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拆分数据矩阵
我有一个数据矩阵,其中包含100,000行的值,这些值对应于几种细胞类型的
甲基化
值。我想在集群热图中直观地显示
甲基化
的变化。为了使数据更易于管理,我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
浏览 0
修改于2013-06-11
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1
回答
USB2.0不在Ubuntu上工作,但在GRUB中工作得很好
当我连接一个键盘时,dmesg会沿着这些思路吐露出一些东西:usb
7-3
: devicedescriptor read/64, error -32usb
7-3
: new full-speedUSB device number 7 using ohci-pci usb
7-3</em
浏览 0
修改于2017-07-27
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2
回答
标识特定范围内的值数
我有一个数据表,列名为单元格类型(20种细胞类型),然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其
甲基化
值(介于0到1之间)。确定
甲基化
值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999,0.1-0.1999,0.2-0.29999等,每种细胞类型的
甲基化
值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即
甲基化
值在上述范围内的基因数目)。
浏览 1
修改于2017-09-10
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2
回答
获取不在数据库中的范围
EventEnd Days Rooms DayStartsCISC 1110 14:00:00 16:00:00 Monday
7-
对于SelectedDate (2014年9月19日),该表应返回: Room FreeTimeStart FreeTimeE
浏览 6
修改于2014-10-24
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1
回答
在具有协变量的两个数据帧之间进行一系列t检验。
我有两个数据,一个是病人样本的协变量,另一个是样本的
甲基化
数据。我需要做t检验来比较按性别划分的
甲基化
数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian
甲基化
因此,如果我想对前8个样本的
甲基化
数据和性别进行一系列的t检验,我是否可以指定:t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)?
浏览 0
修改于2018-10-17
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4
回答
加法器如何执行无符号整数减法?
例如,在4位二进制系统中,对于有符号整数,我们有
7-3
=0111-0011=0111+1101=(1)0100,括号中的1是进位位。根据带符号整数的溢出规则,我们知道没有溢出,因此结果是正确的。但是,对于无符号整数,如果我们计算
7-3
会发生什么?如果我们使用上面提到的相同方式:然后,根据无符号整数的溢出规则,由于进位而存在溢出。换句话说,0100是错误的,因为存在溢出。
浏览 1
修改于2011-11-09
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2
回答
使用两个矩阵进行聚类
Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达;Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的
甲基化
状态。是否有可能同时基于表达和
甲基化
信息对基因和/或样本进行聚类?
浏览 3
修改于2016-05-27
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3
回答
来自DMwR包的时间错误:无效的‘knnImputer’参数
数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字,整数),另一列用于
甲基化
值(也是数字,双精度),许多
甲基化
值缺失。这个想法是,距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能,但我选择不包括这些功能)。
浏览 66
提问于2016-03-27
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1
回答
使用regex (简易)查找括号缩略词的完整形式
以下是一个例子- CIMP - CpG岛
甲基化
表型 问题是,我已经能够使用re.findall('(\(.*?
浏览 2
修改于2020-06-20
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1
回答
两个矩阵R中每个对元的样条回归系数
我正在用一种方法来找到
甲基化
调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因
甲基化
与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器,我得到了418个基因的子集,其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出
甲基化
和每个基因表达的b样条三次回归系数。
浏览 1
提问于2015-06-24
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1
回答
如何为数据帧的特定列创建一行SD值?
这是探针β- DNA
甲基化
的值。
浏览 7
修改于2022-01-21
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1
回答
根据特定条件选择矩阵中的多个观测值
我有一个β
甲基化
值矩阵,维度如下:485577x894。 我想确定哪些β
甲基化
值> 0.5,这样我就可以从进一步的分析中排除它们。在这样做的时候,我需要数据保持矩阵格式。
浏览 2
提问于2014-01-24
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2
回答
枢轴表上的计算字段
这是我的桌子1
7-3
3 2-45 4-67 3-19 5-6B2="
7-3
" ---> =VALUE(LEFT(B2;FIND( "-";B2 ) - 1 )) = 7N FirstTag2 3 3
浏览 3
提问于2015-05-27
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1
回答
如何基于回归连续变量~β(使用CpGassoc)找到差异
甲基化
区域(例如,使用Champ中的探针套索)
我在人类样本上进行了450K Illumina
甲基化
芯片,并想要寻找连续变量和β之间的关联,并对其他协变量进行了调整。为此,我使用了R中的CpGassoc包。我还想根据重要的CpG站点搜索差异
甲基化
区域。然而,Champ软件包和其他用于450K DMR分析的软件包中的探头套索函数总是假设需要找到DMR的2组。我没有两组,而是这个连续变量。
浏览 2
提问于2015-09-25
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1
回答
去
甲基化
有多深?
我取消了一个OLTP数据库在DWH中的使用。目前我正在取消学习小组的职务。 换句话说,当你去有机化的时候,你会走多深?
浏览 2
修改于2019-05-09
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5
回答
去正规化对查询、连接和响应时间有什么影响?
在去
甲基化
之前,我想知道这将对以下方面产生什么影响:看来,如果我没有弄错的话,所有这些都将是缩减的
浏览 10
提问于2009-06-15
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2
回答
Server表中行间差异的求和
即( (
7-3
) + (10-9) + (16-14) + ....) 这是最好的方法
浏览 3
修改于2022-03-10
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4
回答
排列成对的数字,使相邻成对的成员相等
我的项目是7-4、11-8、11-11、1-0、4-2、7-5、10-8、
7-3
、10-5、7-2、9-8、12-8、0-0、11-10我尝试迭代项目数组,并获取与我要查找的数字匹配的第一个值,但没有得到最长的链。
浏览 27
修改于2016-09-05
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8
回答
求数组中每对整数的绝对差和
例如:给定a[]= {2,3, 5, 7 };它必须比O(n^2)做得更好。
浏览 2
修改于2011-05-02
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1
回答
Sql查询变更
FROM -- use your table name instead of the VALUES construct ('09:00:00','12:30:00' ,'
7-
3', '20140919'), ('14:00:00','16:00:00
浏览 2
提问于2014-10-28
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