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我有一个数据矩阵，其中包含100,000行的值，这些值对应于几种细胞类型的甲基化值。我想在集群热图中直观地显示甲基化的变化。为了使数据更易于管理，我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
浏览 0修改于2013-06-11得票数 0
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我有一个数据表，列名为单元格类型(20种细胞类型)，然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其甲基化值(介于0到1之间)。确定甲基化值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999，0.1-0.1999，0.2-0.29999等，每种细胞类型的甲基化值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即甲基化值在上述范围内的基因数目)。
浏览 1修改于2017-09-10得票数 2
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我有两个数据，一个是病人样本的协变量，另一个是样本的甲基化数据。我需要做t检验来比较按性别划分的甲基化数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian甲基化因此，如果我想对前8个样本的甲基化数据和性别进行一系列的t检验，我是否可以指定：t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)？
浏览 0修改于2018-10-17得票数 0
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[ 2992.745185] usb 3-9: new full-speed USB device number 9 using xhci_hcd[ 3003.329543] usb 3-9: unable[ 3003.449481] usb 3-9: new full-speed USB dev
浏览 0修改于2017-05-14得票数 4
下面是我的代码：您可以看到Chrome 3-9，但现在我尝试将其更改为：
supported_browsers = /Chrome\/[3-15]|Firefox\/[3-9]|\sMSIE
浏览 1提问于2011-10-02得票数 0
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Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达；Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的甲基化状态。是否有可能同时基于表达和甲基化信息对基因和/或样本进行聚类？
浏览 3修改于2016-05-27得票数 0
数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字，整数)，另一列用于甲基化值(也是数字，双精度)，许多甲基化值缺失。这个想法是，距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能，但我选择不包括这些功能)。
浏览 66提问于2016-03-27得票数 3
pattern = Pattern.compile("(\\d{8}-[01],)*(((202210((2[89])|(3[01])))|(2022((1[12]))\\d{2})|(20((2[3-9])|([3-9][0-9]))\\d{4}))-[01])*([,]\\d{8}-[01])*");
Matcher matcher = pattern.matcher("20221027-0,20221028"value": "(\\d{8}-[01],)*(((202210((2[89])|(
浏览 5修改于2022-10-28得票数 0
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我正在用一种方法来找到甲基化调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因甲基化与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器，我得到了418个基因的子集，其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出甲基化和每个基因表达的b样条三次回归系数。
浏览 1提问于2015-06-24得票数 1
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以下是一个例子-
CIMP - CpG岛甲基化表型
问题是，我已经能够使用re.findall('(\(.*?
浏览 2修改于2020-06-20得票数 1
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*\(dbsnp_[1-9][3-9][3-9][^\n]*\.vcf\)'`
dbsnp=`expr "$vcfs" : '.*\(dbsnp_[1-9][3-9][3-9].*?\.
浏览 2修改于2016-04-05得票数 0
我有一个β甲基化值矩阵，维度如下:485577x894。
我想确定哪些β甲基化值> 0.5，这样我就可以从进一步的分析中排除它们。在这样做的时候，我需要数据保持矩阵格式。
浏览 2提问于2014-01-24得票数 0
01[3-9]\d{8}$/匹配匹配某些字符串的模式，如01712345678
01312349876它工作得很好，但我也希望与01[n]匹配，n将是3-9。
浏览 5修改于2021-09-29得票数 1
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我需要一个输入，例如x^3-9*xf=readline(prompt="A symbolic / mathematical function:")我需要让程序理解f是一个函数，而不仅仅是字符。
浏览 0修改于2021-04-20得票数 1
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我在人类样本上进行了450K Illumina甲基化芯片，并想要寻找连续变量和β之间的关联，并对其他协变量进行了调整。为此，我使用了R中的CpGassoc包。我还想根据重要的CpG站点搜索差异甲基化区域。然而，Champ软件包和其他用于450K DMR分析的软件包中的探头套索函数总是假设需要找到DMR的2组。我没有两组，而是这个连续变量。
浏览 2提问于2015-09-25得票数 0
到目前为止，我有以下正则表达式：其中n的最大长度为1.000.000。
我知道迭代器不是常规语言中的“东西”。
浏览 0修改于2018-03-14得票数 0
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