DNA到蛋白质的Python函数

Question

我是一个巨大的Python noobie，试图完成从DNA到RNA再到氨基酸的转换代码-一旦找到'Met‘蛋白质，它就应该开始打印蛋白质，一旦找到' stop’蛋白质，就停止打印，我希望它返回一个列表。但不知何故，它只在包含此DNA字符串时才打印Met？我想知道我哪里错了..。

编辑:谢谢！

Answer 1

for i in range(protein_start, sequence_num, 3):
    codon = codon_list[rna[i:i+3]]
    if (codon == "STOP"):
        return protein // or a break statement if more code
    else:
        protein.append(codon)

Answer 2

你只打印当它是condon == 'Met‘时，你可以做一个小的欺骗和检查语句。

passed_Met = false
for i in range(protein_start, sequence_num, 3):
    codon = codon_list[rna[i:i+3]]
    if (codon == "STOP"):
        return protein // Returns the proten when 'STOP' is found

    elif (passed_Met):
        protein.append(codon)

    elif (codon == "Met"):
        protein.append(codon)
        passed_Met = true

Answer 3

我认为这里缺少的主要部分是，最终您需要将elif语句转换为else语句，该语句涵盖所有其他氨基酸。在当前代码中，仅当序列中有Met时才追加。

在您的第一个函数中，您可能想要更改：

def transcribe(str):

    dna = 'ATGC'
    rna = 'UACG'
    transcription = str.maketrans(dna, rna)
    return (str.translate(transcription))

作为第二点，您可能还想要更改

rna = translate(dna) to rna = transcribe(dna)