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也有三个终止密码子(也称为“停止”密码子)；如果遇到这些密码子中的任何一个(由核糖体)，所有翻译结束和蛋白质终止。UUU", "UCU", "UAA", "AUG" =>蛋白："Methionine", "Phenylalanine", "Serine"注意到停止密码子"UAA"终止翻译，而最终的蛋氨酸不被翻译成蛋白质序列了解更多关于维基百科的蛋白质翻译的信息
这就是我们的任务。我最初是
浏览 0修改于2020-05-20得票数 1
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所以，我正在用一种酶来消化一个蛋白质序列(为了引起你的好奇心，我称之为Asp-N)，它在由B或D编码的蛋白质之前，以一个单字母编码的序列进行切割。我的实际分析使用String#scan进行捕获。
浏览 3修改于2011-05-19得票数 9
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我试图使用生物巨蟒下载由特定机构排序的生物体列表中的所有蛋白质。我有有机体的名称和与每个有机体相关的生物项目；具体来说，我希望分析在最近的基因组序列中发现的蛋白质。我想大量下载蛋白质文件，用efetch尽可能友好的方式下载。，所以使用研究和尝试一次提取每一种蛋白质是不现实的。对于我感兴趣的所有生物体，我不能简单地在它们的核苷酸数据库中找到它们的基因组序列，并下载“蛋白质编码序列”。
如何才能以一种不会使NCBI服务器超载的方式获得我想要的这些蛋白质序列？我希望我能在NCBI的web浏览器
浏览 3修改于2014-07-14得票数 4
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我有一个蛋白质列表，就像df1中给出的我需要使用一个蛋白质表将这些名称更改为ID，它们的关联方式在Protein.name = c("Gen1", "Gen2", "Gen3"),
Protein.product = c("id1", "id2" , "id3&quo
浏览 2修改于2020-09-04得票数 0
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我在fasta中有5000条蛋白质序列，其中有假想的蛋白质和功能蛋白，我怎样才能把假想的蛋白质和推测的蛋白质区分开来。假设的蛋白质在标题中有假设这个词，所以我希望我能用一些命令来区分它们。像这样的事情
( PSPTOA )的假想蛋
浏览 0修改于2017-07-22得票数 1
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我已经解决了这个生物信息学问题多肉的部分，虽然我觉得有点笨拙。特别是，我把fasta信息处理成了Biopython's SeqIO.parse()将接受的形式，它会尖叫着进行优化。'''to solve this problem: http://rosalind.info/problems/mprt/impo
浏览 0提问于2017-09-06得票数 4
因此，我正在使用一个PyMOL脚本来查找蛋白质(在上找到)的表面残基。我需要它来编写一个文本文件，其中包含当前在PyMOL会话中选择的蛋白质的名称。就我所搜索的而言，我找不到PyMOL命令来获取所选蛋白质的名称。有没有更有PyMOL经验的人有关于如何实现这一点的想法？
谢谢
浏览 0提问于2014-02-06得票数 1
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我想把肽序列和给定的蛋白质序列相匹配。我每种蛋白质都有很多肽，其中一些也是重叠的。对于输出，我想要一个新的文件，它也告诉我序列在蛋白质中的位置。蛋白质例子：
EHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKGELPDFQDGTKRVIQEGRGELPDFQDGTKVESPGTYQQDPWAMTDEEK
VLELDPALAPV
浏览 4提问于2015-03-18得票数 0
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我正试图创建一个程序，使用以下字典将用户输入的DNA序列翻译成3个可选的蛋白质序列(密码是键，氨基酸是值)：
{'TGA': '*', 'GCG': 'A', 'CGA': 'R', 'ATA': 'I
浏览 3修改于2016-11-14得票数 1
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如何根据小序列(<=40残基)在初始蛋白质中的位置来表示它们的分布？
我有几个序列如下。第一列是当前序列的编号。第二列是起始位置，第三列是当前序列在其初始蛋白质中的停止位置。，它们来自不同长度的蛋白质。考虑到蛋白质并不都有相同的长度，将这些序列映射到横坐标上，看看它们是更多地位于蛋白质的开头，还是更多地在蛋白质的末端，或者更多的在中间，最好的想法是什么？我写了一个算法，根据这些序列的起始和终止位置，将它们映射到横坐标上，但问题是，由于蛋白质具有不同的长度，因此无法
浏览 1修改于2014-04-03得票数 0
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我正在尝试在一个大学研究项目的java应用程序中显示蛋白质序列比对。我的想法是在每个细胞中使用一个带有JLabel的JTable来保存序列中的氨基酸。
浏览 2修改于2012-06-27得票数 2
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有七个不同的蛋白质存储在一个文件中，根据它们的残基名称。每种蛋白质都有不同的序列长度。现在，我需要计算每个蛋白质的质量中心，生成一个时间序列数据，我知道如何处理单个蛋白质，但不需要多个蛋白质系统。对于单一蛋白质，我可以这样做：import numpy as np
u1 =--
1016LEU SC112660 50.716 14.69
浏览 6修改于2022-03-01得票数 2
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我正在做一个实验，测量网络中蛋白质对之间的相互作用。我也有一个积极和消极的对照，以显示“最少”和“最多”的相互作用量，蛋白质可能有可能。例如，如果阳性对照有"50“和负控制"5”(我使用Miller单位)，那么如何使用颜色梯度来显示我正在研究的蛋白质-蛋白质相互作用的强度。
这个链接“在网络上可视化表达式数据”会是一个合适的协议吗？
浏览 4提问于2022-07-11得票数 0
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我是编程新手，但我需要提交一个测试来回答这个问题：
为了形成蛋白质，必须形成一条氨基酸链。这些氨基酸由3个碱基对组成。一个例子是'CUU‘制造亮氨酸('Leu')氨基酸。记住，有终止密码子UAG，UGA，UAA，它们本质上结束了蛋白质合成的形成。这给你留下了一连串的氨基酸，这些氨基酸将被折叠成蛋白质，有望成为蟒蛇脑组织的一部分！
浏览 0提问于2020-03-20得票数 0
我是一个巨大的Python noobie，试图完成从DNA到RNA再到氨基酸的转换代码-一旦找到'Met‘蛋白质，它就应该开始打印蛋白质，一旦找到' stop’蛋白质，就停止打印，我希望它返回一个列表
浏览 31修改于2021-10-17得票数 1
FASTA文件包含一个单一的蛋白质序列。第二个FASTA文件包含第一个文件中序列的片段。计算每个序列的分子量，并使用这些序列来确定是否有可以覆盖整个蛋白质序列的片段的组合，而没有这些片段的重叠。我试着做了下面的脚本，但是我还没能把它全部放入一个有效的代码中seqstotal_weight
我已经把完整片段的重量，测试身体是否我试图使用功能。
浏览 1修改于2019-08-02得票数 1
我想下载所有的HeteroComplex蛋白质PDB I，它们都在蛋白质数据库中(由两种或更多种不同类型的链组成的所有PDB I)。
浏览 2修改于2019-10-22得票数 1
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