- 综合排序
- 最热优先
- 最新优先
- 来自专栏生信技能树
巨噬细胞的Marker基因
关于巨噬细胞的前世今生，可以看我们最近分享的综述，以及前面的帖子： 巨噬细胞异质性及肿瘤微环境（上） 巨噬细胞异质性及肿瘤微环境（中） 巨噬细胞新分类体系（放弃传统M1和M2） M1和M2的巨噬细胞差异就在 Architecture of Lung Adenocarcinoma by Multiregion Single-Cell Sequencing》 髓系分类结果中的巨噬/单核结果：这里面就有组织驻留特异性巨噬细胞 immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development》，对巨噬细胞分了 ： (1) TREM2+巨噬细胞表达由骨髓细胞-2（TREM2）和骨桥蛋白（SPP1）基因， (2)表达叶酸受体2（+2）、透明质酸受体（LYVE-1）和甘露糖受体C-Type 1（MRC1/CD206 ）基因的+巨噬细胞 来自Immuno-cell-guide 这里基于细胞流式，放了Pan markers，M1/M2 macro, Mono, 组织驻留Macro以及神经组织中的巨噬即小胶质细胞的marker
1.4K11编辑于 2025-04-05 - 来自专栏生信技能树
多个物种的肾脏部位巨噬细胞比较
然后我确实搜索了一下， 这样的研究已经是很多了，比如多个物种的肾脏部位巨噬细胞比较，发表它的文章J Am Soc Nephrol. 2019 May;标题是：《Single-Cell RNA Sequencing 因为都是肾脏部位巨噬细胞，所以理论上标记基因是有一定程度的保守性的啦。 同样的道理，是不是可以做脑部区域的巨噬细胞（小胶质细胞）的跨物种比较呢？或者，T细胞，B细胞？ 学徒作业：完成 GSE128993. 里面的4个文件各自独立的单细胞流程，降维聚类分群即可！
72350编辑于 2021-12-24 - 来自专栏聊点学术
巨噬细胞的最新作用机制！
2020年6月30号，中国最牛心脏病医院——阜外医院胡盛寿院士/聂宇教授团队在Circulation上发表文章，揭示了巨噬细胞调节哺乳动物心肌再生的重要作用机制。 ? ? 这项研究的结论是： （1）心肌损伤后，巨噬细胞在损伤部位的募集对于心脏再生至关重要。抑瘤素M（OSM）可促进巨噬细胞募集，从而促进心肌细胞再生。 第一、巨噬细胞 既往大家的目光更多地放在了心肌细胞本身上，对于心肌细胞在疾病下的外环境关注度是近些年才逐渐起来的。 心肌损伤后的炎细胞，尤其是巨噬细胞的作用不断刷新大家认知。 除了心肌再生以外，巨噬细胞在心脏疾病中还发挥着其它重要作用，大家可以检索下面两篇论文，对巨噬细胞作进一步了解。 ? 第二、心肌再生 心肌细胞再生是很困难、但又很有科研意义的研究内容。
93530发布于 2020-08-04 - 来自专栏生信菜鸟团
从单细胞数据中捕捉巨噬细胞的极化信号
巨噬细胞极化（Macrophage Polarization）是指巨噬细胞在不同微环境信号刺激下，分化为不同功能表型的过程。 通常，巨噬细胞可以分为两种主要的极化表型： M1型巨噬细胞（经典激活型巨噬细胞）：由IFN-γ、LPS等信号诱导，具有促炎、抗微生物和抗肿瘤的功能。 M2型巨噬细胞（替代激活型巨噬细胞）：由IL-4、IL-13、IL-10等信号诱导，具有抗炎、组织修复和促肿瘤的功能。 目前的单细胞测序背景下，特别是针对不同类型的TME，研究者更倾向于将巨噬细胞分类为更精细的亚群，这有利于后续的轨迹分析。 但巨噬细胞极化是巨噬细胞共有的一个表型，我们如何对10多个macro亚型进行极化的评估呢？ 从这样的散点图，我们就更能更直观地观察到macro亚群向M1或M2极化的趋势。 如何实现呢？
1K10编辑于 2025-03-06 - 来自专栏生信技能树
我的巨噬细胞少了一个亚群吗，我错了吗
pwd=a7s1） ，这样的话，很多看直播的小伙伴们就“如临大敌”，觉得做错了，很明显文章里面的给出来了两个不一样的髓系免疫细胞，但是我统一操作成为了巨噬细胞。 就算是髓系免疫细胞包括巨噬细胞，我演示的巨噬细胞少了一个亚群呀： 我统一操作成为了巨噬细胞 这个时候就回答了大家关心的另外一个话题了，降维聚类分群的时候设置的分辨率这个参数不高！ ）： 提高分辨率就可以继续细分 再认真看细分之后的各个亚群的特异性高表达量基因，就可以看到了文章里面的Trem2特异性亚群就是上面的编号8的亚群 ，而编号4是另外一个特异性基因比如 Chil3特异性巨噬细胞 而且也并不是说巨噬细胞就两个亚群，我们之前就分享过：【巨噬细胞新分类体系（放弃传统M1和M2）】，一切都是数据结果合理的挑选和解释而已。 另外，我们通常是并不会选择提高分辨率这个手段来获取精细的单细胞亚群，而是取巨噬细胞子集后，继续进行降维聚类分群后再命名的策略。
32400编辑于 2024-11-21 - 来自专栏生信菜鸟团
2023年度细胞类型，我投巨噬细胞一票
一年之后，我们把2023年度细胞类型颁发给巨噬细胞(macrophages)，也就是中性粒细胞(Neutrophil)的同胞兄弟。为什么说巨噬细胞是中性粒细胞的同胞兄弟呢？ 所以我们把这一票，投给了巨噬细胞，一颗已经在教科书中以清道夫的角色存在了一百多年的细胞类型。 巨噬细胞的广泛作用已经被广泛讨论，在不同组织有不同的作用。 文字重点关注具有组织特异性的巨噬细胞，这就是我们把2023年度单细胞颁给巨噬细胞的原因，老树开花，一如文章中鉴定了15种巨噬细胞亚型，其中包括两种新的巨噬细胞亚型，即存在于表皮、睾丸、心脏等外周组织的类小胶质细胞 Nature immunology, 2023: 1-15.中我们看到巨噬细胞在调节免疫抑制的潜力。 从第一次在显微镜下看到巨噬细胞，到作为细胞药物的选项，这条路我们走了百年。 这也是我们在2023年度细胞类型投票给巨噬细胞的原因之一，我们不仅在发现它，更重要的是，巨噬细胞可以治病救人。 此刻，正在阅读文章的你，体内2乘10的11次方的巨噬细胞，约600克，与你在一起。
33110编辑于 2024-01-04 - 来自专栏单细胞天地
学徒作业|GSE217845-胰腺癌中的巨噬细胞细分亚群
学徒作业的要求是：从上面的数据集GSE217845里面的10个胰腺癌的10x技术单细胞转录组数据的第一层次降维聚类分群里面提前髓系免疫细胞后，继续细分降维聚类拿到里面的巨噬细胞，然后继续细分巨噬细胞看看能否复现文章里面的 去除非巨噬细胞的细胞类型：5是cDC2细胞，12是T细胞。将其他文章中没有出现的巨噬细胞类型命名为other，得到最终的命名结果。 最终命名的代码如下： # 去除非巨噬细胞的细胞类型：5是cDC2细胞，12是T细胞 sce_myeloid = sce_myeloid[, ! 巨噬细胞的这种规则的亚群命名还是挺常见的，比如另一篇文献《Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive
70710编辑于 2024-04-15 - 来自专栏北野茶缸子的专栏
读文献05-肿瘤与非肿瘤相关巨噬细胞差异
macrophages boost tissue-resident memory T cells infiltration and survival in human lung cancer 肿瘤相关巨噬细胞 ：scRNA+bulk联合分析高分思路 IF：12 数据 肿瘤提取巨噬细胞与非肿瘤相关巨噬细胞。 下结论，肿瘤相关巨噬细胞是和M2 型有些关系的： Together, these data indicate that TAMs in lung cancer expressed higher levels 两种巨噬细胞状态模拟方法。 文章里的分类方法还是蛮有意思的： enriched cluster，也就是说，通过常规的分群方法，去看定义的某个类型的比例，去做判断。 (b) 刺激的多向性和标记物缺乏细胞特异性，表明巨噬细胞的极化部分取决于在屏障未能阻止感染的情况下巨噬细胞迁移和执行特定功能的能力。
72830编辑于 2022-12-10 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 教你高效区分脾脏、骨髓等组织驻留巨噬细胞
，被大量招募到病变区域，补充或替换原有的巨噬细胞群体，如感染后病变组织周围的浸润巨噬细胞。 巨噬细胞：CD11bmidF4/80hi巨噬细胞或CD11bmidCD64hi巨噬细胞，多为活化的炎症型巨噬细胞，以“强效抗感染和免疫清除”为核心。II. 巨噬细胞：CD11bhiF4/80mid/hi巨噬细胞或CD11bhiCD64mid巨噬细胞，多为急性感染期红髓区和白髓区活化的巨噬细胞，用于评估脾脏稳态应激状态与早期免疫异常。III. 巨噬细胞：CD11blowF4/80low巨噬细胞或CD11blowCD64-/low巨噬细胞,多为定居于脾脏边缘区，白髓与红髓交界处的巨噬细胞（Marginal Zone Macrophage, MZM 小鼠腹水巨噬细胞为CD11bhi/midF4/80hi/mid巨噬细胞，是炎性活化的巨噬细胞，进一步分析该细胞群中CD206和CD86的表达，不同的细胞比例和分群代表巨噬细胞的不同功能状态。
77710编辑于 2025-09-22 - 来自专栏生信菜鸟团
单细胞+bulkRNA分析前列腺癌中巨噬细胞相关基因
鉴定了巨噬细胞标记基因，并根据scRNA-seq分析描述了TAM与TME内其他细胞类型之间的细胞间通讯。通过bulkRNA-seq分析，使用WGCNA构建了巨噬细胞的共表达网络来识别巨噬细胞相关基因。 接下来将上述三个数据集中与巨噬细胞高度相关的模块中的这些基因与单细胞数据集中的巨噬细胞标记基因进行交叉，最终获得了65个与巨噬细胞高度相关的基因用于后续分析。 5.PCa 中巨噬细胞相关分子亚型的鉴定以及亚型之间免疫景观的表征 将TCGA-PRAD队列中的497名PCa患者分为两个不同的亚型，其中 263个样本属于巨噬细胞相关基因亚型1和巨噬细胞相关亚型2中的 根据ssGSEA结果，高危组的免疫细胞(包括巨噬细胞)的浸润程度更高。风险评分与巨噬细胞、巨噬细胞M1和巨噬细胞M2的细胞含量呈正相关。 高危组具有更活跃的免疫功能，包括检查点、HLA和巨噬细胞。 结果表明，巨噬细胞、巨噬细胞M1和巨噬细胞M2与NCF4表达呈显著正相关。 在TCGA-PRAD队列和CPGEA队列中，NCF4在正常组织中的表达显著高于肿瘤组织。
74110编辑于 2024-04-30 - 来自专栏单细胞天地
同时表达巨噬细胞和b细胞标记基因的亚群是全新亚群吗
associated with enhanced phagocytic capability and chemotactic function after ischemic stroke》，主要的结论就是同时表达巨噬细胞和 而且里面就五百多个细胞是b细胞，然后针对b细胞进行细分的时候，可以很清晰的看到里面的c2这个亚群确实是大量表达了巨噬细胞相关的标记基因了 ： 大量表达了巨噬细胞相关的标记基因 这个数据挖掘的写作点，是主要做了两个数据分析来说明这个同时表达巨噬细胞和 不过，更重要的是研究者从两个方向加强了这个证据，说明了同时表达巨噬细胞和b细胞标记基因的亚群是全新亚群。 流式细胞实验验证 如下所示，通过b细胞和巨噬细胞的蛋白质表面标记物，确实是可以流式获取到同时表达巨噬细胞和b细胞标记基因的单细胞亚群： 流式细胞实验验证 公共数据库验证 如下所示的5个数据集 (GSE171169 , GSE197731, GSE175430, GSE128855, GSE163120) 都是有 类似的现象，同时表达巨噬细胞和b细胞标记基因的亚群 5个数据集 (GSE171169, GSE197731
49110编辑于 2024-05-11 - 来自专栏生信技能树
巨噬细胞新分类体系（放弃传统M1和M2）
很早之前我们就总结过虽然虽然M1和M2的分类深入人心，但是在单细胞水平里面正确的做法可能是放弃M1和M2，详见：M1和M2的巨噬细胞差异就在CD86和CD163吗，很多单细胞文章都表明了巨噬细胞的M1和 能泾渭分明的巨噬细胞分类 2022的一篇CELL文章：《Tissue-resident FOLR2+ macrophages associate with CD8+ T cell infiltration in human breast cancer》就提到了里面的巨噬细胞可以分类成为2个： (1) TREM2+ macrophages expressing triggering receptor expressed Reprogramming of Endothelial Cells Drives Immunosuppressive Macrophages in Hepatocellular Carcinoma》，可以看到也是多个巨噬细胞 所以上面的GSE234933数据集，会得到大概如下所示的分群，巨噬细胞属于髓系免疫细胞： 巨噬细胞属于髓系免疫细胞 然后提取里面的巨噬细胞，进行细致的分析，比如绘制 Scatter plot of
9K30编辑于 2023-09-19 - 来自专栏生命科学
巨噬细胞靶向胆固醇还原酶 DHCR7 抑制剂 | MedChemExpress
文章亮点 多种感染可下调巨噬细胞 DHCR7 的表达，但上调 AKT3 的表达。 首先，研究人员对肝炎感染病人的样本、多类病毒感染的小鼠肝组织或巨噬细胞进行基因筛选，发现 DNA 和 RNA 病毒感染后巨噬细胞会降低 DHCR7 的表达。 DHCR7 抑制 IRF3 的激活导致 IFN-I 转录的降低 DHCR7 酶活对调节 INF-β 至关重要，研究人员利用 DHCR7 抑制剂处理巨噬细胞发现，在水疱性口炎病毒 (VSV)、寨卡病毒 ( ZIKV) 中 Ifnb 的表达量升高；通过抑制 DHCR7 可以预防巨噬细胞受 VSV、ZIKV 感染。 通过突变与感染 VSV 巨噬细胞，证明了 7-DHC 依赖于 AKT3 调节 IRF3 Ser385 的磷酸化。
39730编辑于 2023-03-03 ZETA life介导THP-1细胞BAMBI基因调控巨噬细胞极化研究
文章核心总结：BAMBI通过调控巨噬细胞极化、糖酵解及脂代谢影响肝癌预后，揭示其作为预后标志物的潜力。 2. ZETA life转染试剂应用： ● 转染细胞：Huh7（肝癌细胞）、THP-1（单核细胞，分化为M0/M1/M2巨噬细胞）。 ◦ THP-1细胞: 实现了BAMBI基因的过表达和敲低，进而影响了巨噬细胞的极化状态，表明BAMBI基因在促进M1巨噬细胞极化中扮演重要角色。 5. ● THP-1分化实验（图9A-B）： ◦ M1巨噬细胞中BAMBI表达高于M0，M2无显著差异； ◦ 过表达BAMBI促进THP-1向M1极化（CD11c、IL-12升高），敲低则抑制 ◦ 作用：证明BAMBI直接调控巨噬细胞M1极化。 6. 合规性说明：以上内容严格遵循学术规范，数据引用均来自原文公开信息，未涉及版权争议。
27110编辑于 2025-06-16- 来自专栏作图丫
巨噬细胞的分子特征与肿瘤免疫微环境联合分析！
先前的研究发现，巨噬细胞积极参与肿瘤的生长。 背景介绍 大家好呀！ 作者基于先验知识从巨噬细胞入手，对巨噬细胞相关基因基因进行聚类，应用Pamr、SVM和神经网络来验证聚类结果，用体细胞突变和甲基化来定义已确定的集群的特征。 结果解析 01 识别巨噬细胞密度作为一个潜在的预后标志物 作者通过WGCNA从turquoise模块中提取了945个基因，用于后续生成的巨噬细胞密度。 对M2巨噬细胞标记物CD163的IHC染色显示，高MScores的样本中CD163的表达量较高(图5g)。 图7 小编总结 通过确定一个包含26个巨噬细胞特异性基因的基因特征，并分析了它们在胶质瘤中的预后价值，结果证明了巨噬细胞在胶质瘤进展中的调节作用。
70340编辑于 2022-03-29 - 来自专栏单细胞天地
单细胞转录组分析COVID-19重症患者肺泡巨噬细胞亚型
iScience DOI：https://doi.org/10.1016/j.isci.2021.103030 一句话概括 数据分析文章：scRNA分析重症COVID-19患者多个样本，得到一种单核细胞衍生的肺泡巨噬细胞
68430发布于 2021-11-19 - 来自专栏单细胞天地
单细胞转录组揭示结肠类器官中的巨噬细胞生发与功能
但是，近年来的动物研究表明，很多器官在胚胎发育中的纳入的组织驻留型巨噬细胞是独立于HSC的，来自于胎儿前巨噬细胞。 小鼠小肠和结肠含有稳定的、自我更新巨噬细胞群，这些巨噬细胞既有来自于胚胎祖细胞，也有来自于HSC。胎儿结肠中组织驻留巨噬细胞的胚胎发育过程目前还没有报道。 HCO巨噬细胞获得了类似于人胎儿小肠和大肠组织巨噬细胞的转录特征。HCO巨噬细胞根据促炎和抗炎信号调节细胞因子的分泌，能够吞噬致病菌并产生强烈的免疫的反应。 HCO中的巨噬细胞在转录上与人类胎儿结肠中的巨噬细胞相似 小鼠的谱系追踪研究表明，前巨噬细胞和胎儿单核细胞可以在发育早期定植器官，并产生组织驻留巨噬细胞，这种巨噬细胞持续到出生59岁，并贯穿一生。 与胎儿的数据进行比较也发现，HCO中的巨噬细胞在基因转录特征上与胎儿结肠中的组织驻留巨噬细胞高度类似。
58310编辑于 2023-11-25 - 来自专栏生信技能树
你的肿瘤单细胞肿瘤数据能区分这7种巨噬细胞吧
刷到了一个2022的巨噬细胞相关的单细胞综述文章：《Macrophage diversity in cancer revisited in the era of single-cell omics》，这篇综述文章深入探讨了肿瘤相关巨噬细胞 类似M1样巨噬细胞，但表现出免疫抑制功能。 高表达免疫检查点分子PD-L1和IDO。 2. RTM-TAMs（组织驻留型TAMs） 类似正常组织驻留巨噬细胞，表达LYVE1、HES1和FOLR2。 在肿瘤侵袭和进展中可能发挥促进作用。 7. 我们之前就分享过：【巨噬细胞新分类体系（放弃传统M1和M2）】，一切都是数据结果合理的挑选和解释而已。 另外，我们通常是并不会选择提高分辨率这个手段来获取精细的单细胞亚群，而是取巨噬细胞子集后，继续进行降维聚类分群后再命名的策略。
1.5K10编辑于 2024-11-21 AbMole丨重组干扰素γ：免疫应答与巨噬细胞极化的调控因子
IFN-γ（干扰素γ）是M1型巨噬细胞极化的关键细胞因子。 巨噬细胞具有多种功能，主要包括吞噬病原体、清除死亡细胞、调节炎症反应以及参与组织修复等。 巨噬细胞具有很强的可塑性，在不同的组织微环境和外界刺激下，可以极化为不同的亚型，其中最典型的是M1（促炎，经典活化的巨噬细胞）型和M2（抗炎，替代激活的巨噬细胞）型。 （1）M1型巨噬细胞（经典激活的巨噬细胞）：主要由细菌、病毒等病原体的成分（如LPS）或细胞因子（如IFN-γ）激活。 （2）M2型巨噬细胞（替代激活的巨噬细胞）：通常由抗炎细胞因子（如IL-4、IL-13）或免疫复合物激活。
22310编辑于 2025-12-26- 来自专栏技术文章
Elabscience 巨噬细胞代谢攻略：解锁 M1M2 极化的能量密码
巨噬细胞极化后，自身能量代谢变化显著。促炎性巨噬细胞（M1型）表现出糖酵解代谢、磷酸戊糖途径（PPP）、脂肪酸合成（FAS）增强，TCA循环和线粒体氧化磷酸化（OXPHOS）受损。 抗炎性巨噬细胞（M2型）的代谢特征是OXPHOS、FAS和谷氨酰胺代谢增强，PPP降低。精氨酸代谢同样与巨噬细胞极化密切相关。 巨噬细胞极化中的代谢变化[1]Elabscience®一站式研究巨噬细胞代谢解决方案：从极化诱导到多维度代谢检测为了助力巨噬细胞代谢检测，我们对多种巨噬细胞进行了一系列实验。 首先培养诱导巨噬细胞极化，再通过代谢试剂盒检测能量代谢和精氨酸代谢关键指标的变化。实验结果巨噬细胞能量代谢检测结果图2. 巨噬细胞精氨酸代谢检测结果图5. BMDM巨噬细胞诱导M1和M2型极化后，检测细胞内精氨酸酶活性（E-BC-K848-M）。结果显示，M2型的精氨酸酶活性显著增加，M1型无变化。
85510编辑于 2025-09-22
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号