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该数据库描述了物体(不同物种的基因)之间的对称和可转移关系。如果物种1的X基因与物种2的Y基因相关，而物种2的Y基因与物种3的Z基因相关，则物种1的X基因与物种3的Z基因相关。请注意，每个基因id只存在于一个物种中。
说明:列species1包含少数“中心”物种(如人类)。因此，如果我想找到一种与老鼠基因Card9相匹配的老鼠基因，有两种可能：(一)人类基因组中没有匹配，在这种情况下，gene1列中
浏览 2提问于2020-03-20得票数 1
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</ul></body>上面文件的输出如下所示(缺少没有复制的要点)：{“基因1”：1，“遗传2”：1，“基因3”：7，“遗传4”：7，“遗传5”：1}{“基因1”
浏览 3修改于2014-04-11得票数 2
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我所拥有的:数据栏是基因(基因a，基因b，基因c，等等)。行是在两种条件下的单元簇(集群a_ctrl、集群a_exp、clusterb_ctrl等)。谢谢你的帮助！
浏览 3修改于2022-10-14得票数 0
我想构建一个堆叠的条形图，x轴代表基因组(或仅仅是有机体)的数量，y轴代表基因组的确切数量中出现的基因簇的数量。因为我知道这些基因来自哪些有机体，我希望每个条形图都能显示每个基因组在构建这个条形图中的影响。； 1)第一列显示了每个基因簇所涉及的基因组数量； 2)第二列表示聚类中的基因数量； 3)列3-5代表来自不同基因组的基因的具体名称； "*“表示该基因组的簇中没有基因
浏览 17修改于2019-05-24得票数 0
我有这样的场景：2- WCF数据服务#2，具有实体框架的实体。我的客户应该只调用WCF数据服务#2，公开更多，然后函数与自己的实体也与来自WCF数据服务#1的实体一起工作。换句话说，我在WCF数据服务#2上调用了一个服务操作，它返回了WCF数据服务#1上的一个实体，但不幸的是它失败了。
有什么建议吗？
浏览 0提问于2012-08-20得票数 0
我有一个很大的基因列表，我想查找同源基因。 我还有一个很大的数据框架，里面有潜在的同源数据。此Dataframe的第十列继承了一个数字，用于描述管件。数字越大越好。我正在尝试遍历这个庞大的基因列表。 对于列表中的每个独特基因，我希望选择最适合的同源基因。 输出应该是每个基因一行的数据帧，描述最适合的同源基因。
浏览 13提问于2019-06-11得票数 0
我有几个数据帧(最多12个)，其中有多个列，显示了基因随时间的变化(例如5个时间点)以及其他基因如何与这种变化相关(即，其他基因也以与数据中其他基因相关的方式下降或上升)。该分析一次提取每个基因，使用该基因作为参考，并针对每个单独的基因进行测试，以查看这些基因随时间的变化模式是否与第一个参考基因相关。这对每个单独的基因都是重复的。因此，以一个数据帧为例，结果如下所示。第一列包含用作参考基因的
浏览 16修改于2019-01-27得票数 0
我对使用Cytoscape分析基因之间的分子关系很感兴趣，我一直在阅读Cytoscape网站上的教程，但我不确定如何使用Cytoscape进行“一对多”比较。例如，每个基因通常被指定为“节点”，其“边”对应于与其他基因的交互作用。Cytoscape使用“属性”将节点或边名称映射到特定的数据值。在一个简单的“一对一”比较中，您可能有一个包含10个基因及其表达值的列表，这样每个基因的属性将是1)基因的名称和2)表达值。看起来很清楚Cytoscape将如何使用这些类型的数据来构建交互网络。但是
浏览 1提问于2020-06-02得票数 1
我想知道某些基因是否聚集在一起。现在，我已经有了一个基因列表，以及它们的起始和停止位置，我已经知道如何计算这些基因之间的距离。问题是我不知道如何考虑染色体的转换。你不能测量1号染色体上的基因和2号染色体上的基因之间的距离。
我想像这样计算距离:基因2的起始位置--基因1的停止位置。然后，这些基因之间的距离。但是我该如何解释:当你到达下一个染色体时，R码获取了第2号染色体上一个基因的起始位置，但是一个基因在第1号染色体
浏览 0提问于2019-01-09得票数 1
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为了手动修改我拥有的.gff文件，我需要在我的动物的FASTA格式的基因组中找到我的基因的起始位置(即序列中的#碱基是什么？)。我有这个基因的序列。我如何尽可能容易地做到这一点(这不是一种其基因组在互联网上很容易获得的动物)？ 我所拥有的: FASTA格式的基因组；包含该有机体基因组注释的GFF文件(需要彻底更新)；该基因的序列。 谢谢!
浏览 19提问于2019-01-15得票数 0
每当我尝试使用WCF数据服务( WCF数据服务5.0版)时，代理生成都会失败，并显示以下错误消息：有什么想法吗？数据服务是使用VS2012、实体框架5.0和WCF数据服务5.0构建的。我也尝试过安装WCF数据服务5.3安装程序，但遇到了同样的问题。
浏览 2修改于2013-07-05得票数 0
我有一个数据框架- df -与基因组数据。最后一首歌有两个字母变体。，into=c(“等位基因”，"allele2"))
分离(df，等位基因，into=c(“等位基因</e
浏览 0修改于2018-02-06得票数 0
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HxC4233)，table 2 (20000 lines)由两列组成，其中包含类似于表1的基因id，但是有一些重复的(所以不是唯一的)具有相应基因长度的列。我想要创建一个查询，由表一中所有唯一的基因ids和表二中相应的基因长度组成。但我只希望拥有独特的基因长度，而不是所有的基因长度。
我已经尝试编写一个命令来获得我想要的输出。但我正在接收所有的基因标识作为输出。id而只提取其相应的基因长度？DISTINCT命令不考虑具有不同长度的相似基因</
浏览 2修改于2020-11-30得票数 0
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在我运行这个基因并得到每个基因的结果之后，我对这些基因做一些加权乘法(这样排名越好的基因就能得到最多的倍数)。问题是，我不知道怎样才能使人口再次减少到X。在交叉基因时，什么是常见的做法？编辑：
对健身功能中的100个基因进行运行
浏览 0修改于2014-06-23得票数 0
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我想知道如何使用t.test或pairwise.t.test对基因组合进行多重比较。首先，如何比较基因1与基因3、基因3与基因4等所有组合？第二，如何才能将基因1的组合与其他基因进行比较？
浏览 10修改于2017-09-20得票数 3
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我正在研究2600+基因组，希望研究不同群体的基因组、基因和基因间的特征。如果分类组只有很少的代表，就没有问题。在分类组具有多个基因组的情况下，我应该在什么基础上删除相似的基因组，以便从每个分类组中只获得几个代表。我是否应该使用lenght或GC%或其他特征来删除基因组-例如，如果两个基因组的GC%变异小于1%，我将删除它。类似这样的事情。请建议接受的方式，并友好地解释原因以及。tuberculosis alone which have
GC% ran
浏览 1提问于2013-09-27得票数 0
我使用R中的glm函数来确定个体等位基因对疾病的风险，这是一项病例对照研究。当我运行glm函数时，R会自动将数字最低的等位基因或字母顺序的等位基因作为参考等位基因。我需要根据每个基因和最中性的等位基因(即在病例和对照组中分布均匀的等位基因)来改变这一点。我该怎么做。
浏览 3提问于2019-11-20得票数 0
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我对突变技术很熟悉，并且在我的项目中实现了一些，但是我从来不知道在实现一个突变算子时应该有多少基因发生突变。让我们以边界突变为例，我们随机选择一个基因，并将其替换为该基因的下界或上限。然而，我不确定我是否应该仅仅突变1基因，还是多变异一些基因。因此，我认为有两种方法是可行的：
浏览 1提问于2016-10-25得票数 1
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