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回答
scRNA-seq
:如何使用预先计算的PCA分数/负载来使用TSNE python实现?
我要做的是:使用
scRNA-seq
数据集并在其上运行scRNA,但使用以前计算过的PCAs (我有PCA.score和PCA.load文件)。
浏览 0
修改于2021-11-26
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1
回答
从两个具有相等nrow值和行名的
scRNA-seq
数据帧中删除使用full_join生成的数据帧中的NAs
我一直在处理一个Log2数据帧,它看起来像这样: library(dplyr) $ 5W_Female_C#1_2 : num 2.28 0 0 0 0 ... $ 5W_Female_C#1_4 : num 2.15 0 0 1.79 0 ... $ 5W_Female_C#1_6
浏览 20
修改于2019-04-20
得票数 0
1
回答
如何使用vcftools按读取深度进行过滤?
我正在尝试建立一个工作流程来分析我的
scRNA-seq
数据。我使用的是GATK和samtools、vcftools、bcftools的组合。
浏览 59
提问于2021-01-25
得票数 1
1
回答
如何开始操作R中的scRNA seq .txt矩阵?
这是
scRNA-seq
数据,我试着用seurat来处理它并绘制一些图表。然而,每次我尝试加载它,它都不能工作,它说我需要一个arcode文件。
浏览 5
提问于2022-06-02
得票数 0
1
回答
如何在R中打印一个函数的多个二项式测试结果
binom_test_2b = function(spot_id, cluster_id, marker_gene){intersection = inner_join(gene_spotselected_cells_one_gene)/sum(gene_count_out_cluster) result
浏览 9
修改于2021-03-31
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回答
无法从Github安装“Velocyto.R”
我是一个在R的初学者,试图分析我的
scRNA-seq
数据与天鹅绒细胞,R在R工作室。
浏览 4
修改于2020-06-08
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1
回答
( R) Counts.csv.gz文件到Seurat对象
但是,我发现一些公开可用的处理
scRNA-seq
data仅以counts.csv.gz文件的格式共享。
浏览 20
修改于2020-10-23
得票数 0
1
回答
Python、海运、使用statannot的统计分析看起来不太正确
add_stat_annotation data = pd.read_excel('Z:/DMF/GROUPS/gr_Veening/Users/Vik/
scRNA-seq
浏览 3
修改于2021-06-09
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1
回答
什么是零充气层,如何在火把上实现?
其目的之一是简化
scRNA-seq
数据集的可视化。VASC主要分为三个部分:(1)编码器网络;(2)译码器网络;(3)零充气层。VASC的创建者在这里解释了这一点,不过这里是。
浏览 1
提问于2019-05-15
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