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了解
LAMMPS
如何管理文件和目录
我按照说明安装了
LAMMPS
,并有一些问题。以下是说明(预构建的Ubuntu可执行文件):sudo apt-get updatesudo apt-getinstall
lammps
-daily
lammps
-daily < in.lj 必须从哪个目录提交作业才能运行?我查看了
LAMMPS
相关文件的位置,发现了这些文件:/usr/
浏览 0
修改于2016-01-18
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1
回答
如何在
Lammps
中创建杂酚类集群?
我知道如何在
Lammps
中创建立方体、圆柱体和球体形状,但我不知道如何在
Lammps
中创建一个二十面体集群。有人知道吗?
浏览 8
修改于2022-02-12
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1
回答
如何在windows10中使用GPU包运行
lammps
?
我在GPU10上安装了
LAMMPS
,以便在WIndows上执行计算。在非常小的规模上完成了计算,没有任何问题,但当计算某个规模的结构时,我得到了以下错误。文件'/home/akohlmey/compile/
lammps
-packages/mingw-cross/
lammps
/lib/gpu/geryon/ocl_kernel.h‘中的第467行出现OpenCL
浏览 97
提问于2021-04-21
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2
回答
在安装后从命令行调用
LAMMPS
我正在尝试从终端(OSX)调用
LAMMPS
包。$ lmp_linux 我通过这个安装了带有自制的脚本,并检查了安装是否正确。
浏览 12
修改于2018-01-01
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回答
lammps
电沉积input文件怎么编写?
想利用分子动力学方法模拟Ta上Cu薄膜的电沉积,但
lammps
的input文件不太会编写,还望做过或懂得的大神帮助一下,万分感谢!急需!!!可以有偿!
浏览 321
提问于2020-05-25
1
回答
如何在Ubuntu15.04中安装
LAMMPS
和OVITO?
LAMMPS
是一个分子动力学模拟软件。我下载了这个软件,但是我无法安装
LAMMPS
。我在Windows中搜索像.exe这样的文件,但是我找不到它。
浏览 0
修改于2016-08-27
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2
回答
在PyIron中直接包含
lammps
命令
我想在我的模拟盒的非周期方向强加反射BCs .为此,我需要使用诚挚的问候
浏览 6
提问于2020-12-24
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1
回答
在
lammps
中添加外部非常量力场
我想添加一个依赖于原子位置的力场。我试着计算原子的位置,使用它作为变量,然后设置力场,但我得到了:我尝试过的代码是:variable extforce equal ${maxforce}*step/${eqrun}*a
浏览 28
提问于2021-02-24
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回答
LAMMPS
(并行版)Linux系统安装过程的主程序编译找不到已经安装好的并行程序路径?
、
lammps
安装到最后的主程序编译一直显示找不到之前安装好的并行程序路径,代码如下,请求大神指点 make[1]: Leaving directory '/home/yjb/
lammps
/
lammps
-7Aug19/src'
浏览 1516
提问于2020-02-04
1
回答
用于GPU错误的
LAMMPS
- /usr/bin/ld:在使用make命令时无法找到-lmpi_stubs
我正在尝试在gpu中安装
LAMMPS
。在遵循中给出的步骤之后,我已经完成了步骤(a)并获得了文件- libgpu.a和Makefile.
lammps
。
浏览 18
修改于2018-01-01
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1
回答
LAMMPS
错误-成对系数的参数不正确
对于只有一种原子类型,我使用:pair_coeff * * /potentials/Zr_#2.eam.fs Zr
浏览 9
修改于2018-01-01
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3
回答
有没有可能在AMD Radeon上安装
lammps
gpu包?
从我在
lammps
手册上读到的内容,gpu软件包只能与NVIDIA卡一起使用,因为AMD没有cuda内核。但他们也有一个Makefile.linux_opencl,理论上可以和AMD卡一起使用。
浏览 12
修改于2018-01-02
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1
回答
lammps
分子动力学模拟薄膜沉积中均方根粗糙度计算问题?
在用分子动力学模拟薄膜沉积时,其中的均方根粗糙度计算的
lammps
代码如何编写呢?备注:Ta上沉积Cu。 还请各位懂得的老师或同学们帮忙告诉一下吧,万分感谢!!!
浏览 767
提问于2020-05-22
1
回答
如何使用M1芯片在mini上运行支持MPI的
LAMMPS
?
最近,我正在做一些分子动力学模拟(
LAMMPS
)在我的M1 Mac迷你。lmp_serial -in run.in.npt 我相信这意味着单CPU计算。
浏览 2
修改于2021-01-05
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1
回答
在
LAMMPS
中的文件“geryon/nvd_timer.h”调用Cuda驱动程序错误700
我在80万个原子系统中用gpu做弛豫计算。有时,我会遇到以下错误。你能告诉我原因以及如何解决吗?application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, -1) - process 0
浏览 4
修改于2021-07-06
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回答
如何根据通过Pandas从
LAMMPS
输出文件中导入的键合数据将原子细分为三组?
我使用
LAMMPS
模拟物理气相沉积(PVD)过程,并确定不同时间步骤中原子之间的相互作用。在我进行了分子动力学模拟之后,
LAMMPS
为我提供了一个输出键文件,其中包含每个原子的记录(作为原子ID)、它们的类型(与特定元素相互作用的数字),以及与这些特定原子结合的其他原子的信息。
浏览 4
提问于2020-04-05
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1
回答
"ls“在两个不同的终端中,在同一台机器上的同一文件夹中看到不同的文件。这怎么可能?
现在,我有两个打开的窗格,它们可以看到不同的文件,即使它们位于同一个(虚拟)PC上:pan@gergo-skynet-master:~/shared/
Lammps
/new-lengths125$ pwd Ter
浏览 0
提问于2022-08-09
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5
回答
python使用CDLL加载c lib时,在python路径中看不到库
但是,最初的导入代码会崩溃,因为它在站点包中找不到旁边的.so文件:from ctypes import * self.lib = CDLL("_
lammps
.so") try: except:在脚本或解释器中: from <
浏览 6
修改于2018-01-01
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1
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例外情况:错误:未识别的固定样式‘握手’是刚性包的一部分,而在此LAM中没有启用。
rm -rf
lammps
from mpi4py import MPI #from
lammps
importPyLammps #from
浏览 5
提问于2021-11-25
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回答
CMake:使用相同的代码构建多个库,但包含路径不同
我有一个与
LAMMPS
接口的源代码。然而,出于超出本论坛范围的原因,我必须维护我的代码的两个工作版本,每个版本都与
LAMMPS
的不同版本兼容。因此,我需要从相同的代码编译两个库:每个库都是根据相应的
LAMMPS
源代码编译的。我如何在CMake中做到这一点? 所以问题是,假设你有源代码a1.cpp,a2.cpp,...,aN.cpp。
浏览 9
修改于2018-01-01
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