将dataframe或R对象的列名添加到另一个dataframe

Question

我目前正在处理单细胞测序的巨大计数矩阵.

所以，为了用R和我的8GB内存来分析它们，我不得不把它们分成几个子矩阵。

为了做到这一点，我简单地使用了split，所以我松开了矩阵的头。

所以，我想把它们加回R或者找到一个更好的方法来更有效地分割它们。

我的问题是：

1.如果有一个名为heathers的对象，其中存储了所有的列名，那么是否有一种方法可以有效地将该对象添加到dataframe中？我试过rbind，但这并不能真正解决问题。

2.是否有更好的方法将这些庞大的计数矩阵分割成多个部分？(我不能通过R来实现，因为我没有足够的RAM，如果我试图导入整个矩阵，R就会崩溃)

Answer 1

1. 如果有一个名为heathers的对象，其中存储了所有的列名，那么有什么方法可以有效地将这个对象添加到dataframe中呢？我试过重新绑定，但这并不能真正解决问题。

您可以将标题添加到这样的数据文件中：

dataframe <- data.frame(c("a", "b","c"),
                        c("d", "e", "f"))

headers <- c("header_1" , "header_2")

names(dataframe) <- headers

dataframe

  header_1 header_2
1        a        d
2        b        e
3        c        f

1. 您可以使用bash来执行这些任务.

Answer 2

您可以使用data.frame函数访问和更改names的列名：

df <- data.frame(foo = 1:5, bar = 6:10, opt = 11:15)

original_names <- names(df)


original_names 

返回：

[1] "foo" "bar" "opt"

并指定新的名称：

names(df) <- c("new_col1", "new_col2", "new_col3")

现在：

df

返回：

  new_col1 new_col2 new_col3
1        1        6       11
2        2        7       12
3        3        8       13
4        4        9       14
5        5       10       15

并“撤销”重命名：

names(df) <- original_names

df又有了它的原始名称：

  foo bar opt
1   1   6  11
2   2   7  12
3   3   8  13
4   4   9  14
5   5  10  15