无法从Github安装“Velocyto.R”

Question

我是一个在R的初学者，试图分析我的scRNA-seq数据与天鹅绒细胞，R在R工作室。按照velocyto教程，我试着安装velocyto.R，如下所示：

library(devtools)
install_github("velocyto-team/velocyto.R")

但是，出现了一个错误：

ERROR: compilation failed for package 'velocyto.R'

removing 'C:/Users/USER/Documents/R/win-library/3.6/velocyto.R'
Error: Failed to install 'velocyto.R' from GitHub:
(converted from warning) installation of package ‘C:/Users/USER/AppData/Local/Temp/RtmpukpRFl/file37346a812b86/velocyto.R_0.6.tar.gz’ had non-zero exit status

是否有人要面对上述同样的问题并最终成功地解决它？我急需帮助！

谢谢

Answer 1

正如您的错误日志所显示的那样，您可能使用C:/...。根据velocyto的自述文件，这个包似乎只在带有C++11、Open MP、boost、igraph和hdf5c++库的unix风格的系统上运行。

这可能是问题所在:阅读velocyto的GitHub问题#40，也许您需要在WSL下运行它？