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去
甲基化
有多深?
我取消了一个OLTP数据库在DWH中的使用。目前我正在取消学习小组的职务。 换句话说,当你去有机化的时候,你会走多深?
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修改于2019-05-09
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去
甲基化
结果集
我试着去修饰一个结果集,这样我每个ID就有一个记录,这是多个共患病患者的列表。目前的数据如下:1 Asthma 1 Anemia2 HBPID Disease1 Disease2 Disease32 Asthma HBP <NULL or Blank> 我研究了Pivot,但是我看到的所有例子都使用了不适用的聚合函数。我添加了row_number函数,
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提问于2014-09-19
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去
甲基化
是什么意思?
在阅读一章:“的经验法则:您的彩虹指南”时,我偶然发现了以下几个词:嵌入和反错。 第五:考虑脱脂时的写读比。一个大部分将被读取且很少更新的字段是反规范化的好选择:如果您对一个经常更新的字段进行反规范化,那么查找和更新所有实例的额外工作很可能会影响您从反规范化中获得的节省。 但我不知道脱脂是什么意思。
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提问于2015-09-27
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猪的扁平化、去
甲基化
我想从以下模式创建一个扁平的联接表 AS program: ids:bag {(idtype:chararray, idvalue:chararray)}, 如果输入是 (1, {('x','foo'),(
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提问于2014-04-21
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用jq对JSON进行去
甲基化
我的JSON看起来是这样的: { "versions": [ "id": "36143", }, "id": "36144", "description
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提问于2015-10-15
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在CQRS中去
甲基化
的最佳实践是什么?
我正试图创建一个解除数据库功能的deamon。我的问题是,对我的真实DB进行去denormalize的最佳实践是什么--我有一些想法:
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修改于2010-07-10
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正规化与去
甲基化
如何在现有的已连接文档中进行级联删除、更新和反应性更新?例如,我加入了以Posts为作者的Meteor.users集合和userId()集合。我可以在Posts集合上进行转换函数,以获取作者的用户数据,比如username,并在任何帖子上显示作者的username。问题是当用户更改他/她的username时,现有的帖子不会主动更新作者的username。删除父文档时,子文档仍然存在。我使用了流行的智能包,如publish-composite和collection-helpers,但问题仍然存在。有哪个流星开发专家能帮到我吗?谢谢。
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修改于2015-11-01
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具有梯度下降的线性回归后的去
甲基化
工艺
我有以下一组数据:240000,3650150500,4400176000,5250166800,5800144500,599982029,639074000,660067000,680048235,690060949,749054000,799022899,7990在对它们进行规范化
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提问于2019-11-24
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如何基于回归连续变量~β(使用CpGassoc)找到差异
甲基化
区域(例如,使用Champ中的探针套索)
我在人类样本上进行了450K Illumina
甲基化
芯片,并想要寻找连续变量和β之间的关联,并对其他协变量进行了调整。为此,我使用了R中的CpGassoc包。我还想根据重要的CpG站点搜索差异
甲基化
区域。然而,Champ软件包和其他用于450K DMR分析的软件包中的探头套索函数总是假设需要找到DMR的2组。我没有两组,而是这个连续变量。
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提问于2015-09-25
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VB.NET向C#的性质及
甲基化
转化
我正在学习VB.NET和C#,我在VB中有下面的代码,我用C#转换了这些代码。代码有一个表单、一个基类工具和一个派生类Car。在VB中,基类Vehicle作为4个属性声明,只有一行没有set & get,而在C#中,我首先必须声明变量,然后使用set & get方法(和很多行)声明4个属性。这是正确的方式,还是有一个简单的方式,如VB?Public Class Form1 Di
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提问于2017-05-26
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如何在不提供样本表的情况下加载GEO
甲基化
(450k)数据集?
我从Gene Expression Omnibus (GEO)下载了一些Illumina 450k
甲基化
数据集 R Bioconductor包minfi和ChAMP似乎需要一种叫做“样本表”的东西。
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提问于2015-08-02
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个性化内容的缩放、去
甲基化
NoSQL的经济性
我正在使用Cassandra作为一个数据密集型应用程序。由于操作和部署经验相对较少,我正在寻找的专门知识是能够阅读下面的示例并决定我是否忽略了更简单的解决方案,或者是所需的资源是否使这个问题昂贵或难以解决。~1-10 000所书店,每个书店都包含(1)中主表的某些子集,可能包含来自(1)的id字段。因此,需要一个存储元数据的存储表和一个书店库存表。序贯推荐算法被设计成在某一商店中对用户的所有可能性中的最佳选择进行排序。首先,它可以根据用户的喜好轻松地在主书表中用1或0对每本书打分。因此,
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修改于2014-12-31
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拆分数据矩阵
我有一个数据矩阵,其中包含100,000行的值,这些值对应于几种细胞类型的
甲基化
值。我想在集群热图中直观地显示
甲基化
的变化。为了使数据更易于管理,我正在考虑每10行左右创建一个新的数据矩阵。
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修改于2013-06-11
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标识特定范围内的值数
我有一个数据表,列名为单元格类型(20种细胞类型),然后是每种细胞类型的23000个基因的行名及其
甲基化
值(介于0到1之间)。确定
甲基化
值在以下范围内的基因数目: 0-0.0999,0.1-0.1999,0.2-0.29999等,每种细胞类型的
甲基化
值为0.9-1。我还想对整个数据表进行类似的分析(即
甲基化
值在上述范围内的基因数目)。
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修改于2017-09-10
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在具有协变量的两个数据帧之间进行一系列t检验。
我有两个数据,一个是病人样本的协变量,另一个是样本的
甲基化
数据。我需要做t检验来比较按性别划分的
甲基化
数据。caucasiansample6 p6 1 caucasian
甲基化
因此,如果我想对前8个样本的
甲基化
数据和性别进行一系列的t检验,我是否可以指定:t.test(t(methylation[,1:8]) ~ covariates$sex)?
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修改于2018-10-17
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使用两个矩阵进行聚类
Matrix Expr包含每个基因和样本的基因表达;Matrix Methyl包含每个样本的这些基因的
甲基化
状态。是否有可能同时基于表达和
甲基化
信息对基因和/或样本进行聚类?
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修改于2016-05-27
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来自DMwR包的时间错误:无效的‘knnImputer’参数
数据集有两列-一列用于染色体上的位置(数字,整数),另一列用于
甲基化
值(也是数字,双精度),许多
甲基化
值缺失。这个想法是,距离应该基于染色体上的位置。我还有其他几个功能,但我选择不包括这些功能)。
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提问于2016-03-27
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两个矩阵R中每个对元的样条回归系数
我正在用一种方法来找到
甲基化
调控的基因。该方法首先计算样品中每个基因
甲基化
与表达数据之间的相关系数。我应用这个第一个过滤器,我得到了418个基因的子集,其相关系数为显著(小于-0,3)。下一步是找出
甲基化
和每个基因表达的b样条三次回归系数。
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提问于2015-06-24
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使用regex (简易)查找括号缩略词的完整形式
以下是一个例子- CIMP - CpG岛
甲基化
表型 问题是,我已经能够使用re.findall('(\(.*?
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修改于2020-06-20
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根据特定条件选择矩阵中的多个观测值
我有一个β
甲基化
值矩阵,维度如下:485577x894。 我想确定哪些β
甲基化
值> 0.5,这样我就可以从进一步的分析中排除它们。在这样做的时候,我需要数据保持矩阵格式。
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提问于2014-01-24
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