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回答
单细胞
分析
中的叠加条形图
ggplot() + geom_bar(aes(y = percentage, x = TBD, fill = TBD), data = charts.data, stat="identity") 我想为我的
单细胞
分析
创建一个条形图
浏览 3
修改于2020-01-20
得票数 0
0
回答
单细胞
分析
seurat完成后,如何提取多样本数据集data?
r 语言
、
数据分析
、
data
、
对象
、
数据
单细胞
分析
后,构建了seurat对象,使用的是多样本数据,想要提取data做cellchat
分析
,但是data按样本分开了,想问如何全部提取合并?
浏览 120
提问于2024-11-22
1
回答
错误帕伽索斯包: TypeError: highly_variable_features()得到了一个意外的关键字参数'consider_batch‘
我正在使用Pagesus软件包
分析
我的
单细胞
RNA测序数据。我遇到了以下错误,使用飞马软件包进行
单细胞
分析
。
浏览 7
修改于2022-04-19
得票数 -2
0
回答
RNA velocity图的箭头长短有什么含义吗?
velocity
单细胞
测序
分析
方法Velocity的箭头长短有什么含义吗?
浏览 247
提问于2022-01-19
0
回答
基因数不同的
单细胞
数据如何整合进行后续
分析
?
r 语言
、
生物基因
、
数据分析
、
数据
我下载的
单细胞
数据集中,每个
单细胞
数据的基因数彼此都不相同,这种数据集该用什么方法进行整合??上面几个数据中 每个数据中的基因数都在2万个左右 但是基因数不一致 那么这四个数据该如何整合起来做后续
分析
?用harmoy吗?具体如何操作?
浏览 111
提问于2025-12-15
1
回答
Seurat数据可视化
嗨,我正在使用公共数据pbmc来练习
单细胞
分析
,我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从R开始,遇到困难,有人能给一个指针吗?非常感谢代码: RidgePlot(pbmc3k.final,features = features,ncol = 2) FetchData.Seurat中的错误(对象=对象
浏览 3
修改于2022-08-11
得票数 0
1
回答
所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker(包括免疫细胞,内皮细胞,成纤维细胞)?
数据分析
全血管的
单细胞
测序进行数据
分析
时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker(包括免疫细胞,内皮细胞,成纤维细胞等等),为什么?
浏览 382
提问于2022-01-09
1
回答
单细胞
:如何把想要的cluster提取出来,再进行
分析
?
您好,可以请教您一个小小的问题嘛,我最近也在做
单细胞
,用Seurat把cluster分完了,可是我想要把cluster8和16单独拿出来,在进行
分析
,这个代码要怎么写呢,万分感谢
浏览 770
提问于2021-05-10
1
回答
更改R中pheatmap中树状图的线宽
我使用存储在
单细胞
实验
分析
中的
单细胞
RNA-seq数据,使用R中的pheatmap对~ 11.3000个表达基因(而不是聚类样本)进行层次聚类,以显示数据的异质性。
浏览 5
提问于2018-05-22
得票数 2
1
回答
如何从GEO数据库中提取
单细胞
RNA测序数据?
我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中
分析
R上的
单细胞
RNA测序数据的材料。如果您对教程有任何指导或建议,我将非常感谢。 谢谢!
浏览 12
提问于2020-04-14
得票数 0
1
回答
( R) Seurat:样品分组
我用Seurat软件包
分析
了六个
单细胞
RNA-seq数据集。如何将数据1,2,3和4分组为“未处理组”,数据5和6分组为“处理组”,然后执行下游
分析
? 谢谢。
浏览 15
修改于2020-07-16
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1
回答
单细胞
内的Cognos
分析
多重测度
是否有可能在一个交叉表单元中放置多个度量?例如,在一个单元格中放置一个2x2表,并在表的每个单元格中删除一个度量值?我尝试过这样做,而值只是跨行重复。
浏览 2
提问于2020-06-05
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1
回答
如何在指定的网格中绘制多个UMAP?
我正在使用新的Seurat 3软件包来
分析
单细胞
测序数据。我已经合并了18个Seurat对象,并将单独的标识符保存在meta.data中。
浏览 3
修改于2020-09-26
得票数 2
1
回答
如何更改Seurat Dimplot的默认配色方案?
尊敬的世界各国专家: 您好,我正在使用Seurat
分析
集成的
单细胞
RNA-seq数据。我确认了Dimplot的默认配色方案,如下所述。 show_col(hue_pal()(16)) ? 它成功地更改了Dimplot中的颜色,但此更改后的调色板不适用于下游
分析
(例如DoHeatmap中的簇标签栏)。,'12'='#A4DFF2','15'='#4B4BF7','13'='#AC8F14', '14&
浏览 3233
修改于2020-09-13
得票数 0
1
回答
用定义的细胞群绘制X轴上基因的小提琴图
这与
单细胞
RNA测序数据
分析
有关. 是否有可能创造一个小提琴图,在X轴上有基因,Y轴上有归一化表达,而不是X轴上的簇或细胞类型,Y轴上有基因,而选择
分析
的细胞是用户定义的?
浏览 11
修改于2022-10-01
得票数 0
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3
回答
安装Seurat -R
单细胞
基因组工具包
我是R的新手,并试图安装Seurat来
分析
我的基因组
单细胞
数据。但是,我想使用Seurat (),但是在安装软件包时遇到了困难。
浏览 3
修改于2019-11-29
得票数 1
2
回答
如何分割和合并错误分割的区域
也有一些
单细胞
被过度分割。我可以用什么方法来合并过度分割的
单细胞
并进一步分割未分割的细胞簇? 编辑:判断单元格是否已过或未分割的标准将通过确定单元的面积是否在正常大小的某一平均范围内来完成。
浏览 5
修改于2016-06-15
得票数 2
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1
回答
如何从单元格中提取所需的文本
如下面所示,我在
单细胞
中有这些数据,所以我只想要车号。 📷
浏览 0
修改于2021-02-24
得票数 0
2
回答
如何在slotname @data中从seuratobject中筛选基因?
我正在使用一个名为"Seurat“的R包进行
单细胞
RNA-Seq
分析
,我试图从插槽名'data‘中删除seuratobject (s4类)中的几个基因。
浏览 4
修改于2020-08-05
得票数 1
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1
回答
文本选择不适用于单个单元格-NG2表
重要-
单细胞
内)选择
单细胞
中的文本。在多个单元上运行的是)它在Chrome上工作,而不是在Mozila FireFox上工作。但现在它在Chrome上也不起作用。 详情见下文。
浏览 3
修改于2017-04-14
得票数 0
回答已采纳
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