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如何可视化生成的
RNA
二级
结构
我正在开发一个可视化
RNA
二级
结构
的工具,为此我实现了Nussinov的算法,该算法将
RNA
二级
结构
生成为带有相应索引的列表,代码可以在这里找到 我知道有更好的算法,但现在我只想用这个可视化,一旦我理解了可视化,我会去寻找更好的算法
浏览 4
修改于2011-08-17
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2
回答
在给定
结构
中寻找
RNA
碱基配对
我有一个
RNA
序列,看起来像这样。
浏览 1
修改于2016-12-23
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3
回答
HTML5的第二种
结构
正则表达式模式
我需要一个RegExp来识别HTML5网页中的第二个
结构
。
RNA
的第二个
结构
就是一个只包含点和平衡括号的字符串,它被用来识别
RNA
的形状,如果我们知道目标
RNA
的形状,我们就可以猜测出可以制造出具有该目标形状的
RNA
的碱基序列。是真正的
RNA
第二
结构
,但是....a.((((......))))......不是真正的
结构
这些是我识别
结构
的所有失败的尝
浏览 0
修改于2013-03-01
得票数 1
1
回答
Perl分组:寻找更快的递归解决方案
我的数据
结构
是这样的:我的%REV_ALIGN;任何dna密钥都可以有多个
RNA
子密钥。相同的
RNA
子密钥可以与多个不同的dna密钥一起出现。其目的是基于共享的dna序列元素对
rna
(转录本)进行分组。例如,如果dnaA有
RNA
1、
RNA
8、
RNA
9和
RNA
4,而dnaB有
RNA
11、
RNA
4和
RNA
99,那么我们将所有
浏览 3
提问于2015-10-07
得票数 0
1
回答
在R中执行group_by函数时使用“shapiro_test”函数
DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","DNA","
RNA
","<em
浏览 2
提问于2022-05-06
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3
回答
选择具有相同外键但另一列具有一组值的行
c |GROUP BY
RNA
_id HAVING COUNT (DISTINCT Experiment_id)=3我现有的查询是:FROM data我想出了如何使用3
浏览 0
修改于2019-07-10
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1
回答
挣扎于蟒蛇的比较问题
我正在学习蟒蛇,我们学习指南中的一个问题要求评估
RNA
序列。我没有得到问题所建议的预期输出,我得到了17。以下是代码:def
rna
_length(mrna);end_
rna
2 = 'UAA'; if (mrna[0:3]==start_
rna</
浏览 4
提问于2021-08-24
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2
回答
如何加快这个瓶颈:在Python中多次加载字典
我编写了一个分析蛋白质-
RNA
相互作用的算法,我发现以下功能是导致性能问题的瓶颈:#len(protein_sequence)~500, len(
rna
_sequence)~1500 python_matrix = [[] for _ in range(len(protein_sequence))] for i, AA in enumerate(protein_sequenc
浏览 1
修改于2019-11-27
得票数 0
2
回答
机器学习,决策树
我在计算生物学(长
RNA
二级
结构
预测)工作。 我想知道,对于给定的
RNA
浏览 1
修改于2013-04-27
得票数 1
1
回答
计算具有固定gc含量的随机
RNA
序列的平均转录长度
,90%)
rna
= 'AUG' while
rna
[-3))+('C'+'G')*(gc_content))
rna
2_list = []
浏览 2
提问于2017-11-06
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4
回答
如何忽略字符数组中的某些字母和空格
using namespace std; { if (
rna
[i] == 'a' ||
rna
[i] == 'A') else if (
rna
[i] == '
浏览 1
修改于2021-08-13
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2
回答
不变的字符被视为整数,而不是拆分为头部和尾部时的字符
我正在研究一个关于elixir
RNA
转录的基本问题。] _to_
rna
(dna) def _to_
rna
([head | tail]), do: [_
rna
(head) | _to_
rna
(tail)] def _
rna
(x) when x == 'A', do: 'U
浏览 5
提问于2019-09-20
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2
回答
RNA
辅助蛋白质折叠可以计算吗?
我正在寻找工具/软件,以执行蛋白质折叠存在的
RNA
伙伴。我的部分蛋白质是无序的,我怀疑它会在与它的
RNA
伙伴相互作用时占据
结构
。
浏览 0
提问于2017-04-05
得票数 4
1
回答
计算多个CSV文件中的条目
这些文件的一般
结构
如下:1ARJ 1ARJ ARG-bound TARStructure of Solution structure of Arginine
RNA
some complex
RNA
RNA
complex.
浏览 1
修改于2013-07-16
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1
回答
在R中将行转换为2列
我想将行转换为R中的两列
RNA
1
RNA
1
RNA
3Column 1 Column 210890
RNA
11318
RNA
11318
RNA
浏览 0
修改于2013-06-29
得票数 0
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1
回答
规则salmon_quant的缺失输入文件:错误
_RA_knee_1_Homo_sapiens_
RNA
-Seq", "SRR3350551_GSM2112324_RA_knee_2_Homo_sapiens_
RNA
-Seq",_RA_knee_2_Homo_sapiens_
RNA<
浏览 3
修改于2021-06-10
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2
回答
如何插入多个同名输入值在php中插入csv
[]" type="text" id="
rna
_cp" size="50" /></td><td><input name="
rna
_pw[]" type="text" id="
rna
_pw" size=[]" type="text" id="
rna
_cp" size="50&quo
浏览 2
提问于2014-09-01
得票数 0
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4
回答
Python转录的DNA序列列表中的Begginer
# Given this DNA sequence, get the
RNA
sequence: mapping = {'G':'C', 'C':'G', 'T':'A', 'A':'U'}
浏览 2
提问于2021-03-27
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1
回答
python跳过循环
elif
RNA
[0][number:number + 3] == "CGU" or
RNA
[0][number:number + 3] == "CGC" or
RNA
[0][number:elif
RNA
[0][number:number + 3] == "GGU" or
RNA
[0][number:number + 3] == "GGC" or
RNA
[0][number:=
RNA
浏览 0
修改于2016-02-19
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5
回答
如何使用字符映射替换字符串中的字符?
下面是代码: dna_
rna
= {'A':'U', 'C':'G', 'G':'C', 'T':'A'} forkey in dna_
rna
.iterkeys():
rna
.ap
浏览 4
修改于2015-10-23
得票数 0
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