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1
回答
连接
外显子
序列并在其间插入Ns
第一个文本有两个
外显子
,第一个被称为MSTRG.1.1_1_30,长度为30个字母。第二个
外显子
(片段)有20个字母。相反,另一个转录本有三个
外显子
,每个
外显子
有30,10和15个字母。,所以对于转录本1,因为有两个
外显子
,所以只有一个合并的序列是由
外显子
1和2组合产生的。对于转录本2,如果存在更多的
外显子
,结果将是两个组合,
外显子
1和2,以及
外显子
2和3,依此类推,从而得到n-1个组合,其中n是
外显子
的数量。除此之
浏览 13
提问于2019-07-04
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1
回答
构建人类基因所有可能
外显子
的虚拟文库制备
我想为人类基因中所有可能的
外显子
创建一个文库。这不能通过Ensembl中提供的gtf文件来实现。因为我想要创建所有可能的
外显子
组合以及
外显子
和内含子的mRNA。
浏览 21
提问于2021-02-08
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1
回答
离子激流全
外显子
组测序的读出模拟器
我使用的平台是离子AmpliSeq整个
外显子
组测序。我想知道有没有离子激流平台的阅读模拟器。
浏览 0
修改于2018-05-24
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1
回答
ClojureScript重复
外显子
试剂加载项
我正在做一个项目,它依赖于试剂,以及ReactTransitionGroups。在我加入ReactTransitionGroups之后,出于某种原因,我不得不包括react。但在那之后,我无法制作我的uberjar,因为一个重复的外部错误。 [cljsjs/react-with-addons "15.4.2-2"
浏览 2
提问于2017-03-22
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2
回答
如何在改造中使用NullPointer
外显子
空指针异常有问题。两天我什么也做不了。请帮帮我。NullPointer在排队。这是个问题,但我不知道该怎么做。 Log.d("AsanaPROGRAM LOGS", BuildConfig.FLAVOR + a.getName());这里是JSON: "name": "Easy Pranayama
浏览 5
修改于2015-09-24
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1
回答
在基因中寻找
外显子
/内含子边界
我想通过一个基因,从每个feature.type =='mRNA'获得一个包含
外显子
/内含子边界的10 go长序列的列表。
浏览 2
修改于2015-01-04
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1
回答
目的-C
外显子
和类型胡枝子符号
我对目标-c是新的。我有以下几点:typedef NSString* HPS_FORMELEMENTTYPE; extern HPS_FORMELEMENTTYPE Label;@end未定义的体系结构符号i386:"_ImageView",引用于: 有人能解释一下发生了什么,以及如何解决吗?我的基本要求是有一个枚举,其中
浏览 1
修改于2013-06-18
得票数 2
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1
回答
计算每个转录本的平均
外显子
数
我想要能够计算,
外显子
,,,每,,转录,在我的文件中的平均数量。...; transcript_id "ENST00000488147.1要获得每个转录本的平均<
浏览 2
修改于2021-04-05
得票数 2
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1
回答
我希望grep“
外显子
”在我的".tsv“文件中,只要该文件的第13列包含”p“。
注:由于也有
外显子
变异,没有氨基酸变化,我想过滤
外显子
变异,其氨基酸变化提到了第13栏。例如,可以同时将变体定义为
外显子
、UTR和内含子(基于所使用的不同数据库)。 我要过滤真正的
外显子
变体,因为一些
外显子
变体没有氨基酸变化(p.*)。
浏览 0
修改于2022-01-19
得票数 -5
1
回答
从多序列比对中提取和连接
外显子
TTAATTCTTTTTGGTATTCTCACCCTTACTGCTGTCGTGGTCGCCATTGTTGCCGTTTTT我认为应该有一个很简单的方法来解决这个问题,有可能使用第一列中的信息,加上
外显子
号
浏览 1
修改于2016-05-02
得票数 2
4
回答
一种检测
外显子
/内含子/非编码区基因组位置的方法?
我想测试一下这种形式的一组基因组位置:chr6:139580853-139581090我想知道它们是否位于UTR、内含子、
外显子
或基因间序列中我假设每个已知的遗传元素(如
外显子
)都定义了基因组位置(每个染色体上基因组中的起始-结束位置)。我知道这对于
外显子
和内含子是正确的,例如Ensemb1对基因组中的每个
外显子
都有in :参见的示例。我想用上面的位置列表查询这些位置的数据库,如果两者之间有重叠(理想情况下,我应该能够指定
浏览 8
修改于2013-11-20
得票数 5
1
回答
在GRCh38完整
外显子
序列上运行DeepVariant
我可以使用标准的完整
外显子
序列模型吗?
浏览 4
修改于2020-10-05
得票数 0
1
回答
修改gff坐标而不更改CDS和
外显子
坐标
我试图改变基因和mRNA在我的gff中的坐标。我希望像CDS和mRNA这样的其他条目不受我的代码的影响,并且仍然在我的输出中列出。我使用的代码给了我语法错误。需要知道如何才能得到所需的输出。Chr01 xyz gene 210262 212819 . - . ID=Chr01.g13944Chr01 xyz CD
浏览 0
修改于2022-10-27
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2
回答
C++,文件I/O...我有一个.txt文件,我必须扫描它的
外显子
和内含子,并将它们写到单独的文件中
程序将从输入file中顺序读取DNA数据,当它遇到
外显子
和内含子时,它会将它们写出到单独的file中。发现的第一个fi
外显子
将写入exon1.txt,发现的第二个
外显子
将写入exon2.txt,依此类推...类似地,发现的第一个fi内含子将被写入到intron1.txt中,发现的第二个内含子将被写入到intron2.txt中,依此类推……
外显子
是一个密码子序列,总是以密码子ATG开始,以以下密码子之一结束: TAA、TGA或TAG。任何不以这些密码子开始或终止的序列都是一个内含子.While,它扫描数据中的
外显子</em
浏览 1
修改于2013-04-13
得票数 0
1
回答
计算bam文件中雪茄串的每个
外显子
的大小。
我有一个bam文件,我想计算每个
外显子
的大小:例如,我有6根雪茄串。
浏览 7
提问于2022-02-15
得票数 0
2
回答
(即DNA
外显子
转录)
我试图找到一种方法来读取列表列表中的项目,在一组三项中,并找到由3项(密码子)组成的组合来确定片段的开头,并找到另一种组合来查找片段的末尾(停止密码子)。清单1: XXXXX-开始-兴趣片段-停止-XXXXXXX这是一个更具体的例子:停止密码子:标记gene_2= 'GGCCATGAGTAACGCATAGGGCCC gene_3=GGGCCCATGACGTACTAGGGGCCCATGC
浏览 3
修改于2020-07-31
得票数 0
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2
回答
如何解决基片“std”中的重复lang项(“肌
外显子
”取决于):“panic_impl”与sr-io的冲突
我在我的基板1.0运行时模块(基于node-template)中使用了一个外挂机箱,它的编译错误为如果我正确地理解了消息,那么如果开发人员想要包含依赖于已经在std中实现的std特性的外部板条箱,我认为这可能
浏览 0
修改于2019-12-18
得票数 6
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4
回答
如果下两行匹配,则使用awk打印行+下两行
我有一个文件,它有一个文本条目,然后下面的几行是相关的
外显子
。有时这可能是一个
外显子
,因此是一个后续行,有时有'n‘个
外显子
,所以'n’后续行如下所示:2 Cufflinks exon 8259370 8259803 只有当抄本后面有两个
外显子
时,我才会打印出抄本和相关的
外显子
行。对
浏览 0
修改于2017-08-02
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2
回答
如何创建一个列/向量,根据另一个向量的标识对行进行顺序排序。R
我有一个包含所有
外显子
和
外显子
所属基因的数据框架。当前的
外显子
名称并不代表它们的顺序。我已经根据起始基因组位置对它们进行了排序,所以现在我只需要生成一个列,根据基因给它们一个序号。数据帧顶部的示例:GENE1,"789",GENE1,"102",GENE3,"542",这就是我想要的数据框的样子: 基因<
浏览 18
提问于2021-05-01
得票数 0
2
回答
使用python折叠exons
我正在尝试根据包含
外显子
所属基因信息的另一个文件,从一个文件中折叠
外显子
。Exon1 Gene4Exon3 Gene8另一个文件是包含
外显子
名称和序列的快速文件,例如:ACGTCGATTTCGATCAACGTCGATTTCGATCAACGTAAACGTCGATTTCAGCGGATCACCCACGTCGATTTCGATCAACGTAA 因此,我的目
浏览 1
修改于2017-03-26
得票数 2
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