解析数据
然后,每个转录本都具有在
外显子
计数中指定的设定数量的
外显子
(例如,8)。较大转录本中每个
外显子
的开始和结束由exonStarts和exonEnds列表中的匹配值指定。例如,本例中的第一个
外显子
的范围是134212702到134213049。内含子位于
外显子
之间,因此第一个
外显子
从134213050到134221528。现在我想使用从TxStart -2000到TxStart + 2000的启动子定义来重做这个
分析
。然而,似乎在使用此代码的
外显子
和启动子
浏览 1
修改于2013-07-03
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1
回答
如何用Java或C++检查输入的大写或小写字母的.txt文件?
然而,我的程序不应该阅读用英语写的文本,而是包含DNA序列的文本,其中一个基因的所有
外显子
都用大写字母写,所有内含子都用小写写。简单地说,我的程序应该把DNA序列作为输入(作为.txt文件),然后告诉我
外显子
与内含子相邻的所有位置。因此,对于上面显示的测试input.txt,它将输出: 这个程序的目的是在我作为.txt文件提供的任何基因中找到所有所谓的‘剪接供体位点’,然后进一步
分析
它们(技术术语:剪接供体位点是一个mRNA转录子的
外显子
/内含子边界上的9个碱基的序
浏览 2
提问于2017-08-11
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2
回答
查找多个嵌套字典之间的重叠
这本字典可能有多达
7
个嵌套字典,多达100个
外显子
。某些
外显子
之间总是有重叠的。": 1245, "end": 1507}, },} 我很难找到一种方法来提取
外显子
之间的所有重叠
浏览 6
修改于2022-04-11
得票数 3
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1
回答
与R中的一列相关的不同行数之和
我正在
分析
RNAseq数据,为了实现规范化,我需要使用读计数除以列表中每个基因的
外显子
长度之和(以千字节为单位)。
外显子
长度。正如您所看到的,我列表中的每个基因都有不同的
外显子
号,因此geneID将被列在不同的行中,但我想在最后得到的结果如下:ENSG00000000003
浏览 0
修改于2018-04-20
得票数 1
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1
回答
在R中获取两个文件之间的交集
我有人类
外显子
的位置(染色体数目,
外显子
开始和
外显子
末端) exon Chromosome Start End6 sampel1 1 16830201 17278112'data.frame':
7
16383682L, 16389288L, 16830026L, 17278112L,
浏览 4
修改于2020-12-16
得票数 0
2
回答
带计算的查询分区,避免
全
表扫描
我是一名
分析
师,正在尝试构建一个查询,以便从Hadoop中的一个表中提取过去
7
天的数据。表本身是按日期分区的。SELECT * FROM target_table 我希望得到一些建议,如何在避免<
浏览 1
提问于2015-02-13
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2
回答
Perl数据解析和插入行
从第一列开始,ID,
外显子
信息,起始位置,结束位置和方向。ID在遇到一个数字时加1。26064 +5 start_codon 26704 26706 +
7
4972 27257 27978 +8 10048 40161 41114 - 8 start_codon4972 27257 *2797
浏览 0
修改于2012-12-26
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1
回答
离子激流
全
外显子
组测序的读出模拟器
我使用的平台是离子AmpliSeq整个
外显子
组测序。我想知道有没有离子激流平台的阅读模拟器。
浏览 0
修改于2018-05-24
得票数 0
5
回答
分析
Java中的全角或半角字符
我想
分析
字符数组中的全角或半角字符。char [] password = {'t','e','s','t',‘思’,‘題’};
全
宽=思,題非常感谢!
浏览 10
提问于2012-11-22
得票数 3
2
回答
Python:测试int列表中的int是否适合于2-int元组列表中的两个int。
背景:小鼠遗传学,我想计数两个实验室菌株之间的#突变,这取决于它们是否落在
外显子
边界内。到目前为止,我生成了两个列表:exon_limits = [(3, 6), (42, 444), (679, 999)]等~5e5值总计 else:要了解python算法在哪里,但是在我中断程序之前,它似乎只是
浏览 7
提问于2014-10-19
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1
回答
如何过滤小于特定持续时间的峰值?
我用matlab的findpeaks.m函数找出了它的绝对振幅大于4.0的峰,但我需要找出哪个峰的持续时间小于
7
秒。但我认为findpeaks.m只有最小选项,而不是最大选项。我也想找
全
宽度,而不是半高宽。有什么帮助吗?这是我必须
分析
的一个例子。
浏览 0
修改于2017-03-14
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4
回答
Oracle
分析
函数是否成本高昂?
有没有人在使用oracle
分析
函数时遇到过性能缓慢的问题?使用lead() oracle
分析
函数在表中生成一个新字段。基本上,它允许将前一行的字段值用作当前行的新字段的值。explain计划指示对使用oracle
分析
函数的表执行
全
表扫描。为了避免这次
全
表扫描的开销,我可能只需要使用after insert/update触发器用前一行的值手动填充一个具体字段 有没有人因为oracle
分析
函数的高成本而决定不使用它?是否应该很少使用oracle
分析
函数?
浏览 2
提问于2009-09-23
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5
回答
如何打印每个ID的最后一行?
我有一个ID (
外显子
)列表,每个ID都有多个后缀,我想得到每个ID的最后一行。输入:NM_203_exon_20NM_0217_exon_8NM_91_exon_14 NM_91_exon
浏览 6
修改于2017-09-07
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4
回答
理解oracle数据库数据访问机制
来自 有人能解释每一个,并提供我可以做一些进一步的阅读吗?
浏览 2
修改于2017-05-23
得票数 2
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1
回答
如何得到高斯拟合直方图?
-30 4 -20 6 -10 18 20 20 30 我想做ABC的数据
分析
'ABC'.Gaussian 绘制了一幅直方图,将histogram.Measure的
全
宽度拟合为半高宽。我想按上述顺序进行。我该怎么办
浏览 1
提问于2021-11-30
得票数 0
4
回答
如何使用PLink删除重复的SNP?
我正在与合作
分析
全
基因组数据。 有人知道如何删除重复的SNP吗?
浏览 42
修改于2020-10-05
得票数 5
2
回答
全
嵌套方差
分析
我试图在NIST的下面一页的底部复制这个示例: 我试过:summary(aov(Measure~factor(Machine)/factor(Operator),data=mydata))谢谢你的帮忙Operator;Machine;Replicate;Measure1;1;2;0.127 1
浏览 1
修改于2015-01-17
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1
回答
宇宙数据库- table诊断表中的相关Id (日志
分析
)
我试图将所有日志(日志
分析
表)与下面的流关联起来。提前谢谢。
浏览 1
提问于2021-01-09
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1
回答
一本新的词典能用于定量的情感
分析
吗?
我试图找到一种方法来实现英语单词的情感规范(荷兰语),以便与
全
德达进行纵向情感
分析
。我最终想要的是每年的“平均情绪”,以显示任何纵向趋势。在数据集中,由64位编码者在4个类别上对所有单词进行
7
分的Likert评分,这为每个单词提供了一个平均值。我想做的是取其中一个维度,用它来
分析
情绪随时间的变化。
浏览 4
修改于2017-05-23
得票数 2
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1
回答
如何通过google analytics跟踪多个youtube频道的流量
全
,任何建议都是值得欣赏的。
浏览 14
修改于2018-08-27
得票数 0
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第 3 页
第 4 页
第 5 页
第 6 页
第 7 页
第 8 页
第 9 页
第 10 页
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