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如何从Talend中的txt文件中提取模式
生物:智人类型:按数组表达谱;阵列平台非编码RNA分析: GPL20115
6
样例下载: GEO (TXT) 系列加入: GSE160804 ID: 200160804 溃疡性结肠炎患者的诱导器官重述结肠反应性生物:智人类型:通过
高通量
测序
平台进行表达谱分析: GPL24676 11样例下载: GEO (MTX,TSV) SRA Run Selector:系列加入: GSE152999 ID: 200152999
浏览 4
修改于2021-03-22
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1
回答
在R中交叉多个数据帧
我的数据帧来自
高通量
测序
实验,如下所示: chr pos orient weight in_nucleosome in_subtelo5 NC_001134 509 + 2 FALSE TRUE5 NC_001133 ARS_consensus_s
浏览 2
修改于2015-03-31
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1
回答
使用Python加快并行读取大文件的速度
这些文件在blocks中记录
高通量
的
测序
数据(我们称之为
测序
reads),而每个read包含4行(name、sequence、n、quality)。read记录在两个文件中的顺序相同。
浏览 2
修改于2018-11-06
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1
回答
cummeRbund创建基因集
我正在使用cummeRbund,这是一个用于袖扣
高通量
测序
数据的R可视化包。 我想创建一个基因集,以便能够分析我感兴趣的差异表达的基因。
浏览 0
修改于2016-06-02
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2
回答
RxJ的好教程
如下所示:通过合并元素的索引,将可观
测序
列的每个元素投影到新的可观
测序
列序列中,然后将可观
测序
列的可观
测序
列转换为仅从最新的可观
测序
列产生值的可观
测序
列
浏览 5
提问于2016-08-05
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2
回答
在R中使用HMM包
(c("A","B"), c("L","R"), transProbs=matrix(c(.8,.2,.2,.8),2),这意味着状态被命名为"A“,"B”排放被命名为"L“和"R”,我们也有传输和发射概率。这种矩阵的i_j个_th元素被解释为“在时间j,已经产生了观
测序
列的前j个元素并且处于状态i”。 现在,在Ba
浏览 1
修改于2020-06-20
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1
回答
嵌套泛型约束:在被约束到该泛型类型的泛型序列扩展中约束泛型项的T
Sequence where Iterator.Element : ObservableType where E : MyType { 在上述伪代码(不起作用)中,意图是: 此扩展应适用于可观
测序
列,其中可观
测序
列是MyType类型的可观
测序
列,例如,可观
测序
列
浏览 3
提问于2017-01-17
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2
回答
将现有的ERC-20转让给平衡计分卡
我们希望移动到Binance智能链或TRON区块链,因为它提供
高通量
和较低的tx费用。如何将现有的ERC20移动到另一个链,特别是平衡
浏览 0
提问于2021-05-19
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回答
删除大文件中的重复行
目前正在使用下一代
测序
(ngs),需要从文件
测序
(大数据)中删除重复读数。我正在尝试在java中使用和,但仍然不能成功。
浏览 19
提问于2018-08-23
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回答
隐马尔可夫模型训练中的不等长观
测序
列
观
测序
列的长度不是固定的。我尝试了一些HMM包,如Matlab的HMM工具箱和Kevin的库。它们似乎都要求用户指定转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小。我知道,对于隐马尔可夫模型(HMM),转移概率矩阵和发射概率矩阵的大小取决于隐态数和观
测序
列的长度。如果观
测序
列的长度不是固定的呢?或者我可以通过填充零来使观
测序
列保持相同的长度吗?
浏览 0
修改于2018-07-20
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4
回答
在Python 3的一行上打印一个序列
我设法得到了正确的
测序
,但我不知道如何让它打印在同一行。我有这个:i = n+7 while (i > n): n = n+1n = input ("Enter the start number: ") while
浏览 9
修改于2016-03-24
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2
回答
利用HIdden马尔可夫模型进行预测
给定n个观
测序
列和这些序列的n+1观
测序
列,HMM能用来预测一个新的n观
测序
列的(n+1)th观测吗?如果是的话,怎么做? 从文档中我无法很好地理解这一点。我找到了一个可能的,但它没有指定如何在Scikit中使用HMM --学习预
测序
列中的下一个值。
浏览 5
修改于2017-05-23
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2
回答
msvcrt.dll是否为其rand()函数使用线性同余生成器?
我相信代码是这样的:dice[0] = rand() %
6
+ 1; dice[1] = rand() %
6
+ 1; dice[2] = rand() %
6
+ 1;,我想知道我是否可以使用线性同余生成器的预测程序来预
测序
列中的下一个数字
浏览 1
提问于2009-12-19
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1
回答
双散列细节
对于双哈希实现的探
测序
列,下列哪一项不是正确的?两个键可以有相同的探针序列C.探
测序
列的元素是哈希表的可能键我相信A,B和D是正确的,所以我认为C是正确的答案。
浏览 1
修改于2016-11-23
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3
回答
f(++i,++i)是未知的吗?
我似乎记得在C++11中,他们对
测序
行为做了一些更改,现在i++和++i有不同的
测序
需求。 f(++i, ++i)是否仍未定义行为?f(i++, i++)和f(++i, ++i)有什么区别?
浏览 0
修改于2015-03-28
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2
回答
DNA序列数据.长而宽的实验数据表的要求
我需要建立一个数据库来保存从DNA
测序
实验中获得的数据。2)有几个数据点为空专栏: bed1,bed2...bed10000..。 行: sample1,sample2..。
浏览 0
修改于2020-05-10
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1
回答
多次随机化矩阵
我有一个用矩阵A表示的
高通量
基因数据。C1 C2 C3 C4 Gene B 2 4 9 3我希望继续随机化这个矩阵,比如说10次,并将每个新的随机矩阵保存为这可能如下所示:Gene A 5 3 4 7 Gene C 5 8
6
浏览 3
修改于2015-09-20
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3
回答
查找列中缺少的数字
我在T-SQL中有这个专栏: 2 7让SQl函数来检
测序
列4,5,
6
和8,9中的缺失数字。
浏览 1
修改于2013-03-20
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0
回答
RNA velocity图的箭头长短有什么含义吗?
velocity
单细胞
测序
分析方法Velocity的箭头长短有什么含义吗?
浏览 253
提问于2022-01-19
1
回答
基于序列对齐算法的NER构建
问题:,因为命名实体识别器和DNA序列库都进行近似字符串匹配--使用DNA
测序
库(如)并构建NER是实用的吗?不使用现有的NER开源,而是使用DNA
测序
库来构建NER的原因之一是希望在我的NER中自动获得“拼写错误更正”。 如果我以上的假设是有意义的
浏览 0
提问于2015-12-18
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