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我正在尝试在我的机构的数据库中表示遗传变异数据。我们发现了与之相关的参考等位基因、突变等位基因、染色体、位置、名称、可能的效应、基因、基因中的位置等遗传变异。
浏览 0提问于2012-06-25得票数 3
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如果我有一个维度如下的矩阵，该矩阵包含一组遗传变异之间的计算距离，我想创建一个新矩阵或将PosDiff矩阵修改为仅距离小于或等于500,000的距离。
浏览 0修改于2017-06-01得票数 0
第一个数据帧是遗传变异、它们的标识符以及它们在染色体上的位置的列表。第二个是基因列表，其中每行中的列指定了基因在染色体上的起始和终止位置。我想看看哪些遗传变异属于由start_20和stop_20 cols表示的基因‘范围’。一个遗传变异可能落入一个以上的基因范围内。例如，这里的单核苷酸多态性"rs1“将映射到基因A和基因B。
浏览 0修改于2016-06-03得票数 0
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我已经保存了54个遗传变异的cox回归模型(使用生存包)的系数。我已经分别为7个国家完成了这一工作，现在我希望使用rma包中的metafor函数将它们合并在一起。
浏览 3修改于2016-04-25得票数 0
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我有一个包含很多遗传变异信息的数据框架列表。现在我想从这些DFs中提取一些cols。一个问题是，在某些DFs中，学院的名称不同。是否有解决这一问题的推荐方法？
浏览 4提问于2021-01-07得票数 0
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我有> 50K的SNP，每一个都有他们解释的遗传变异和一个位置(染色体和位置)。我需要每个染色体每100万个碱基对(位置)对SNP进行子集，以创建我们所谓的1Mb窗口。
浏览 1修改于2015-10-15得票数 0
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当无法获得完整的DNA序列时，例如通过基因分型获取数据时，需要使用其他方法……”嘿，伙计们，我只想提醒大家，我正在讨论SNP的使用
浏览 0修改于2021-02-13得票数 0
我有一张遗传变异表，每一行都代表一个病人，病人身上有这种变异，以及该变异是在一个病例中还是在一个对照中。
浏览 0提问于2020-01-21得票数 1
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我有几个列的遗传变异数据，目前我的变体/谱线排列错误，需要按染色体分类。我尝试过几种方法来做这件事，使用类似问题的答案，但没有一种有效，主要是给我空文件。
浏览 0修改于2020-03-12得票数 0
有两个不同的遗传密码，一个是原始的，另一个是遗传变异的。该算法将根据两种遗传密码的不同，得出所给数据的结论。但首先，我需要对数据进行预处理，然后才能对算法做出结论。
浏览 7修改于2020-06-19得票数 1
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有两个不同的遗传密码，一个是原始的，另一个是遗传变异的。该算法将根据两种遗传密码的不同，得出所给数据的结论。但首先，我需要对数据进行预处理，然后才能对算法做出结论。
浏览 4修改于2020-06-18得票数 0
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这些是VCF文件(https://en.wikipedia.org/wiki/Variant_Call_Format)，它有一个标题，然后是遗传变异，所以我需要保留每个文件的标题，并将它们重新附加到染色体特定的标题
浏览 17修改于2021-01-03得票数 0
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背景
我正在模拟一个基于冬眠的系统中的基因组特征(基因、转录本和外显子)和遗传变异。
浏览 2提问于2016-09-01得票数 6
更新首先，我用read.vcfR读取了这个文件，下面是代码：vcf <- read.vcfR("/mnt/lustre
浏览 0修改于2018-03-09得票数 0
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我有一个带有多个分号分隔标记的INFO列的由制表符分隔的遗传变异文件：
Chr Start End Ref Alt ExAC_ALL ExAC_AFR ExAC_AMR ExAC_EAS
浏览 0修改于2018-06-19得票数 2
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有两个不同的遗传密码，一个是原始的，另一个是遗传变异的。该算法将根据两种遗传密码的不同，得出所给数据的结论。但首先，我需要对数据进行预处理，然后才能对算法做出结论。
浏览 5修改于2020-06-15得票数 2
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