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BioLamina LN521全长层粘连蛋白包被基质指南：iPSC稳定扩增、单细胞传代与临床级培养实践
摘要： 本文围绕诱导多能干细胞（iPSC）培养过程中基质包板这一关键环节展开分析，系统介绍BioLamina全长层粘连蛋白521（LN521）的产品特点、作用机制及标准化包板流程，同时对LN521、MX521 关键词： BioLamina、LN521、全长层粘连蛋白521、iPSC扩增、干细胞培养、单细胞传代、无动物源基质、细胞培养基质诱导多能干细胞（iPSC）因具备自我更新能力和多向分化潜能，已成为再生医学 在这一背景下，全长人重组层粘连蛋白521（LN521）逐渐成为iPSC培养领域的重要基质之一。 二、BioLamina LN521的核心特点BioLamina开发的LN521属于全长人重组层粘连蛋白，其结构与人体天然层粘连蛋白521高度一致，能够更真实地模拟胚胎干细胞及iPSC所处的天然细胞外基质环境 全长层粘连蛋白521通过模拟天然细胞外基质环境，为iPSC扩增、单细胞培养及长期传代提供了更加稳定的培养条件。
12210编辑于 2026-06-16 - 来自专栏细胞培养
全长Laminin在肝细胞培养与3D肝类器官中的应用：LN521、LN111、LN411促进hPSC来源肝细胞成熟的研究解析
关键词：LN521、LN111、LN411、laminin、层粘连蛋白、肝细胞培养、原代肝细胞、3D肝类器官、hPSC、肝细胞分化、BioLamina一、为什么肝细胞培养越来越关注全长层粘连蛋白（laminin 因此，人重组全长层粘连蛋白（laminin）开始受到越来越多关注，并逐渐成为构建高生理相关性培养体系的重要方向。 其中，LN521、LN111与LN411是目前肝细胞培养与肝类器官研究中较受关注的几种全长层粘连蛋白。 从细胞培养逻辑来看，全长层粘连蛋白不仅仅是“贴壁材料”，它们还会影响细胞形态、细胞极性建立、细胞迁移以及细胞分化状态。 相比传统3D培养体系，基于全长层粘连蛋白建立的培养模型，还能够降低肝球体之间的差异性，并提高培养一致性。
15210编辑于 2026-05-12 - 来自专栏iPSC诱导多能干细胞培养
LN521层粘连蛋白在人多能干细胞培养中的成本与扩增优势：全长Laminin培养体系解析
随着干细胞研究、再生医学以及细胞治疗方向的发展，人重组全长层粘连蛋白（Laminin）由于具有较高生理相关性、批次稳定性以及标准化优势，逐渐成为hPSC培养体系的重要组成部分。 关键词：LN521、Biolaminin521、全长Laminin、hPSC培养、人多能干细胞、iPSC培养、层粘连蛋白、干细胞培养基质、细胞扩增一、为什么hPSC培养越来越关注培养基质选择？ 近年来，全长层粘连蛋白（Laminin）由于能够提供更接近人体天然环境的培养条件，开始受到越来越多研究关注，其中Biolaminin521（LN521）已逐渐成为较常见的人多能干细胞培养方案之一。 图1.从早研到临床转化均适用的laminin521二、Biolaminin521（LN521）主要特点LN521属于人重组全长层粘连蛋白，与传统动物来源培养基质相比，其具有更高生理相关性和更好的实验一致性 基于全长层粘连蛋白构建的人源培养环境，也有望在基础研究、药物开发以及临床前研究中发挥更大作用。
14310编辑于 2026-05-22 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录之circRNA（ONT ）-- CIRI-long
因此，确定其的全长序列，是进行circRNA功能研究的重要基础。 近期的研究中利用了长读长测序技术，对circRNA的全长重构进行了尝试（3-4）。 ：利用随机引物对circRNA进行的滚环反转录扩增后，使用三代纳米孔测序技术（ONT）对circRNA的全长序列进行直接测序，并开发了CIRI-long 算法，实现对长测序读段中的circRNA序列进行识别和全长重构 ，先前的测序方法无法实现对全长circRNA的高通量检测。 此方法利用了三代纳米孔测序的长读长优势，实现了对全长circRNA序列的无偏重建（图2）。
98620编辑于 2024-04-07 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- Bambu
今天我们继续介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - Bambu。 Bambu 保留了全长和独特的转录本序列，使其在存在非活跃转录本（isoforms) 的情况下能够进行准确的定量。与现有的转录本鉴定方法相比，Bambu 在不损失灵敏性的情况下实现了更高的精度。 #加载bambu软件包 library(bambu) #运行以下命令进行测序数据，参考基因组，参考基因组注释文件的导入，并进行全长转录组分析 test.bam <- system.file("extdata gtf.file) #参考基因组注释预处理 se <- bambu(reads = test.bam, annotations = bambuAnnotations, genome = fa.file) #全长转录组分析 assays(se)$fullLengthCounts - 每个转录本的全长序列count表达量。 assays(se)$uniqueCounts - 每个转录本唯一回贴序列的count表达量。
2.6K22编辑于 2024-03-13 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- Flair
今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本校正，聚类，可变剪切分析，定量和差异分析为一体的工具 - FLAIR。 虽然已知SF3B1基因中的体细胞突变会导致基因剪接发生变化，但识别全长转录本异构体（isoform）的变化可能会更好地阐明这些突变的功能后果。 全长转录本分析将多个可变剪接事件联系在一起，可以更好地估计有效与无效异构体（isoform）的丰度。此项工作展示了纳米孔测序在癌症和转录本剪接研究中的潜在实用性（图2）。 如果下机数据来自 Oxford Nanopre（ONT）平台，建议对原始数据使用Pychopper后（目的是鉴定全长转录组本），再运行FLAIR。 #支持序列必须都是全长（80%的覆盖率，第一个和最后一个外显子至少有25个碱基）。
5.1K22编辑于 2024-04-12 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- IsoQuant
今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - IsoQuant。2023年1月2日，康奈尔大学医学院Hagen U. Tilgner团队和圣彼得堡国立大学Andrey D. 一、软件介绍 IsoQuant 是一款基于基因组的长RNA序列（全长RNA）分析软件，适用于长度长三代测序平台，比如PacBio和Oxford Nanopores. -fastq CCS.fastq \ --reference reference.fasta --genedb genes.gtf --output output_dir 关于Full length全长序列 ，PacBio可通过isoseq软件获得，具体参考全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) ；ONT可通过pychopper软件获得，具体参考全长转录组 | Oxford Nanopore (ONT) 三代全长转录组分析流程 -- 数据质控和预处理。
3K10编辑于 2024-02-22 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Oxford Nanopore (ONT) 三代全长转录组分析流程 -- 数据质控和预处理
ONT全长转录组测序是指基于牛津纳米孔公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）三代测序平台进行的全长转录组测序。 三、ONT全长转录组的分析流程PacBio全长转录组有官方自己开发优化的转录本聚类软件软件和流程，IsoSeq（https://isoseq.how/）。 ONT全长转录组数据分析前，需要对下机数据进行质控和全长转录本的鉴定，才能作为上述软件的输入文件，这次我们先对ONT数据进行质控和预处理，将数据准备好，进行下一步的分析。 全长转录本序列鉴定 -- PychopperPychopper是鉴定，定向和修剪全长Nanopore cDNA序列的工具，该工具还可以修复融合的序列。 参考文献：Nanopore三代全长转录组ONT全长转录组测序系列一：初识篇基因结构预测新利器-ONT全长转录组Park, Eddie et al.
9.6K23编辑于 2024-02-05 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | PacBio 全长转录组测序的时代是否已经来了？ Kinnex full-length RNA Kit测评
至此，PacBio和ONT两大三代测序平台推动三代全长转录组进入了快速发展的时期。逐渐降低的测序价格，以及对转录本层面精细挖掘的需求，最终会使三代全长转录组测序逐步替代传统的二代RNA-seq。 文中将此技术方法运用于单细胞测序，来增加获得单个细胞全长转录本的个数。 全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （3）-- SQANTI3 v5.2 全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- IsoQuant 诺禾致源官方公众号：新品发布 | Kinnex HiFi全长转录组革新揭幕转录组科研新章！ 安诺基因官方公众号：PacBio Kinnex全长转录组技术“靓相”科研圈，实测混样数据大公开 贝瑞基因Kinnex全长转录组解决方案
2.9K31编辑于 2024-04-02 - 来自专栏生信技能树
全长转录组分析之牛津纳米孔测序介绍
此次专题主要学习和记录一些在分析ONT测序产品如ONT全长转录组，ONT甲基化以及ONT重测序中的所思所想所得。 library prep High yields for large genomes 总结就是： 1.单分子测序：纳米孔每次只通过一个碱基 2.测序读长长：相比于二代测序最常见的150bp，三代ONT全长转录组平均读长为
4K30发布于 2020-02-20 - 来自专栏新智元
全长仅0.3毫米！世界最小计算机问世！
---- 新智元编译 来源：密歇根大学新闻 编辑：克雷格 【新智元导读】最近，密歇根大学制造出了全长只有0.3毫米，超越了IBM公司今年3月展示1x1毫米大小的计算机，成为世界上最小的计算机。 最近，美国密歇根大学制造出了世界上最小的计算机，全长只有0.3毫米，超越了IBM公司今年3月展示1x1毫米大小的计算机。
77000发布于 2018-07-31 - 来自专栏三代测序-说
微生物全长16S | Full-length 16S Analysis -- PacBio Hifi Reads
一、PacBio全长16S rRNA基因测序 PacBio全长16S rRNA基因测序采用27F、1492R引物扩增全长片段（覆盖V1-V9区），采用PacBio SMRT测序平台CCS（Circular 当测序酶读长达到 8Kb时，即可满足一条1.5Kb的16S rRNA基因序列循环矫正5次 （图4），最终获得高质量的16S全长序列。 可以将所有文件下载保存，或上传分析服务器进行后续全长16S分析。 可用以下代码，将样本重新命名。 根据要求制作metadata.tsv 和 sample.tsv两个文件，就可以按照示例进行PacBio全长16S分析流程了。 6. PacBio 16S全长测序：一种高效且经济的微生物组研究方法 。
6.2K20编辑于 2024-02-09 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （1）
2023年10月初推出的Kinnex全长RNA建库试剂盒，能将5个转录本串联成一条测序read，充分利用其读长长的优势，提高测序通量，配合Revio系统一起使用，使得对全长转录本进行定量变得更为实际。 二、Iso-Seq 全长转录组分析流程1. clean reads 就已经是转录本的序列了，我们首先看一下clean reads 当中，哪些是全长转录本；哪些不是全长转录本。 全长转录本的示意图，如图8：对于全长转录本而言，其ROI reads 中包含5‘ primer 和 3‘ primer; 而且会出现polyA 为结构；（polyA 针对mRNA和部分lncRNA）。 Iso-Seq软件Iso-Seq是PacBio官方开发的一款用PacBio subreads 或 HiFi 数据进行全长转录组分析的一款软件，最终输出高质量转录本的全长序列。
18.2K21编辑于 2024-01-23 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | ONT Direct RNA测序 (DRS) 技术原理、数据分析和应用
因此，基于三代长读长测序平台的全长转录组成为新的研究热潮。 PacBio Iso-Seq， 基于PacBio三代测序平台的mRNA Iso-Seq建库测序流程能够检测长达15 kb的全长转录本序列，有助于发现大量先前未注释到的转录本，并可通过全长序列确认早期基于跨物种同源序列的基因预测结果 ONT cDNA-PCR，基于ONT三代测序平台的cDNA-PCR建库测序流程也可以检测全长转录本，而且适用于单细胞全长转录组测序。同样使用模板置换反转录，PCR扩增来制备全长转录本文库（图5）。 Switching Oligos ，TSO)，加入5'端PCR扩增引物，最后通过PCR对全长转录组进行扩增，然后建库测序 (图8，图9）。 使用ONT测序技术（直接 cDNA & 直接 RNA），无需PCR扩增，可以提供无偏倚（bias）、全长、链特异性的RNA序列。
5.5K22编辑于 2025-07-17 - 来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（8）| 三代全长转录本该如何鉴定？
全长转录本的分子标记：引物与Poly(A)尾 李老师首先回顾了全长转录组测序的建库基础：“无论是PacBio的Iso-Seq，还是ONT的cDNA-PCR建库流程，其核心都是利用真核生物成熟mRNA特有的 正是这些独特的分子标记——两端的引物序列和末端的poly(A)尾——成为了我们鉴定全长转录本的关键“身份证”。通过识别并利用这些特征，我们才能有效地筛选出完整的、高质量的全长转录本序列。 工具，通过识别序列双端引物以及poly(A)尾序列来鉴定和提取全长转录本。” 李老师着重指出，“在对ONT原始数据进行质控时，务必保留其双端引物序列，否则pychopper将无法识别全长转录本。有些同学在质控阶段就把引物过滤掉了，导致后续无法进行全长鉴定。” 这一点在实际操作中极易被忽视，却直接影响到全长信息的获取。 全长鉴定的意义：为后续分析奠基 “在我们获得真正意义上的全长序列后，就可以放心地进行下一步的转录本参考基因组比对和表达定量了。”
48900编辑于 2025-07-04 - 来自专栏镁客网
西湖大学成功解析新冠病毒受体ACE2的全长结构
解析ACE2全长结构将有助于理解冠状病毒进入靶细胞的结构基础和功能特征，对发现和优化阻断进入细胞的抑制剂有重要作用。 策划&撰写：温暖 日前，西湖大学周强实验室利用冷冻电镜技术成功解析新冠病毒的受体——ACE2（血管紧张素转化酶2）的全长结构，这也是世界上首次解析出ACE2的全长结构，并且相关研究内容已经于今日凌晨在预印版平台 具体来说，西湖大学这次成功解析新冠病毒的受体ACE2的全场结构整个过程如下： 首先研究人员先要获取ACE2蛋白全长蛋白，但问题在于作为膜蛋白的ACE2难以在体外稳定获得。 清华大学全球健康与传染病研究中心主任张琳琦表示：“解析ACE2全长结构，将有助于理解冠状病毒进入靶细胞的结构基础和功能特征，对发现和优化阻断进入细胞的抑制剂有重要作用。”
78820发布于 2020-02-24 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （2） -- pigeon
一、Iso-Seq Collapse 在isoseq cluster完成以后，我们首先需要将高质量全长isoforms回贴到参考基因组上，然后进行isoseq collapse。 do-not-collapse-extra-5exons UHRR.mapped.bam UHRR.flnc.bam UHRR.collapsed.gff 二、Pigeon使用方法 Pigeon是一个PacBio转录工具包，包含了用于将全长转录本
3.6K11编辑于 2024-01-26 - 来自专栏量子位
欧洲批准最强粒子对撞机计划，造价210亿欧元，全长100公里，耗资巨大引争议
今天，欧洲核子研究中心（CERN）批准一份新文件：计划在瑞士日内瓦地下隧道中建造一个长达100公里的圆形超级对撞机，以推动高能物理学的前沿研究。
1K30发布于 2020-06-24 - 来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（7）：如何用三代测序技术解析全长转录本（Isoform）？
三代全长转录组的优势： 三代测序技术，凭借其数千乃至数万碱基的超长读长，能够轻松地一次性完整读取整个mRNA分子的序列，从5’端到3’端，无需拼接。 这使得我们能够直接、精确地获得一个基因所表达出的不同Isoforms的全长序列信息。 “这种从‘推测’到‘直击’的转变，是革命性的。” 技术原理浅析：如何捕获全长mRNA？ 大家可能会好奇，三代测序是如何特异性地捕获这些全长转录本的呢？ PCR扩增： 有了cDNA两端已知的引物结合位点，就可以进行PCR扩增，获得大量的全长cDNA双链分子。 例如，一些商业化服务（如贝纳基因的全长lncRNA测序产品）提供了针对性的解决方案。
78800编辑于 2025-06-28 - 来自专栏生信菜鸟团
AutoTax | 基于全长 16S 测序数据创建特定环境的菌群注释数据库
随着高通量全长 16S rRNA 基因测序方法的发展，我们可以快速生成覆盖真实多样性的高分类水平的 16s 全长数据库。然而，单靠提高序列覆盖率并不能解决许多未培养分类群的分类注释不佳的问题。 这也意味着用于生成注释数据库的全长 16S rRNA 频率可用作特定生态系统的系统发育信息权重（参见 qiime2 q2-clawback 插件）。 AutoTax 注释框架 ? 流程步骤： FL-ASV （全长 ASV 序列）首先与 SILVA 138 SSURef NR99 数据库进行比对，识别最邻近的物种并计算序列同一性； 根据序列同一性以及对应分类阈值，对上一步的比对结果进行过滤 AutoTax 程序的详细说明 生成全长 16S rRNA ASV 全长 16S rRNA 基因序列首先根据 SILVA 138 SSURef Nr99 数据库 使用 usearch -orient 命令固定序列方向
2.8K21发布于 2021-07-05
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