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全血管的单细胞测序进行数据分析时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker（包括免疫细胞，内皮细胞，成纤维细胞等等），为什么？
浏览 382提问于2022-01-09
我正在使用Pagesus软件包分析我的单细胞RNA测序数据。我遇到了以下错误，使用飞马软件包进行单细胞分析。
浏览 7修改于2022-04-19得票数 -2
我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中分析R上的单细胞RNA测序数据的材料。如果您对教程有任何指导或建议，我将非常感谢。
谢谢!
浏览 12提问于2020-04-14得票数 0
我有一个单细胞RNA测序矩阵'dta‘与一些细胞命名为KK00 (KK00.xx)。我想取消所有这些细胞。所以我写了dta.s <-subset(dta, !
浏览 4提问于2022-01-18得票数 0
我正在使用新的Seurat 3软件包来分析单细胞测序数据。我已经合并了18个Seurat对象，并将单独的标识符保存在meta.data中。
浏览 3修改于2020-09-26得票数 2
我目前正在处理单细胞测序的巨大计数矩阵.为了做到这一点，我简单地使用了split，所以我松开了矩阵的头。2.是否有更好的方法将这些庞大的计数矩阵分割成多个部分？(我不能通过R来实现，因为我没有足够的RAM，如果我试图导入整个矩阵，R就会崩溃)
浏览 6提问于2020-02-17得票数 0
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这与单细胞RNA测序数据分析有关.
是否有可能创造一个小提琴图，在X轴上有基因，Y轴上有归一化表达，而不是X轴上的簇或细胞类型，Y轴上有基因，而选择分析的细胞是用户定义的？
浏览 11修改于2022-10-01得票数 0
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我正在处理非常高维的生物计数数据(单细胞RNA测序，其中行是细胞ID，列是基因)。
每个数据集都是一个单独的平面文件(AnnData格式)。每个平面文件可以按各种元数据属性进行细分，包括细胞类型(如:肌肉细胞、心脏细胞)、亚型(例如:肺数据集可分为正常肺和癌变肺)、癌症分期(例如:第1阶段、第2阶段)等。
浏览 11提问于2022-06-07得票数 0
该函数是为单细胞RNA测序数据编写的，但原则上，任何功能都是可行的。在最后转换它，因为它使一些下游代码更干净。{ } }
scRNAseq_data[i, ] <- apply(scRNAseq_data[i, ], 2,
浏览 0修改于2022-10-02得票数 1
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观测序列的长度不是固定的。我尝试了一些HMM包，如Matlab的HMM工具箱和Kevin的库。它们似乎都要求用户指定转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小。我知道，对于隐马尔可夫模型(HMM)，转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小取决于隐态数和观测序列的长度。例如，如果：observations = ('walk', 'shop', 'clean')
状态数为2，观察长度为3，则跃迁概率为
浏览 0修改于2018-07-20得票数 1
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如下所示：通过合并元素的索引，将可观测序列的每个元素投影到新的可观测序列序列中，然后将可观测序列的可观测序列转换为仅从最新的可观测序列产生值的可观测序列
浏览 5提问于2016-08-05得票数 25
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假设有一系列的观测，例如[1,2,3,5,5,5,2,3,2,3, ..., 3, 4]。我试图在Scikit中使用HMM的当前实现--学习预测这个观察序列的下一个值。关于这个我有两个问题。给定n个观测序列和这些序列的n+1观测序列，HMM能用来预测一个新的n观测序列的(n+1)th观测吗？如果是的话，怎么做？
从文档中我无法很好地理解这一点。我找到了一个可能的，但它没有指定如何在Scikit中使用HMM --学习预测序列中的下一个值。
浏览 5修改于2017-05-23得票数 1
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基因数不同的单细胞数据如何整合进行后续分析？
r 语言、生物基因、数据分析、数据
我下载的单细胞数据集中，每个单细胞数据的基因数彼此都不相同，这种数据集该用什么方法进行整合？？上面几个数据中 每个数据中的基因数都在2万个左右 但是基因数不一致 那么这四个数据该如何整合起来做后续分析？用harmoy吗？具体如何操作？
浏览 112提问于2025-12-15
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对于双哈希实现的探测序列，下列哪一项不是正确的？两个键可以有相同的探针序列C.探测序列的元素是哈希表的可能键我相信A，B和D是正确的，所以我认为C是正确的答案。所有存储的密钥都有相同的h2。插入每个键需要探测所有先前插入的键的插槽
我相信这个答案是C。我不完全确定这个问题，所以给出一个解释会很好。
浏览 1修改于2016-11-23得票数 2
我需要建立一个数据库来保存从DNA测序实验中获得的数据。2)有几个数据点为空专栏: bed1，bed2...bed10000..。
行: sample1，sample2..。
浏览 0修改于2020-05-10得票数 1
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嗨，我正在使用公共数据pbmc来练习单细胞分析，我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从R开始，遇到困难，有人能给一个指针吗？非常感谢代码: RidgePlot(pbmc3k.final，features = features，ncol = 2)
FetchData.Seurat中的错误(对象=对象
浏览 3修改于2022-08-11得票数 0
我遵循了“单细胞RNA测序的生物导体工作流程:规范化、降维、聚类和谱系推断”的代码。但是，在预处理步骤中，函数assayData()出现了错误。library(gam)register(SerialParam())
NCORES <- 2acc=GSE95601&format=file&file=GSE95601%5FoeHBCdiff%5FCufflinks%5FeSet%2ERda
浏览 3提问于2020-06-08得票数 0
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