在R中使用LIMMA时使用的数据格式

Question

有没有人能给我举个小例子，说明我导入到LIMMA中的微阵列数据在导入R时应该是什么样子？

我正试图从微阵列样本中破译差异调控基因。谢谢。

Answer 1

一个带有规范化表达式级别的制表符(或其他任何)分隔文件，另外还有一个带有探测集in (或其他基因标识符)的列和一个定义样本的标头。

为了获得所需代码的示例，我建议您检查geo2r生成的脚本(可从任何GEO数据集中访问)，并阅读limma vignette。