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BioLamina LN521全长层粘连蛋白包被基质指南：iPSC稳定扩增、单细胞传代与临床级培养实践
摘要： 本文围绕诱导多能干细胞（iPSC）培养过程中基质包板这一关键环节展开分析，系统介绍BioLamina全长层粘连蛋白521（LN521）的产品特点、作用机制及标准化包板流程，同时对LN521、MX521 在这一背景下，全长人重组层粘连蛋白521（LN521）逐渐成为iPSC培养领域的重要基质之一。 二、BioLamina LN521的核心特点BioLamina开发的LN521属于全长人重组层粘连蛋白，其结构与人体天然层粘连蛋白521高度一致，能够更真实地模拟胚胎干细胞及iPSC所处的天然细胞外基质环境 在包板浓度方面，初次使用LN521培养iPSC时通常建议采用10 μg/mL浓度进行包被。当细胞逐渐适应培养体系后，可根据实际情况调整至5 μg/mL，以兼顾培养效果与使用成本。 全长层粘连蛋白521通过模拟天然细胞外基质环境，为iPSC扩增、单细胞培养及长期传代提供了更加稳定的培养条件。
14610编辑于 2026-06-16 - 来自专栏细胞培养
全长Laminin在肝细胞培养与3D肝类器官中的应用：LN521、LN111、LN411促进hPSC来源肝细胞成熟的研究解析
关键词：LN521、LN111、LN411、laminin、层粘连蛋白、肝细胞培养、原代肝细胞、3D肝类器官、hPSC、肝细胞分化、BioLamina一、为什么肝细胞培养越来越关注全长层粘连蛋白（laminin 因此，人重组全长层粘连蛋白（laminin）开始受到越来越多关注，并逐渐成为构建高生理相关性培养体系的重要方向。 其中，LN521、LN111与LN411是目前肝细胞培养与肝类器官研究中较受关注的几种全长层粘连蛋白。 从细胞培养逻辑来看，全长层粘连蛋白不仅仅是“贴壁材料”，它们还会影响细胞形态、细胞极性建立、细胞迁移以及细胞分化状态。 相比传统3D培养体系，基于全长层粘连蛋白建立的培养模型，还能够降低肝球体之间的差异性，并提高培养一致性。
17410编辑于 2026-05-12 - 来自专栏iPSC诱导多能干细胞培养
LN521层粘连蛋白在人多能干细胞培养中的成本与扩增优势：全长Laminin培养体系解析
随着干细胞研究、再生医学以及细胞治疗方向的发展，人重组全长层粘连蛋白（Laminin）由于具有较高生理相关性、批次稳定性以及标准化优势，逐渐成为hPSC培养体系的重要组成部分。 关键词：LN521、Biolaminin521、全长Laminin、hPSC培养、人多能干细胞、iPSC培养、层粘连蛋白、干细胞培养基质、细胞扩增一、为什么hPSC培养越来越关注培养基质选择？ 近年来，全长层粘连蛋白（Laminin）由于能够提供更接近人体天然环境的培养条件，开始受到越来越多研究关注，其中Biolaminin521（LN521）已逐渐成为较常见的人多能干细胞培养方案之一。 图1.从早研到临床转化均适用的laminin521二、Biolaminin521（LN521）主要特点LN521属于人重组全长层粘连蛋白，与传统动物来源培养基质相比，其具有更高生理相关性和更好的实验一致性 基于全长层粘连蛋白构建的人源培养环境，也有望在基础研究、药物开发以及临床前研究中发挥更大作用。
16610编辑于 2026-05-22 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录之circRNA（ONT ）-- CIRI-long
因此，确定其的全长序列，是进行circRNA功能研究的重要基础。 近期的研究中利用了长读长测序技术，对circRNA的全长重构进行了尝试（3-4）。 ：利用随机引物对circRNA进行的滚环反转录扩增后，使用三代纳米孔测序技术（ONT）对circRNA的全长序列进行直接测序，并开发了CIRI-long 算法，实现对长测序读段中的circRNA序列进行识别和全长重构 ，先前的测序方法无法实现对全长circRNA的高通量检测。 /mm10_chr12.fa \ #参考基因组 -a .
1K20编辑于 2024-04-07 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- Flair
今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本校正，聚类，可变剪切分析，定量和差异分析为一体的工具 - FLAIR。 虽然已知SF3B1基因中的体细胞突变会导致基因剪接发生变化，但识别全长转录本异构体（isoform）的变化可能会更好地阐明这些突变的功能后果。 #支持序列必须都是全长（80%的覆盖率，第一个和最后一个外显子至少有25个碱基）。 in which both conditions contain fewer than E reads are filtered out (Default E=10 默认值为10。
5.1K22编辑于 2024-04-12 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- Bambu
今天我们继续介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - Bambu。 Bambu 保留了全长和独特的转录本序列，使其在存在非活跃转录本（isoforms) 的情况下能够进行准确的定量。与现有的转录本鉴定方法相比，Bambu 在不损失灵敏性的情况下实现了更高的精度。 #加载bambu软件包 library(bambu) #运行以下命令进行测序数据，参考基因组，参考基因组注释文件的导入，并进行全长转录组分析 test.bam <- system.file("extdata gtf.file) #参考基因组注释预处理 se <- bambu(reads = test.bam, annotations = bambuAnnotations, genome = fa.file) #全长转录组分析 assays(se)$fullLengthCounts - 每个转录本的全长序列count表达量。 assays(se)$uniqueCounts - 每个转录本唯一回贴序列的count表达量。
2.6K22编辑于 2024-03-13 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录组分析流程（PacBio & ONT ）-- IsoQuant
今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - IsoQuant。2023年1月2日，康奈尔大学医学院Hagen U. Tilgner团队和圣彼得堡国立大学Andrey D. 一、软件介绍 IsoQuant 是一款基于基因组的长RNA序列（全长RNA）分析软件，适用于长度长三代测序平台，比如PacBio和Oxford Nanopores. -fastq CCS.fastq \ --reference reference.fasta --genedb genes.gtf --output output_dir 关于Full length全长序列 ，PacBio可通过isoseq软件获得，具体参考全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) ；ONT可通过pychopper软件获得，具体参考全长转录组 | Oxford Nanopore (ONT) 三代全长转录组分析流程 -- 数据质控和预处理。
3K10编辑于 2024-02-22 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Oxford Nanopore (ONT) 三代全长转录组分析流程 -- 数据质控和预处理
ONT全长转录组测序是指基于牛津纳米孔公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）三代测序平台进行的全长转录组测序。 起始投入10ng 富集的RNA （polyA富集或者核糖体去除）或，500ng 总RNA。 三、ONT全长转录组的分析流程PacBio全长转录组有官方自己开发优化的转录本聚类软件软件和流程，IsoSeq（https://isoseq.how/）。 wdecoster/chopper软件安装$ conda install -c bioconda chopper软件使用#官方使用示例$ gunzip -c reads.fastq.gz | chopper -q 10 参考文献：Nanopore三代全长转录组ONT全长转录组测序系列一：初识篇基因结构预测新利器-ONT全长转录组Park, Eddie et al.
9.7K23编辑于 2024-02-05 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | PacBio 全长转录组测序的时代是否已经来了？ Kinnex full-length RNA Kit测评
PacBio利用此技术，联合10x Genomics单细胞平台推出了MAS-Seq for 10x Single Cell 3' Kit （图3），该方法能够将Sequel II测序仪上的测序通量增加至少 相对于传统Sequel II全长RNA单cell 2-4 M HiFi reads的产出，Kinnex-Revio有效数据量提升了10倍以上。 注： 表5， Max Length of S-Reads 2.66kb 根据图10来看应该是统计错误。 3. 六、总结 总体来说，如果有对PacBio Kinnex全长转录组有兴趣的老师同学，可以参照以下来选择测序深度： 现在5M reads大约6000左右/样，10M reads的建库测序9000左右/样。 如果按10M reads和六个样本来做的话（3个对照+3个实验组），价格依然不便宜。
3K31编辑于 2024-04-02 - 来自专栏生信技能树
全长转录组分析之牛津纳米孔测序介绍
此次专题主要学习和记录一些在分析ONT测序产品如ONT全长转录组，ONT甲基化以及ONT重测序中的所思所想所得。 library prep High yields for large genomes 总结就是： 1.单分子测序：纳米孔每次只通过一个碱基 2.测序读长长：相比于二代测序最常见的150bp，三代ONT全长转录组平均读长为 1-1.5kb(分析项目经验值)，最长读长约为10-20kb 3.测序速度快：不同系列时间有差异。 MinlON ONT最知名产品，仅有U盘大小，插入普通PC电脑即可运行，一次可运行一个flow cells，产出约10-30Gb的测序数据，运行时长约48小时； Flongle ?
4K30发布于 2020-02-20 - 来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（10）| Stringtie能用于三代全长转本的组装和定量吗？
然而，随着三代长读长测序技术的兴起，一个新的疑问摆在了我们面前：这个为短读长数据而生的经典工具，能否适应长读长、高复杂度的全长转录本数据呢？ 正如李老师最近被问到的：“二代RNA-seq的经典工具StringTie，能否用于三代全长转录组的定量（有参模式）？” 今天，我们就围绕这个问题，深入探讨StringTie在长读长时代如何焕发新生。 StringTie的演进：从短读长到长读长的华丽升级 答案是肯定的：StringTie完全可以用于三代全长转录本的组装和定量，并且表现出色。 StringTie在三代全长转录本分析中的实战流程 既然StringTie的表现如此优秀，那么在实际操作中，我们该如何将其应用于三代全长转录本的组装和定量呢？ 对于初次进行全长转录组分析的同学，直接使用Minimap2比对后，结合StringTie的长读长模式进行组装和定量，无疑是一个高效且可靠的选择。 好了，本期节目就到这里。
48910编辑于 2025-08-01 - 来自专栏新智元
全长仅0.3毫米！世界最小计算机问世！
---- 新智元编译 来源：密歇根大学新闻 编辑：克雷格 【新智元导读】最近，密歇根大学制造出了全长只有0.3毫米，超越了IBM公司今年3月展示1x1毫米大小的计算机，成为世界上最小的计算机。 最近，美国密歇根大学制造出了世界上最小的计算机，全长只有0.3毫米，超越了IBM公司今年3月展示1x1毫米大小的计算机。
77800发布于 2018-07-31 - 来自专栏三代测序-说
微生物全长16S | Full-length 16S Analysis -- PacBio Hifi Reads
16S rRNA基因存在于所有细菌的基因组中，长度约为1542 bp，包括 10 个保守区（Conserved region）和 9 个可变区（Variable region），保守区反映了物种间的亲缘关系 一、PacBio全长16S rRNA基因测序 PacBio全长16S rRNA基因测序采用27F、1492R引物扩增全长片段（覆盖V1-V9区），采用PacBio SMRT测序平台CCS（Circular 当测序酶读长达到 8Kb时，即可满足一条1.5Kb的16S rRNA基因序列循环矫正5次 （图4），最终获得高质量的16S全长序列。 拆分后的样本以demultiplex.barcode组合.hifi_reads.fastq.gz命名 （图10）。 可以将所有文件下载保存，或上传分析服务器进行后续全长16S分析。 PacBio 16S全长测序：一种高效且经济的微生物组研究方法 。
6.3K20编辑于 2024-02-09 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （1）
2023年10月初推出的Kinnex全长RNA建库试剂盒，能将5个转录本串联成一条测序read，充分利用其读长长的优势，提高测序通量，配合Revio系统一起使用，使得对全长转录本进行定量变得更为实际。 Iso-Seq 方法可对整个 cDNA 分子（长达 10 kb 或更长）进行测序，无需进行生物信息学转录本组装，因此可以对批量（bulk）和单细胞转录本组中的新基因和异构体进行表征，并进一步：鉴定可变剪接 $ isoseq refine human_80K.IsoSeqX_bc10_5p--IsoSeqX_3p.bam IsoSeq_v2_primers_12.fasta human_80K.flnc.bam （C）小于10bp以内的gaps，gaps的数量没有上限。 IsoSeqX_3p.bamUHRR.IsoSeqX_bc08_5p--IsoSeqX_3p.bamUHRR.IsoSeqX_bc09_5p--IsoSeqX_3p.bamUHRR.IsoSeqX_bc10
18.4K21编辑于 2024-01-23 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | ONT Direct RNA测序 (DRS) 技术原理、数据分析和应用
ONT cDNA-PCR，基于ONT三代测序平台的cDNA-PCR建库测序流程也可以检测全长转录本，而且适用于单细胞全长转录组测序。同样使用模板置换反转录，PCR扩增来制备全长转录本文库（图5）。 根据电流的大小及电流大小的变化情况，通过 “ 递归神经网络（Recurrent Neural Network）”的复杂算法对碱基进行判读，即可计算获得相应碱基的类型，同时获得碱基修饰信息（图1，图10） 最新的版本为v.2.1，更新于2021年10月09号。 挪威卑尔根大学（University of Bergen）Eivind Valen 教授团队于2019年10月25号，在RNA上发表了题目为tailfindr: alignment-free poly( 这种尴尬的局面，在2011 年10月16号，由芝加哥大学 何川 教授团队率先打破。
5.6K22编辑于 2025-07-17 - 来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（8）| 三代全长转录本该如何鉴定？
全长转录本的分子标记：引物与Poly(A)尾 李老师首先回顾了全长转录组测序的建库基础：“无论是PacBio的Iso-Seq，还是ONT的cDNA-PCR建库流程，其核心都是利用真核生物成熟mRNA特有的 正是这些独特的分子标记——两端的引物序列和末端的poly(A)尾——成为了我们鉴定全长转录本的关键“身份证”。通过识别并利用这些特征，我们才能有效地筛选出完整的、高质量的全长转录本序列。 工具，通过识别序列双端引物以及poly(A)尾序列来鉴定和提取全长转录本。” 李老师着重指出，“在对ONT原始数据进行质控时，务必保留其双端引物序列，否则pychopper将无法识别全长转录本。有些同学在质控阶段就把引物过滤掉了，导致后续无法进行全长鉴定。” 这一点在实际操作中极易被忽视，却直接影响到全长信息的获取。 全长鉴定的意义：为后续分析奠基 “在我们获得真正意义上的全长序列后，就可以放心地进行下一步的转录本参考基因组比对和表达定量了。”
51000编辑于 2025-07-04 - 来自专栏镁客网
西湖大学成功解析新冠病毒受体ACE2的全长结构
解析ACE2全长结构将有助于理解冠状病毒进入靶细胞的结构基础和功能特征，对发现和优化阻断进入细胞的抑制剂有重要作用。 策划&撰写：温暖 日前，西湖大学周强实验室利用冷冻电镜技术成功解析新冠病毒的受体——ACE2（血管紧张素转化酶2）的全长结构，这也是世界上首次解析出ACE2的全长结构，并且相关研究内容已经于今日凌晨在预印版平台 具体来说，西湖大学这次成功解析新冠病毒的受体ACE2的全场结构整个过程如下： 首先研究人员先要获取ACE2蛋白全长蛋白，但问题在于作为膜蛋白的ACE2难以在体外稳定获得。 清华大学全球健康与传染病研究中心主任张琳琦表示：“解析ACE2全长结构，将有助于理解冠状病毒进入靶细胞的结构基础和功能特征，对发现和优化阻断进入细胞的抑制剂有重要作用。”
79120发布于 2020-02-24 - 来自专栏脑机接口
10-20国际标准导联系统
10-20系统简介 10-20系统电极放置法是国际脑电图学会规定的标准电极放置法。额极中点至鼻根的距离和枕点至枕外粗隆的距离各占此连线全长的10％，其余各点均以此连线全长的20％相隔，如下图所示。 额极中点至鼻根的距离和枕点至枕外粗隆的距离各占此连线全长的10％，其余各点均以此连线全长的20％相隔。 T3、T4点与耳前点的距离各占此线全长的10％，其余各点（包括Cz点）均以此连线全长的20％相隔。 Fp1 、Fp2点至额极中点（Fpz ）的距离与O1、O2点至Oz点的距离各占此连线全长的10％，其余各点（包括T3、T4）均以此连线全长的20％相隔。 矢状线由前到后依次为Fpz、Fz、Cz、Pz和Oz，除Fpz与鼻根，Oz与枕外粗隆的距离为矢状线长度的10%外，其余点间距为矢状线长度的 20%；沿着冠状线，从左耳前凹10%处，依次为T3、C3、Cz、
8.1K01发布于 2019-11-25 - 来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （2） -- pigeon
一、Iso-Seq Collapse 在isoseq cluster完成以后，我们首先需要将高质量全长isoforms回贴到参考基因组上，然后进行isoseq collapse。 do-not-collapse-extra-5exons UHRR.mapped.bam UHRR.flnc.bam UHRR.collapsed.gff 二、Pigeon使用方法 Pigeon是一个PacBio转录工具包，包含了用于将全长转录本
3.6K11编辑于 2024-01-26 - 来自专栏量子位
欧洲批准最强粒子对撞机计划，造价210亿欧元，全长100公里，耗资巨大引争议
如果获得足够的资金支持，FCC的建造工作将会在十年内开始，整个建造过程将花费10年，这意味着FCC要到2040年代才能投入运营。
1K30发布于 2020-06-24
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