回答情况：
提问时间：
问题标签：
我想将dotPlot(seqinr)函数应用于包含3个蛋白序列的载体中的两个蛋白质序列的每一个组合。这意味着我想得到3个dotPlot图表在最后。
浏览 3修改于2017-03-11得票数 1
回答已采纳
1回答
基本上，我有一个基因数据集，其中行是基因，列是蛋白质折叠的连续时间点。我需要一个函数来过滤来自整个数据集的其他人的某个阈值的基因，而不仅仅是某些载体。
浏览 0修改于2015-12-06得票数 1
回答已采纳
我有一个命名列表，它代表了一组生物路径，其中的名称是路径名，列表中的载体是属于该通路的蛋白质。0000026", "GO:0000032", "GO:0000033"))pairs <- t(combn(names(ann), 2))
对于每一对路径，我都希望得到所有可能的蛋白质组合，其中蛋白质#1在路径#1，蛋白质#2在路径#2中。理想的输出是一个两列矩阵的列表，其中第1列包含路径#1中的蛋白质，第2列包
浏览 1修改于2018-06-25得票数 1
回答已采纳
004 0.5 37.4 0.7 38.2 0.5 35.5和白蛋白相似的载体，并且通常用plot_ly(df, x ~crp1, y ~alb1,
浏览 3修改于2022-11-07得票数 0
我有两个由蛋白质pdb id组成的载体，如1A3BA，3B5RE，1WYX5。我想比较一下这两个向量中的蛋白质列表是否相同。有什么不同呢？我试着在C++中使用stl算法，但是总是有段错误！
浏览 0提问于2012-12-11得票数 0
回答已采纳
2回答
translate(seq, frame = 0, sens = "F", numcode = 1, NAstring = "X", ambiguous = FALSE)我如何将我的DNA序列转换成一个单一字符的载体
浏览 2修改于2016-05-30得票数 2
回答已采纳
：我试图通过比较4个细胞系的核心/全蛋白质组实验中发现的核蛋白的比例，来比较一种蛋白质组学方案的效率，该方法可以丰富染色质。为了做到这一点，我使用人类蛋白质图谱来注释蛋白质的亚细胞位置，并比较从染色质富集到全浓缩的核蛋白。然而，染色质富集的方案是一维猎枪，而整个蛋白质组数据是2D-猎枪，50 %。在外行方面，这意味着整个/核心蛋白质组数据是一个更昂贵的实验，在更高的覆盖范围内完成。因此，看绝对比例是没有意义的，因为在整个蛋白
浏览 2修改于2017-11-13得票数 0
回答已采纳
我有一个向量，每个元素代表一个人为了满足他/她每天蛋白质、碳水化合物、脂肪和fiber..etc的摄入量而应该吃的不同食物的#克。此外，我还希望能够调整每种食物在每个载体中的含量:例如
默认(早餐50%蛋白质或更低，10%脂肪或更高，40%碳水化合物或更低，晚间小吃70%蛋白质或更低，25%脂肪或更高，5%碳水化合物或更低)。这样我就可以调整，让一个人早餐吃大量蛋白质，在锻炼之前吃大量碳水化合物。
浏览 1修改于2017-04-01得票数 0
蛋白质-蛋白质相互作用网络是已知的。它是一个无向图。网络的每一行都是这样的(蛋白质2-蛋白质6)，它代表蛋白质2和蛋白质6之间的相互作用。在这个网络中，一些蛋白质的功能是已知的，功能相似的蛋白质往往是相关的。众所周知，蛋白质的一部分是与癌症相关的蛋白质。但绝大多数蛋白质是癌症相关蛋白还是非癌症相关蛋白尚不清楚。您如何使用已知的癌症相关蛋白来预测该
浏览 2修改于2016-01-09得票数 1
我在fasta中有5000条蛋白质序列，其中有假想的蛋白质和功能蛋白，我怎样才能把假想的蛋白质和推测的蛋白质区分开来。假设的蛋白质在标题中有假设这个词，所以我希望我能用一些命令来区分它们。像这样的事情
( PSP
浏览 0修改于2017-07-22得票数 1
2回答
我有JSON格式和csv格式的蛋白质-蛋白质相互作用数据。我想利用这些数据进行网络可视化。数据属性:蛋白质名称、蛋白质组、蛋白质类型、蛋白质来源节点、蛋白质目标节点
有人能为这样的数据建议良好的网络可视化吗？它是如何处理蜂巢情节的？
浏览 0提问于2014-11-15得票数 2
我在一个数据分析环境中处理蛋白质。任何给定蛋白质的可用数据都是可变的。我希望能够从更简单的父类构建蛋白质类。每个父类将特定于我可用的数据层。
不同的项目可能有不同的可用数据层。我想为蛋白质编写简单的类，这些类包含与特定数据层相关的所有变量和方法。然后，对于任何给定的项目，能够编译一个特定于项目的蛋白质类，该蛋白质类继承自相关的数据层特定蛋白质类。此外，每个特定于数据层的蛋白质类都需要类似的特定于数据层的链类、残基类和原子类。它们都是构建块。原子被用来构
浏览 3提问于2013-01-17得票数 1
Necrosis Factor Receptor Tumor Necrosis Factor Receptor 11A 11.5 5.1 130 166 25 1.9
第一列和第二列包含蛋白质名称，第八列包含每个蛋白质对之间的“距离”分数。我想删除包含重复蛋白质对的行，只保留距离最小的对(第8列中的最低值)。这意味着对于蛋白A-蛋白B对，除了距离得分最低的那一个之外，我想删除所有的出现。即使蛋白质名称被交换(在不同的列中)，这对蛋白质也被认为是重复的。这意味
浏览 0提问于2011-09-30得票数 1
回答已采纳
1回答
我想把肽序列和给定的蛋白质序列相匹配。我每种蛋白质都有很多肽，其中一些也是重叠的。对于输出，我想要一个新的文件，它也告诉我序列在蛋白质中的位置。蛋白质例子：
EHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKGELPDFQDGTKRVIQEGRGELPDFQDGTKVESPGTYQQDPWAMTDEEK
VL
浏览 4提问于2015-03-18得票数 0
1回答
我的数据是一个蛋白质-蛋白质相互作用数据集与源蛋白节点，目标蛋白节点，蛋白质类型，蛋白质名称和蛋白质组。我想用蜂巢图来做一个网络可视化。
帮帮忙吧。我对编程很陌生。
浏览 2提问于2014-11-15得票数 1
回答已采纳
2回答
我正在使用随机森林的r包根据蛋白质对的氨基酸序列来预测它们之间的距离，主要关注的是距离较近(距离较小)的蛋白质。我的训练数据集由10k对蛋白质和它们之间的实际距离组成。然而，很少有蛋白质对(小于0.2%)之间的距离很小，问题是经过训练的随机森林在预测距离较大的蛋白质之间的距离时变得非常准确，而对于距离较小的蛋白质来说则非常糟糕。我试图在我的训练数据中对距离很大的蛋白质进行下采样，但结果仍然不好。我更感兴趣的是紧密的蛋白质(那些距离很小的蛋白</
浏览 0提问于2013-03-21得票数 2
回答已采纳
2回答
我有一个带有基因名称的载体，其中载体中的几个元素包含多个基因名称，用逗号分隔。我如何分离这个载体的元素，并获得一个长的载体，每个基因名称作为载体的一个单独的元素？我尝试过strsplit，但这只是给了我两个或更多的基因名称作为单独的字符串，但仍然在载体的相同元素中……/Frida
genes = c("PGD", "CDA", "MROH7,TTC4", "PGM1
浏览 0修改于2014-05-22得票数 2
我正在做一个涉及蛋白质相互作用网络聚类的项目，在相互作用的蛋白质图上做了几个聚类算法，我有点困惑，现在我要如何去看看所创建的集群是否有用。为了将其纳入上下文，蛋白质相互作用网络代表了蛋白质与参与相同生物过程或共同履行特定功能的相互作用蛋白质群之间的成对连接。这是很重要的，因为许多蛋白质和相互作用是没有标记的，因此，如果某个特定的标记蛋白在一个簇中，就可以推断它们的功能。与典型的有监督机器学习任务不同的是，标记数据集可以显示正确分组的数目，因此没有迹象表明蛋白</
浏览 1提问于2015-12-10得票数 0
我有一堆蛋白质，来自一种叫做蛋白质网的东西。现在那里的序列有某种ID，但它显然不是PDB id，所以我需要用其他方法找到它。对于每种蛋白质，我都有其氨基酸序列。所以我的问题是，如果我有蛋白质的氨基酸序列，我如何找到蛋白质PDB id？(这样我就可以下载蛋白质的PDB文件)
浏览 32提问于2021-03-12得票数 1
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号