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然后，每个转录本都具有在外显子计数中指定的设定数量的外显子(例如，8)。较大转录本中每个外显子的开始和结束由exonStarts和exonEnds列表中的匹配值指定。例如，本例中的第一个外显子的范围是134212702到134213049。内含子位于外显子之间，因此第一个外显子从134213050到134221528。现在我想使用从TxStart -2000到TxStart + 2000的启动子定义来重做这个分析。然而，似乎在使用此代码的外显子和启动子
浏览 1修改于2013-07-03得票数 0
然而，我的程序不应该阅读用英语写的文本，而是包含DNA序列的文本，其中一个基因的所有外显子都用大写字母写，所有内含子都用小写写。简单地说，我的程序应该把DNA序列作为输入(作为.txt文件)，然后告诉我外显子与内含子相邻的所有位置。因此，对于上面显示的测试input.txt，它将输出：
这个程序的目的是在我作为.txt文件提供的任何基因中找到所有所谓的‘剪接供体位点’，然后进一步分析它们(技术术语:剪接供体位点是一个mRNA转录子的外显子/内含子边界上的9个碱基的序
浏览 2提问于2017-08-11得票数 0
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我正在分析RNAseq数据，为了实现规范化，我需要使用读计数除以列表中每个基因的外显子长度之和(以千字节为单位)。
外显子长度。正如您所看到的，我列表中的每个基因都有不同的外显子号，因此geneID将被列在不同的行中，但我想在最后得到的结果如下：ENSG00000000003
浏览 0修改于2018-04-20得票数 1
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我有大约5个测试用例，我想让它们重复运行5-6次。我该怎么做呢？请帮帮忙。出于分析目的，我希望它们继续运行。
浏览 186修改于2019-03-06得票数 -2
所有的立方体在处理时，每天需要5-6个小时。仅具有一个度量组的度量组-1分析服务处理任务需要2个小时，其余9个度量组在度量组-2分析服务处理任务中需要2个小时。因此，总共需要大约3个小时来完成处理，而不是5-6个小时。
浏览 10提问于2013-10-19得票数 1
我想分析字符数组中的全角或半角字符。char [] password = {'t'，'e'，'s'，'t'，‘思’，‘題’}；全宽=思，題非常感谢!
浏览 10提问于2012-11-22得票数 3
有没有人在使用oracle分析函数时遇到过性能缓慢的问题？使用lead() oracle分析函数在表中生成一个新字段。基本上，它允许将前一行的字段值用作当前行的新字段的值。explain计划指示对使用oracle分析函数的表执行全表扫描。为了避免这次全表扫描的开销，我可能只需要使用after insert/update触发器用前一行的值手动填充一个具体字段
有没有人因为oracle分析函数的高成本而决定不使用它？是否应该很少使用oracle分析函数？
浏览 2提问于2009-09-23得票数 10
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我试图在NIST的下面一页的底部复制这个示例：
我试过：summary(aov(Measure~factor(Machine)/factor(Operator),data=mydata))谢谢你的帮忙Operator;Machine;Replicate;Measure1;1;2;0.127
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浏览 1修改于2015-01-17得票数 0
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我有一个写得很好的perl代码(不是我编写的)，我想使用它进行一些分析，并需要它用不同的输入参数迭代1000次以上。C3_E3_C4_E4_java.latest.cmh --min-count 20 --min-coverage 30 --max-coverage 400 --population 1-2,3-4,5-6,7-8 --remove-temp
现在我想运行相同的代码1000次，但是每次都要更改--population参数，比如第一次在哪里运行1-2,3-4,5-6,7-8，下一次就变成1到8的随机排列，
浏览 4修改于2020-11-20得票数 1
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运行时间(5-6分钟)令人惊讶地长。在这个之后，我执行了CPU profiling，结果发现CPU time的70%+是正在运行的与垃圾收集相关的代码。现在，我尝试了内存分析，但是我的所有代码都没有出现在结果中。这是我第一次分析程序--我不知道如何对程序进行优化，也不知道在哪里寻找问题。我很感谢你的帮助。提前感谢！
浏览 13提问于2017-06-28得票数 0
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我们的一些网页有第三方分析运行在后端。在我看来，selenium正在等待这些过程完成，然后再进入下一步。问题是它大约需要5-6分钟。有什么办法让我们坐上这个等待，然后继续下一步吗？
浏览 2提问于2014-02-23得票数 4
我正在尝试使用Clickhouse进行一些漏斗分析。我知道sequenceMatch/windowFunnel函数，但它们允许在序列之间发生事件。a=4', 6]
我想评估的是，在上面的事件序列中，用户直接从页面导航到页面3，事件1->2，4->5和5-6。
浏览 72提问于2021-02-16得票数 2
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