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我想写一个函数，将重叠dna序列(重叠dna序列)扩展成一个大的重叠序列。为此，我需要从包含这些序列作为键和值的字典中找到重叠的序列。我需要在初始序列的右边和左边找到“最小的扩展”，但我想不出如何真正找到最小的扩展。我还在浏览文档，但到目前为止还没有发现任何有用的东西，所以如果有人能给我指出一个方法，或者告诉我如何获得最小的扩展，我将不胜感激。
浏览 2提问于2016-06-05得票数 0
>contig-7orf00003 3381 1747 >Wcontig-11112orf00001 2995 637 orf00003 2984 2529>contig-7 orf00002 17
浏览 0提问于2014-07-28得票数 0
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我有一本清单字典：
dic = {'contig_100003': ['contig_14576'], 'contig_100022': ['contig_96468'], 'contig_100023': ['contig_24939', 'contig_33444', 'contig_72441&
浏览 1修改于2022-03-03得票数 1
例如，我想要更改以下内容：contig1 contig3 contig4 contig7contig2 contig3 contig4 contig7
contig1 contig4 contig6 contig
浏览 0提问于2016-08-22得票数 3
我有一个数据框，看起来像这样 **Contig_A** **Contig_B**
Contig_3 Contig_5 Contig_9 Contig_0 我想计算有多少个重叠群in (从Contig_0到Contig_119
浏览 27提问于2021-09-07得票数 0
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>##contig=<ID=11,length=61676533>##contig=<ID=14,length=94600040>##co
浏览 7修改于2021-01-20得票数 1
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contig_1 2 334 contig_1 4 326 contig_1 6 308 contig_13813
浏览 14修改于2021-03-02得票数 0
假设我有这3行代码Helicobacter contig1我想要contig1或Contig 1$test^(contig|Contig)//g;
但它不起作用。有什么想法吗？
浏览 0修改于2012-08-03得票数 0
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我有一个大的选项卡分隔文件，如下所示：
contig00546 contig01344 12等
contig08943
浏览 0修改于2013-03-08得票数 1
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_1_pilon 223468 603256 2.70 0 59contigfile1 file2contig_79_pilon 50.89<em
浏览 19修改于2022-10-23得票数 -2
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2回答
输入文件和所需输出文件contig102 contig1contig2 contig102
contig1005 contig
浏览 3提问于2014-04-03得票数 0
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_1202_p1", "HypermutR0126_HIV_AC6_CONTIG_9019_p1", "HypermutR0135_HIV_AD3_CONTIG_HIV_AA3_<
浏览 4修改于2018-01-03得票数 2
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=c("Contig100169_2367", "Contig100169_2367", "Contig100169_2367", "Contig100169_2367", "Contig100169_2367", "Contig100169_2367", "Contig100169_2367", "Contig<
浏览 0修改于2018-04-04得票数 4
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以下是数据：ptg000037l ptg000039l ptg000043l我需要把所有3C-assembly|contig_放在第一列，把所有对应的ptg000放在第二列：3C-assembly|contig_94 ptg000039l
3C-assembly|conti
浏览 0修改于2021-05-20得票数 2
scf_62525_290.contig_1scf_62525_290.contig_1 BLAST blastn 3953 4114 300 + .scf_62525_290.contig_1
scf_62525_290.contig_1 BLAST blastn
浏览 1修改于2016-01-11得票数 1
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下面是df中的列Contig1401|m.3412Contig1755|m.4465Contig1897|m.4878Contig1757|m.4476Contig1759|m.4481正如您所看到的基本上我想要
浏览 2提问于2014-02-16得票数 1
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Contig2_All... at +/95.87%2 1274nt, >CL4790.Contig7_AllCL276.Contig5_AllCluster 51 6298nt CL5173.Contig2_All_All537
浏览 5修改于2019-12-05得票数 0
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contig-100_0 5485 [1341/1341] [100.%] ['hit1'] contig-100_0 5485 [59/59] [100.%] ['hit3']
contig-100_1 2865 [2865/2865] [100.%] [&#x
浏览 11提问于2019-03-01得票数 0
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下面是我的示例数据框(代码和输出)，其中包括来自我的实际数据框的相关列：
example <- data.frame(contig=c("Contig1", "Contig1", "Contig1","Contig1", "Contig1", "Contig2", "Contig2", "C
浏览 4提问于2018-11-30得票数 0
我试图使用Python编写一个程序，该程序从文件#1 (contig_numbers)中获取单词列表，并通过在两个不同的文件(#2注释和#3丰度)中逐行迭代来查找这个单词。contig-3contig-1contig-14注解
contig-1 out.27-Actinomycetales gene_id_947 NULL NULL NULL NULL NU
浏览 1修改于2016-01-12得票数 1
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