遍历大列表，找到与基因最匹配的同源物

Question

我有一个很大的基因列表，我想查找同源基因。

我还有一个很大的数据框架，里面有潜在的同源数据。此Dataframe的第十列继承了一个数字，用于描述管件。数字越大越好。

我正在尝试遍历这个庞大的基因列表。

对于列表中的每个独特基因，我希望选择最适合的同源基因。

输出应该是每个基因一行的数据帧，描述最适合的同源基因。

Answer 1

Tidyverse解决方案，假设您有一个列，每个基因都有一个gene_id，并且拟合分数在一个名为score的列中

library(tidyverse)

df %>% group_by(gene_id) %>% filter(score == max(score)) %>% ungroup()