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我正在尝试使用EMBOSS的biopython包装器对一组大约100个非常长(>8000个序列)的序列进行局部比对。到目前为止，我已经尝试运行以下非常基本的代码：from Bio import AlignIOfirst and second sequence in the usual format (e.g. - for a gap)"""
aln = AlignIO.read(needle_file, "
浏览 19提问于2016-07-26得票数 1
我正在尝试检索两个序列的比对分数，使用biopython中的emboss进行比较。据我所知，唯一的方法是从emboss生成的输出文本文件中检索它。问题是将有数百个这样的文件需要迭代。From Bio.Emboss.Applications import StretcherCommandline
needle_cline = StretcherCommandline(asequence
浏览 3提问于2013-08-19得票数 0
我在通过Python调用一个名为sixpack的EMBOSS程序(通过命令行运行)时遇到问题。我通过Windows7运行Python，Python版本3.23，Biopython版本1.59，EMBOSS版本6.4.0.4。
浏览 9修改于2012-07-09得票数 2
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/configure --prefix=/Users/pc/local/opt/emboss/v6.6.0sudo chown pc /usr/local/emboss然后我执行了make install，得到了以下错误：
dyld: Library not loaded: /usr/local/opt
浏览 7提问于2017-11-03得票数 1
我试图导入表达式混合4中的".psd“文件，但没有办法将ayer效果(”内部阴影“、”外发光“、"Bevel和Emboss”、“颜色覆盖”、“渐变覆盖”)作为可编辑。
浏览 1提问于2012-08-22得票数 2
嗨，我有一个很大的FASTA文件，看上去像这样GTCATCACAGTTTTCCCCGCCCTGTATATGGCTAATAGGCCCTCGCAATCTCCGATAAATCGACCCGCCATTCTCCATCGTAACTTAGTCACGACGACAGTCAGCTTGTTCGTTCGTTAT>EMBOSS_002 CTGATGCTAGTCCC
浏览 0修改于2020-11-23得票数 1
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') AND (PRO_TYPE = @TYPE OR @TYPE = 'all') AND (PRO_NAME = @NAME OR @NAME = 'all')" &
"AND (EMBOSS_TOP= @EMBOSS_TOP OR @EMBOSS_TOP = 'all') AND (EMBOSS_BOTTOM = @EMBOSS_BOTTOM OR @EMBOSS_BO
浏览 2修改于2017-11-10得票数 0
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因此，当我询问某个方案的状态时，它会产生争议性的证词：i A emboss- european molecular biology open software suite
Package: embossNew: yesAutomatically installed: yesapt-cache show emboss</em
浏览 0提问于2012-12-02得票数 1
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我已经实现了方法1选项的emboss，但我希望转换为方法2。请看bash脚本中的选项。 convert '(' ./emboss_1_18210.mpc -colorspace gray ')' '(' -clone 0 -negate ')' '(' -clone 0 -distort SRT '0,0 1 0/
浏览 3提问于2017-04-06得票数 1
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wrap = <a class='downloadlink' href='|' target='_blank'>Download</a> wrap = <p class='author'>|</p>
if.isFal
浏览 0修改于2019-08-08得票数 0
您好，我有以下R脚本x<-table(emboss[,2],emboss[,3])/NROW(emboss[,(y) <- paste( nms[,2],nms[,1],sep="")我有300多个名为emboss
浏览 0修改于2013-06-07得票数 1
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.Rows
Using conn As New SqlConnectioncmd.Parameters.AddWithValue("@Card_Type"
浏览 1修改于2016-12-29得票数 0
= params.emboss or true
上面的代码在所有情况下都工作得很好，除了我为emboss传入了'false‘：当我真的想要false时，上面的代码会导致emboss被设置为true。需要明确的是，我想要的是将第一个非NIL值赋给emboss，而我得到的是第一个非false和非NIL的值。= firstNotNil(para
浏览 0提问于2012-07-03得票数 6
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2回答
请查看以下链接，您将得到deboss的文本：
$emboss = array(array(2, 0, 0), array(0, -1, 0), array(0, 0, -1));imageconvolution($im, $emboss, 3, 235); header('Content-Type: image/the text
imagettftext($im, $fontSize, $text_angle, 0,
浏览 4修改于2018-05-21得票数 0
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我正在尝试实现一些照片效果，我尝试了一些不同的效果，比如sketch painting effect, Emboss effect,，现在我正在尝试实现sketch painting effect, Emboss
浏览 0提问于2012-10-10得票数 4
嗨，我正在一个文件夹中的许多文件上运行下面的r脚本 emboss <- read.table(x,header=T) y <- as.vector(t(x)) names(y) <- paste( nms[,2],nm
浏览 2提问于2013-06-12得票数 0
" width="203" height="101" class="alignnone size-full wp-image-46"></p>
<p><span class="embosswp-content/uploads/2012/12/impresna-img-1.jpg" width="203" height="101">&l
浏览 0提问于2012-12-26得票数 1
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1回答
case R.id.normal: return true; paintView.emboss(); case R.id.blur:private int backgroundColor = DEFAULT_BG_COLOR;
private int
浏览 1修改于2018-06-20得票数 0
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接下来，我安装了包含指针的EMBOSS-6.6.0，在执行./install-sh -c -d '/usr/local/share/EMBOSS'/bin/sh ..include/gd -DPRE
浏览 0修改于2017-07-30得票数 0
var1.get()==0): if (var2.get() == 1): image_show(img_EMBOSS)check_btn2
浏览 2修改于2022-01-28得票数 0
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