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基因数不同的单细胞数据如何整合进行后续分析？
r 语言、生物基因、数据分析、数据
我下载的单细胞数据集中，每个单细胞数据的基因数彼此都不相同，这种数据集该用什么方法进行整合？？上面几个数据中 每个数据中的基因数都在2万个左右 但是基因数不一致 那么这四个数据该如何整合起来做后续分析？用harmoy吗？具体如何操作？
浏览 111提问于2025-12-15
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单细胞分析seurat完成后，如何提取多样本数据集data？
r 语言、数据分析、data、对象、数据
单细胞分析后，构建了seurat对象，使用的是多样本数据，想要提取data做cellchat分析，但是data按样本分开了，想问如何全部提取合并？
浏览 120提问于2024-11-22
我正在使用Pagesus软件包分析我的单细胞RNA测序数据。我遇到了以下错误，使用飞马软件包进行单细胞分析。
浏览 7修改于2022-04-19得票数 -2
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嗨，我正在使用公共数据pbmc来练习单细胞分析，我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从R开始，遇到困难，有人能给一个指针吗？非常感谢代码: RidgePlot(pbmc3k.final，features = features，ncol = 2)
FetchData.Seurat中的错误(对象=对象
浏览 3修改于2022-08-11得票数 0
全血管的单细胞测序进行数据分析时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker（包括免疫细胞，内皮细胞，成纤维细胞等等），为什么？
浏览 382提问于2022-01-09
我正在尝试查看已发布的数据集，以便为我自己的项目检查基因表达。我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中分析R上的单细胞RNA测序数据的材料。这是我试图访问的数据谢谢!
浏览 12提问于2020-04-14得票数 0
我使用存储在单细胞实验分析中的单细胞RNA-seq数据，使用R中的pheatmap对~ 11.3000个表达基因(而不是聚类样本)进行层次聚类，以显示数据的异质性。
浏览 5提问于2018-05-22得票数 2
我用Seurat软件包分析了六个单细胞RNA-seq数据集。这6个数据集是通过每一个不同的10倍运行获得的，然后结合批处理效应-通过Seurat函数"FindIntegrationAnchors“进行校正。同时，在6个数据集中，数据1、2、3和4属于“未处理”组，而数据5和6属于“处理”组。我合并了所有的6个数据集与批处理校正，但我也需要比较的特点“未处理”与“处理”。如何将数据1,2,3和4分组为“未处理组”，数据
浏览 15修改于2020-07-16得票数 0
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您好，可以请教您一个小小的问题嘛，我最近也在做单细胞，用Seurat把cluster分完了，可是我想要把cluster8和16单独拿出来，在进行分析，这个代码要怎么写呢，万分感谢
浏览 770提问于2021-05-10
我正在使用新的Seurat 3软件包来分析单细胞测序数据。我已经合并了18个Seurat对象，并将单独的标识符保存在meta.data中。
浏览 3修改于2020-09-26得票数 2
尊敬的世界各国专家： 您好，我正在使用Seurat分析集成的单细胞RNA-seq数据。我确认了Dimplot的默认配色方案，如下所述。 show_col(hue_pal()(16)) ? 它成功地更改了Dimplot中的颜色，但此更改后的调色板不适用于下游分析(例如DoHeatmap中的簇标签栏)。,'12'='#A4DFF2','15'='#4B4BF7','13'='#AC8F14',
浏览 3233修改于2020-09-13得票数 0
这与单细胞RNA测序数据分析有关.
是否有可能创造一个小提琴图，在X轴上有基因，Y轴上有归一化表达，而不是X轴上的簇或细胞类型，Y轴上有基因，而选择分析的细胞是用户定义的？
浏览 11修改于2022-10-01得票数 0
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我是R的新手，并试图安装Seurat来分析我的基因组单细胞数据。但是，我想使用Seurat ()，但是在安装软件包时遇到了困难。
浏览 3修改于2019-11-29得票数 1
我的工作是R分析单细胞RNA序列数据。我目前正在尝试将QC数据添加到我的SingleCellExperiment (sce)对象中；mito_genes、ribo_genes和ERCC_genes包含由执行的这些特定基因的行位置将QC数据添加
浏览 25修改于2021-02-21得票数 0
我正在使用一个名为"Seurat“的R包进行单细胞RNA-Seq分析，我试图从插槽名'data‘中删除seuratobject (s4类)中的几个基因。这个对象中还有几个插槽，它们存储与插槽‘数据’相关联的信息。插槽‘数据’在行中有基因名，在列中有单元ID，其基因的表达值对应于矩阵中的每个单元。我希望根据唯一的基因名称删除整行，但在对象中保留结果。
浏览 4修改于2020-08-05得票数 1
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我正在构造一个8列的行，需要在apache中以单细胞形式创建指数数据(Number)，而不需要使用paragraph.break。
浏览 3提问于2019-11-04得票数 0
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这是angular2的数据表，由Valor软件编写。
我试图通过鼠标单击和拖动(！重要-单细胞内)选择单细胞中的文本。
浏览 3修改于2017-04-14得票数 0
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是否有可能在一个交叉表单元中放置多个度量？例如，在一个单元格中放置一个2x2表，并在表的每个单元格中删除一个度量值？我尝试过这样做，而值只是跨行重复。
浏览 2提问于2020-06-05得票数 0
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