回答情况：
提问时间：
问题标签：
我的目标是从NCBI下载完整的后生动物基因组序列。我有一张我需要的基因组序列的唯一ID号的列表。
浏览 3修改于2016-05-30得票数 1
print recordid_L = record["IdList"]print len(id_L)
然而，只有3种鸟分枝杆菌(全基因组序列和完整的注释
浏览 22修改于2014-08-26得票数 1
我目前正在尝试进行全基因组分析，我真的想知道我是否使用了正确的结构格式。我在网上找不到关于如何以及在哪里存储数据以提高效率的真实信息。
浏览 2提问于2016-12-07得票数 0
我有一个数据帧(pLog)，其中包含针对大肠杆菌基因组(4.6MB)进行的chip-seq实验的每个核苷酸的读取次数。我希望能够在X轴上绘制染色体位置，在Y轴上绘制读取次数。
浏览 26修改于2020-04-25得票数 0
回答已采纳
我只需要从NCBI (GenBank(full)格式)下载完整的基因组序列。我对“全基因组”而不是“全基因组”感兴趣。gatunek, property='complete genome' )#title='complete genome[title]')结果我只得到了基因组的小片段我知道如何通过NCBI网站手动操作，但这非常耗时，我在那里使用的查询：
escherichia[orgn]
浏览 4修改于2013-08-27得票数 3
下面是一个FASTA文件的示例：(注意，序列之间有一条额外的行，在原始fasta文件中不是这样)
全基因组NC_001501.1肠杆菌噬菌体phiX184 sensu
全基因组
浏览 2修改于2017-06-28得票数 4
我正在使用一个全基因组关联研究数据集，p值从1E-30到1。我有一个R数据框架“数据”，其中包括p值的变量"p“。我需要执行p值的基因组校正，这是我使用以下代码所做的：有办法绕过这件事吗？
浏览 2提问于2014-06-16得票数 0
回答已采纳
是的，这是DNA，来自全基因组。我从包含不同脚手架的fasta文件中提取了这段DNA (在本例中是10和11 )。编辑:问题继续在这里：使用gff2而不是bash脚本从全基因组中提取部分DNA序列.
浏览 0修改于2017-04-13得票数 4
回答已采纳
我试图在一个类似于这样的文件中替换头部：蜜蜂 NC_037638.1 DH4连锁群LG1 Amel_HAv3.1全基因组猎枪序列
LG1
*LG1 is just an example, depending on
浏览 7提问于2022-11-19得票数 1
我正在使用scikit--学习做一项全基因组的关联研究，其特征向量约为100 SNPs。我的目标是告诉生物学家哪种SNP是“有趣的”。
浏览 0修改于2016-03-05得票数 7
回答已采纳
该函数还采用两个基因组，它们是具有5行10列的numpy 2d阵列的形式。基因组中每个位置的值要么是没有发生突变的地方的5个零，要么是对应于突变发生的点的突变列表的值。下面是一个基因组的例子，该基因组在位置0还没有突变，但在位置1已经有了突变。
[ [0, 0, 0 , 0, 0], [5, 2, 5 , 7, 8] ...]我试图完成的是高效地(我有一种有效的方法，但它是缓慢的)从我的两个基因组中生成子基因组，这是一个numpy数组和两个父基因组的随机组合(也
浏览 0修改于2014-03-17得票数 0
我正在处理大约1800个非典型肺炎冠状病毒2的全基因组序列，我只想保留"EPI_ISL_NC045512“模式，它在两个"|”之间。
浏览 1修改于2021-11-08得票数 0
我正在研究2600+基因组，希望研究不同群体的基因组、基因和基因间的特征。如果分类组只有很少的代表，就没有问题。在分类组具有多个基因组的情况下，我应该在什么基础上删除相似的基因组，以便从每个分类组中只获得几个代表。我是否应该使用lenght或GC%或其他特征来删除基因组-例如，如果两个基因组的GC%变异小于1%，我将删除它。类似这样的事情。请建议接受的方式，并友好地解释原因以及。tuberculosis alone which have
GC% range of 65.48 to 65.
浏览 1提问于2013-09-27得票数 0
我有数以百计的全基因组关联研究文件，大约一千万行。对于file1.txt123 12 0.1 0.01 0.1
...
浏览 1修改于2021-06-19得票数 1
回答已采纳
当提升我的全基因组数据时，我遇到了一个问题，即一些rs-number已经合并。这就引出了我的观点，SNP一定是被错误地分配了一次错误的位置(甚至是错误的染色体)。
浏览 0修改于2015-08-05得票数 0
1回答
目前，该程序使用多态性允许多种类型的基因组。，它可以有任何类型的行为，与其他的物状体类型没有任何共同之处，有些基因组使用直接的编码方案，不需要被解码成一个小体。因此，每个基因组都必须由用户向他相应的子类投射，才能揭露它的行为，这看起来非常丑陋。问题是基因组的每个子类都是--基因组，需要有一些特定的功能才能工作，所以多态性是非常有意义的。我希望能够创建任何类型的基因组(NeuralNetwork，Interface，一个图像，.)，所以我使用一个接口和子类来实现这一点，这样种群中的向量就可
浏览 0修改于2019-05-06得票数 0
回答已采纳
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号