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我有一张miRNAs和DNA (基因)表。每个miRNA调控许多不同的基因。我们的目标是列出10个共同调控基因最多的前10位miRNAS。正如你所看到的那样，每个miRNA调控多个基因。有1498个miRNAs调控~30-40个基因。目标是创建一组由每个miRNA调控的基因，然后以某种方式查看每个集合与其他集合共享的值，计数共享值，按计数排序共享数据，并选择前<e
浏览 6修改于2015-02-18得票数 1
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因此，我有一个非常长的转录因子数据框架( TF )和一长串必要的基因列表，到目前为止我所做的是确定一个由TF调控的基因是否是一个必需的基因。TF的调控。AdiY 85 AidB 17 AllR 9AraC 19 6
浏览 1修改于2016-06-29得票数 0
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我正在用一种方法来找到甲基化调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因甲基化与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器，我得到了418个基因的子集，其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出甲基化和每个基因表达的b样条三次回归系数。0.4182180 0.03288906 0.02046130paciente10-0.76250 0.4378333
浏览 1提问于2015-06-24得票数 1
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(mid是miRNA的ID，gid是基因的ID )。到目前为止，我有以下内容，但我不确定这是否是正确的方法。任何帮助都将不胜感激。AND (SELECT mid, gid FROM miRNA JOI
浏览 1修改于2015-02-18得票数 0
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我正在设计一个细胞周期时间序列中高度调控基因的热图。"white", high = 结果是这样的，
我的值是日志转换的，我想知道是否有一种方法来排列我的行，使它们按它们在时间序列中的峰值位置排列(即，所有在0处表达最高的基因被聚在一起，在30处表达最高的基因被聚在一起，等等)。
浏览 5提问于2016-03-01得票数 0
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</ul></body>上面文件的输出如下所示(缺少没有复制的要点)：{“基因1”：1，“遗传2”：1，“基因3”：7，“遗传4”：7，“遗传5”：1}{“
浏览 3修改于2014-04-11得票数 2
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在我运行这个基因并得到每个基因的结果之后，我对这些基因做一些加权乘法(这样排名越好的基因就能得到最多的倍数)。问题是，我不知道怎样才能使人口再次减少到X。在交叉基因时，什么是常见的做法？编辑：
对健身功能中的1
浏览 0修改于2014-06-23得票数 0
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我有一个数据集，它是一个大的字符向量(1,024,459个元素)，由基因ID组成。看上去：[1] 1024459[1] "1" "1" "1" "1" "1" "1" "1" "10""10" "100"
每个<
浏览 4提问于2014-12-22得票数 2
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假设有两个长度为20的二进制向量p1和p2，它们代表两个亲本个体的基因型。p1 <- sample(c(0,1), 20, replace=T)然后前10个数字代表一个染色体上的等位基因，第二个10个数字代表第二个染色体上的等位基因，即我们正在寻找10个双等位基因位点。现在我想要生成所有可能的基因型，让父母双方的后代个体都能拥有。我如何在重组的假设下创建这些序列(即，
浏览 3提问于2018-12-02得票数 0
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Integer> initgenome = new ArrayList<Integer>(Collections.nCopies(4990, 0));
array_unshift(initgenome, 10我正试图构建5000条基因基因组。我想要4990个基因的基因为0，而前10个基因的基因为1。我在网上搜索，我发现一个网站说array_unshift会把我想要的任何东西转移到数组的前面。我不知道如何检查这段代码实际上是将101 s
浏览 2修改于2016-10-31得票数 1
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我(一个新手，R)分析了两个处理对基因表达的影响的随机研究。在基线和1年后，我们评估了5个不同的基因。基因折叠计算为1年时的值除以基线值。示例基因: IL10_BL IL10_1Y IL10_fold
基因表达是作为一个连续变量来测量的，通常在0.1到5.0之间。100名患者被随机分为他汀类药物或饮食疗法。我想做的是：-Y轴应该以95%的置信限显示基因的平均表达-X轴应该是绝对的，以基线、1年和折叠值为5个基因，按治
浏览 0修改于2014-08-11得票数 3
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我有一个数据文件，其中包含了像P95、P104等编码的基因。这个数字反映了基因名称列表中的顺序。
在这种情况下，如何将dataframe中的P##转换为基因名称？UPD:这里有一个示例dataframe和一个基因列表：
gene <- c("(P10->UP)", "(P2->UP, P9->UP)", "(P10->UP, P3->
浏览 5修改于2022-01-04得票数 1
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我一直在研究SQL 2008和SQL 2008 R2中的资源调控器。我认为我只能真正地使用它来限制某些会话所使用的CPU和内存。但是，我觉得很奇怪，因为如果我使用一个受治理的会话在另一个表/会话上创建一个块，那么使用资源调控器是否会使情况变得更糟呢？假设我在默认池中的查询(允许100%的CPU/内存)在10秒内执行，同时在3个表中保存块，因为我在优化它方面做得很差。
现在假设我被管理为10%的CPU和10%的内存，并且运行相同的查询。我非常希望通过配置资源调控器来避免
浏览 0提问于2011-06-23得票数 0
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我有一张具有以下结构的桌子A NM_1 1 10
A NM_1从根本上说，这个表格由一个列组成，列上了所有人类基因。第二列包含抄本名称。相同的基因可以有多个转录本。第三列包含一个外显子号。每个基因由多个外显子组成。第四列包含每个外显子的长度。所以我主要想做的是为每个基因找到最长的转录本。这意味着，当每个基因(列基因)有多个转录本(列转录本)时
浏览 4修改于2015-04-25得票数 0
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我有两个数据:一个是SNPs及其位置的列表，另一个是基因列表及其起始坐标和结束坐标。使用dplyr，我想添加一个列到SNP数据框中，该列具有每个SNP所在的基因的名称(即SNP的位置位于相同的染色体上，位于该基因的起始坐标/结束坐标之间)。如果一个SNP不属于任何基因坐标，它应该在基因列中得到"NA“。SNP与基因之间的染色体数目必须匹配。SNP数据文件：01 5 C T
01 10 G
浏览 2修改于2019-06-05得票数 2
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我有10个fasta文件(每个文件包含来自10个样本的20个基因序列)。我想创建20个文件，特定于10个样本中的每个基因。我按照以下步骤在标题中使用file_name提取基因：我成功地为每个样本中的每个
浏览 20修改于2017-08-22得票数 2
14 a n 1414 a 4 14 4
每一个样本有一个额外的列，使基因表达中最接近的匹配对所有基因都有影响但是额外的列必须基于所有的基因，而
浏览 1修改于2022-10-26得票数 1
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我必须绘制一些基因表达值的热图。换句话说，热图的每一行代表10个基因的平均值，这样：
row3 -> gene_expression以此
浏览 5修改于2014-03-21得票数 0
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