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NiftyNet
ValueError:维度-1必须是>= 0
NiftyNet
version 0.2.2INFO:
niftynet
: Image reader: loadingwindow instance INFO:
niftyne
浏览 2
修改于2018-04-30
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1
回答
用
NiftyNet
进行分类
我正在尝试使用
NiftyNet
运行分类。我想要跑步训练,我有一个训练集,图像和一个课程分配给他们,如image1 ->癌症和image2 -> no癌。最终,我的问题是,如果只有图像和每个图像所属的类,那么我是否能够使用
NiftyNet
运行分类。我是否可以使用图像作为输入,并输出向量(如0 0 1 0),用于
NiftyNet
的训练?如果是这样的话,您能给出一个如何在.ini文件中创建分类部分的示例吗? 很抱歉这个问题太长了。
浏览 2
提问于2018-10-24
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使用Tensorflow 1.9导入
NiftyNet
时出错
当我导入
NiftyNet
时,我得到了以下错误消息。$ python[GCC 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-28)] on linux2 set_logger() File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/
niftynet
浏览 3
修改于2018-08-16
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1
回答
NiftyNet
体积采样
我用
NiftyNet
来解决分割问题。要从卷中获取样本,可以使用此选项Sample_per_volume。
浏览 1
提问于2018-04-02
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1
回答
Niftynet
数据扩充设置
我在我的项目中使用'
NiftyNet
‘。对于数据增强,我注意到在配置文件中有'rotation_angle','scaling_percentage‘和'random_flipping_axes’。
浏览 4
提问于2018-03-11
得票数 1
1
回答
NiftyNet
net_segment没有属性“_logger”
当我尝试对从PyPI安装的
NiftyNet
执行快速入门说明时,在运行net_segment时得到以下错误: set_logger() File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/
niftynet
在安装了Simp
浏览 7
修改于2018-05-29
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1
回答
NiftyNet
插值阶
在
NiftyNet
框架中-配置文件中interp_order param的用途是什么?在文件中有非常简短的解释,但不够清楚。 为什么标签部分通常设置为0,图像部分设置为3。
浏览 1
提问于2018-11-30
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回答
NiftyNet
输入/输出数据类型
NiftyNet
期望哪种数据类型作为输入?我知道
NiftyNet
以NIfTI文件格式读取和输出数据,但我不清楚单个数据的类型(例如16SINT或32SINT)。它是否有文档记录?有没有人碰巧知道这种数据不匹配的可能性,以及
NiftyNet
期望的数据类型?
浏览 7
提问于2018-04-04
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1
回答
如何在
NiftyNet
中进行数据训练
我正在尝试用我自己的数据(CT图像及其相应的标签)使用
NiftyNet
来训练一个网络。我使用类似的样本数据、我可以找到的所有
NiftyNet
文档以及调整了自己的数据的参数,在其他一些培训之后,我很快设计了Net类。net_segment train -c /home/
niftynet
/extensions/dense_vnet_TC/config.ini --name dense_vnet_TC.net_TC.MyNet/bin/net_段”,第10行,在 文件“
浏览 1
修改于2019-06-15
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1
回答
Niftynet
如何处理多gpu培训
我正在使用
Niftynet
训练一个使用2个GPU的CNN。据我所知,每个GPU都是独立训练的,因为我每次迭代都会得到两个损失值。两个GPU的结果是否在推断时合并?我曾经相信使用多个gpus可以减少训练时间,但在
Niftynet
中似乎不是这样。
浏览 13
修改于2018-12-18
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样本加权回归
Niftynet
晚上好, 我对
Niftynet
中的回归应用程序有一个疑问。事实上,我试图从MRI中预测CT连续的UH图。
浏览 15
提问于2018-02-01
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回答
如何在
NiftyNet
中实现迁移学习?
我想使用
NiftyNet
堆栈执行一些传输学习,因为我的标记图像数据集相当小。在TensorFlow中,这是可能的--我可以加载各种预先训练过的网络,并直接使用它们的层。我如何在
NiftyNet
中做到这一点?文件或源代码中唯一提到的“转移学习”是关于动物园模型的,但是对于我的任务(图像分类),动物园里没有网络。
niftynet
.layer中的各个层似乎也没有选项可以让它们接受培训或不接受培训。 是否可以通过经过预先训练的TensorFlow网络进行移植?如果我在
NiftyNet
中手动重新创建层体系结
浏览 0
提问于2018-06-08
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回答
python
niftynet
非法指令核心转储
我正在尝试
niftynet
网站上的快速入门命令。当我运行net_download dense_vnet_abdominal_ct_model_zoo时,我收到非法指令(核心转储)。有人有解决方案吗?
浏览 18
修改于2018-09-26
得票数 2
1
回答
ImportError:无法导入名称'_get_logger‘
Niftynet
我正试着在我的电脑上运行
Niftynet
。但是它一直显示这个错误。我有一个tensorflow的CPU版本,它可以工作。在那之后,我安装了tensorflow-gpu,现在它停止工作了。line 5, in <module> set_logger() File "c:\users\halim\appdata\local\
浏览 49
修改于2019-03-15
得票数 2
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1
回答
用
NiftyNet
对口腔照片进行肿瘤分类
但是,我要求关于如何使用
NiftyNet
进行医学成像工作的指导。这肯定会使我有能力做一些工作,并就尖锐的问题寻求帮助(这些问题肯定会出现)。 谢谢你的帮助。
浏览 6
提问于2019-11-12
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回答
如何更改
Niftynet
的输出格式?
是否可以在
Niftynet
的配置文件中设置输出格式?例如,我希望我的输出为png。谢谢。
浏览 23
修改于2018-08-23
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回答
niftynet
多类密集vnet三维分割
我一直在测试
Niftynet
,并使用dense_vnet在自己的核磁共振数据集上实现了不错的单类3D分割预测。然而,当我试图添加第二个标签时,我的运气不佳。P.S.
Niftynet
的网站针对一般问题引用了stackoverflow。
浏览 4
修改于2020-06-20
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2
回答
Niftynet
: error:参数--axcode:预期字符串列表
我刚刚开始探索
NiftyNet
,我认为这将对我的项目有所帮助。[T2]spatial_window_size
浏览 1
修改于2018-02-06
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2
回答
尝试运行
NiftyNet
快速启动命令时出错
我正在试用
NiftyNet
,在第一步就被困住了。试图运行快速启动命令 ~/
niftynet
/extensions/dense_vnet_abdominal_ct/config.ini net_download.py dense_vnet_abdominal_ct_model_zoo
浏览 1
提问于2018-01-27
得票数 3
1
回答
如何为自定义数据微调
niftynet
预训练模型
我想使用
niftynet
预训练的分割模型来分割自定义数据。我下载了预训练权重,并修改了model_dir路径以下载一个。, defined at: sys.exit(main()) app_driver.
浏览 3
修改于2020-08-03
得票数 0
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