回答情况：
提问时间：
问题标签：
我想要阅读基因组中特定区域的所有呼叫。与基因型无关(等于参考基因组或交替、编码或非编码区)。假设所有的基因组都被测序了。我应该看下面哪个表？我正在使用谷歌BigQuery基因组学数据，需要解释以下文件扩展名之间的差异：*.genome_calls *.variants *.multisample_variants *.single_sample_genome_calls
浏览 4提问于2017-12-07得票数 0
6回答
我研究的是生物学，特别是DNA，通常是基因组测序所产生的数据大小有问题。我知道在不同的计算机上，整数的大小是不同的，但它仍然比四种选择具有更多的信息存储可能性。
浏览 3提问于2014-06-25得票数 4
1回答
特别是，这些直方图是沿着人类基因组片段的基本呼叫。X轴上的每个点都是组成DNA的四个含氮碱基(A，C，T，G)之一，y轴代表碱基能够被“调用”(或被测序仪识别，以便对基因组进行排序，这只是确定基因组中每个碱基的同一性)的次数。如果你以前见过双螺旋，这意味着测序仪不能识别出螺旋的一半。基因组的某些区域比其他区域更难描述。在>=100级别上，具有大量基本呼叫的基本(或x个数据点)能够被确定地识别。
浏览 1修改于2016-01-20得票数 2
回答已采纳
我有一个定制的参考基因组，gene.fa和18个床文件。我正在考虑从参考基因组中复制/粘贴感兴趣序列的区域，并将其对齐以生成我的床文件。问题是，我的参考基因组是一个三聚体，所以这个序列被重复了三次，在比对中会出现错误。
有更好的方法吗？我是新的生物信息学和测序，所以我可能是过度思考这个问题。
浏览 12提问于2022-05-25得票数 0
回答已采纳
我只需要从NCBI (GenBank(full)格式)下载完整的基因组序列。我对“全基因组”而不是“全基因组”感兴趣。gatunek, property='complete genome' )#title='complete genome[title]')结果我只得到了基因组的小片段我知道如何通过NCBI网站手动操作，但这非常耗时，我在那里使用的查询：
escherichia[orgn]
浏览 4修改于2013-08-27得票数 3
这是一个问题:用一个包含G元素的列表来表示G大小的基因组，其中每个元素都包含有关该位置的相关信息，例如，该位置的核苷酸被测序了多少次。若要模拟一次测序过程，请执行以下步骤：·将列表中的所有元素设置为0(标记每个核苷酸已被测序0次)。·随机选择L大小R读的起始位置，并对每次读更新所包含的核苷酸序列的次数进行测定。
浏览 2提问于2017-10-11得票数 0
回答已采纳
3回答
我最近获得了MinION的USB基因组(DNA)测序器，令我失望的是，它似乎没有在Ubuntu中正常工作。
我正在使用Ubuntu的12.04版本。
浏览 0修改于2012-06-11得票数 11
下面是全国范围内提供基因测序的实验室列表。如果最终的结果是你得到了一个90 3+的硬盘驱动器，你的基因组中有一个3+的十亿个碱基对，那么它们各自花费多少钱的原因是什么呢？
浏览 0修改于2016-06-06得票数 1
来自项目网站：
RabDB是一个数据库，用于探索Rab家族的小GTPases，这是真核生物内膜系统的关键调节因子，由RabDB分类管道在测序的真核基因组中预测。
浏览 0修改于2017-12-19得票数 0
回答已采纳
我确实考虑过基因组测序和预测代谢途径。我想知道其他人认为什么是最好的？或者，可能没有一种特定的语言，而是几种最适合生物信息学工作的语言，这些工作数学繁重，需要处理大量数据。
浏览 3提问于2010-06-08得票数 9
回答已采纳
考虑了随机读取的基因组测序问题。如果G是整个序列的长度，L是读的长度，n是读的次数，那么覆盖被定义为nL/G。现在，如果我们想要50%的原始长序列被至少一个片段覆盖，我们需要多少覆盖率？我认为y是1，因为这个问题说，50%的原始长序列至少要被一个片段覆盖，这意味着这些碱基至少要被测序一次。专家们，你能指点我吗？
谢谢。
浏览 1修改于2011-12-08得票数 2
回答已采纳
我正在使用R Gviz软件包来绘制我的深度测序数据。我在研究酿酒酵母基因组。当我把染色体表意图添加到我的图中时，着丝点就不会被绘制出来。genome = "sacCer3", chromosome = "chrI")
相反，当我使用人类基因组做同样的操作时
浏览 1修改于2019-06-30得票数 0
全血管的单细胞测序进行数据分析时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker（包括免疫细胞，内皮细胞，成纤维细胞等等），为什么？
浏览 382提问于2022-01-09
我正在尝试使用circos软件描述我的寄生虫的全基因组序列(WGS)数据。
我想要描述的其中一个元素是参考基因组中我没有我的寄生虫测序数据的区域。
浏览 1修改于2017-08-23得票数 1
下面是一个FASTA文件的示例：(注意，序列之间有一条额外的行，在原始fasta文件中不是这样)
全基因组NC_001501.1肠杆菌噬菌体phiX184 sensu
全基因组
浏览 2修改于2017-06-28得票数 4
全!我正在开发我的第一个网络刮刀，当给它一个"CitedBy“页面时，它从PMC抓取作者的名字、URL和纸名。titles_list.append(title)
我在这里列出的前两个，
浏览 2提问于2016-03-15得票数 1
回答已采纳
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号