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我有一个数据矩阵，其中包含100,000行的值，这些值对应于几种细胞类型的甲基化值。我想在集群热图中直观地显示甲基化的变化。为了使数据更易于管理，我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
浏览 0修改于2013-06-11得票数 0
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我有一个数据表，列名为单元格类型(20种细胞类型)，然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其甲基化值(介于0到1之间)。确定甲基化值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999，0.1-0.1999，0.2-0.29999等，每种细胞类型的甲基化值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即甲基化值在上述范围内的基因数目)。
浏览 1修改于2017-09-10得票数 2
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我有两个数据，一个是病人样本的协变量，另一个是样本的甲基化数据。我需要做t检验来比较按性别划分的甲基化数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian甲基化因此，如果我想对前8个样本的甲基化数据和性别进行一系列的t检验，我是否可以指定：t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)？
浏览 0修改于2018-10-17得票数 0
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Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达；Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的甲基化状态。是否有可能同时基于表达和甲基化信息对基因和/或样本进行聚类？
浏览 3修改于2016-05-27得票数 0
数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字，整数)，另一列用于甲基化值(也是数字，双精度)，许多甲基化值缺失。这个想法是，距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能，但我选择不包括这些功能)。
浏览 66提问于2016-03-27得票数 3
我正在用一种方法来找到甲基化调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因甲基化与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器，我得到了418个基因的子集，其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出甲基化和每个基因表达的b样条三次回归系数。
浏览 1提问于2015-06-24得票数 1
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以下是一个例子-
CIMP - CpG岛甲基化表型
问题是，我已经能够使用re.findall('(\(.*?
浏览 2修改于2020-06-20得票数 1
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我有一个β甲基化值矩阵，维度如下:485577x894。
我想确定哪些β甲基化值> 0.5，这样我就可以从进一步的分析中排除它们。在这样做的时候，我需要数据保持矩阵格式。
浏览 2提问于2014-01-24得票数 0
示例：output = ['3-8', '3-2', '8-3', '8-2', '2-3', '2-8']
浏览 0修改于2017-12-07得票数 2
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我在人类样本上进行了450K Illumina甲基化芯片，并想要寻找连续变量和β之间的关联，并对其他协变量进行了调整。为此，我使用了R中的CpGassoc包。我还想根据重要的CpG站点搜索差异甲基化区域。然而，Champ软件包和其他用于450K DMR分析的软件包中的探头套索函数总是假设需要找到DMR的2组。我没有两组，而是这个连续变量。
浏览 2提问于2015-09-25得票数 0
Scanner keyboard = number.nextInt();假设用户插入以下2个数字:8和3我并不要求程序使8-因此，程序计算8 -1 -1 -1 -1 -1 = 3而不是8-38 -1 =7// ....该练习不需要复杂的方法，也不需要for循环，只需要while
浏览 0修改于2018-10-27得票数 0
我有一个表reservation，它有一个列，该列包含非规范化数据，如6在6-7中引用另一个表packages的id。具有上述单元格(6-1,7-2,8-3,9-4,12-7,)的行将检索用于6, 7, 8, 9 and 12包ids的package行。
请帮帮我。
浏览 4修改于2014-05-21得票数 0
我有一个Pandas，包含以下列:位置、控制、病人、REFGENE、REFGROUP和非常多的数据行(甲基化数据)。REFGENE REFGROUP
我想调查对照和病人在甲基化方面的差异
浏览 2修改于2020-10-20得票数 0
我有一个包含百分比( DNA甲基化数据)的列的文件。我想绘制分布频率图(可能使用10的柱状图)来显示数据。有没有办法在python中做到这一点。
浏览 2提问于2013-05-25得票数 0
ie=UTF8 8&qid=1330456917&sr=8-3获得这个适配器，因为它支持包注入。你们推荐更好的适配器吗?为什么？谢谢
浏览 0修改于2012-02-29得票数 0
这是我尝试过的：random = rand.nextInt(8-3) + 3; mSwipeView.addView(new AdCards(mContext, mSwipeView)); count = rand.nextInt(8-3) + 3;
浏览 0提问于2017-10-09得票数 0
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